RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 POLLQ9UGP5 575 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 CPLX1O14810 134 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 LAMB1P07942 1786 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 FDPSP14324 419 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 SENP2Q9HC62 589 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 PDE6BP35913 854 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 GAS2L3Q86XJ1 694 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 MRE11P49959 708 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 GSTO1P78417 241 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 SART3Q15020 963 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 NFXL1Q6ZNB6 911 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa31.4■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 PCP11498 1178 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 FAM173BQ6P4H8 233 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 CTR9Q6PD62 1173 aa31.39■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB43O43298 467 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ELP1O95163 1332 aa31.38■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ESR2Q92731 530 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 NID2Q14112 1375 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 MYH15Q9Y2K3 1946 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC69A6NI79 296 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 C6orf229H3BNL8 230 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH1B1P30837 517 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 STK11IPQ8N1F8 1099 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 GRPEL1Q9HAV7 217 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 PPFIA3O75145 1194 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 CDKL5O76039 1030 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 FGRP09769 529 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 FOSBP53539 338 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A7Q9Y666 1083 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH2A1L162 156 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 USP17L12C9JPN9 530 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 USP17L21D6R901 530 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 WTAPQ15007 396 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 MICU3Q86XE3 530 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
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HOXD8-201ENST00000313173 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 TTC6Q86TZ1 520 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 MASTLQ96GX5 879 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8AA7E2F4 631 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 LDHCP07864 332 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 SBK1Q52WX2 424 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 TMTC2Q8N394 836 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM22K7EJ46 135 aa31.34■■■□□ 2.61
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HOXD8-201ENST00000313173 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.33■■■□□ 2.61
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HOXD8-201ENST00000313173 C8orf76Q96K31 380 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 BAG3O95817 575 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 RCAN1P53805 252 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.32■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa31.32■■■□□ 2.6
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HOXD8-201ENST00000313173 MYL10Q9BUA6 226 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 CERS3Q8IU89 383 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 MPNDQ8N594 471 aa31.3■■■□□ 2.6
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HOXD8-201ENST00000313173 SPATA32Q96LK8 384 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 ORC4O43929 436 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
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HOXD8-201ENST00000313173 NTRK3Q16288 839 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 COA1Q9GZY4 146 aa31.3■■■□□ 2.6
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP45Q9UL16 551 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 TNKSO95271 1327 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 ECM29Q5VYK3 1845 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 SYCE3A1L190 88 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD14BQ5SR56 506 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXD8-201ENST00000313173 NAV1Q8NEY1 1877 aa31.28■■■□□ 2.6
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