RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.96■□□□□ 0.95
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ACTB-201ENST00000331789 USP17L21D6R901 530 aa20.95■□□□□ 0.94
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ACTB-201ENST00000331789 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.87■□□□□ 0.93
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ACTB-201ENST00000331789 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
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