RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 STRN4Q9NRL3 753 aa26.02■■□□□ 1.76
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HOXD1-201ENST00000331462 AIDAQ96BJ3 306 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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HOXD1-201ENST00000331462 DISP2A7MBM2 1401 aa25.98■■□□□ 1.75
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HOXD1-201ENST00000331462 SPATA5Q8NB90 893 aa25.98■■□□□ 1.75
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.98■■□□□ 1.75
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HOXD1-201ENST00000331462 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 NAPBQ9H115 298 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 TMX1Q9H3N1 280 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 RCAN1P53805 252 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K12Q12852 859 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD1-201ENST00000331462 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.96■■□□□ 1.75
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HOXD1-201ENST00000331462 CLIC6Q96NY7 704 aa25.96■■□□□ 1.75
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HOXD1-201ENST00000331462 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 SLIT2O94813 1529 aa25.95■■□□□ 1.74
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HOXD1-201ENST00000331462 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.93■■□□□ 1.74
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HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.93■■□□□ 1.74
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HOXD1-201ENST00000331462 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 ISM2Q6H9L7 571 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINC1P01008 464 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 PTPREP23469 700 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 FAM53CQ9NYF3 392 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD1-201ENST00000331462 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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