RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306666.9

PTGER3-201, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-201ENST00000306666 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 A0A087WWV3 80 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 BECN2A8MW95 431 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CHRNDQ07001 517 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 TAF1P21675 1872 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 PRKAB2O43741 272 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 LIFRP42702 1097 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 KRT40Q6A162 431 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 MYL10Q9BUA6 226 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.43■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 ZPR1O75312 459 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 GNAT2P19087 354 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 NTRK3Q16288 839 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 SARM1Q6SZW1 724 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 LCORLQ8N3X6 602 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 KRT23Q9C075 422 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.42■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 TDO2P48775 406 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 VPS37DQ86XT2 251 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 COL4A1P02462 1669 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CCDC69A6NI79 296 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.41■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CDC25BP30305 580 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 DYNC1I1O14576 645 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 SLC39A14Q15043 492 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 FBXW7Q969H0 707 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 SETDB2Q96T68 719 aa21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 TOMM22Q9NS69 142 aa21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.39■■□□□ 1.02
PTGER3-201ENST00000306666 ZNF202O95125 648 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 CMA1P23946 247 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 TRIM29Q14134 588 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 CHD4Q14839 1912 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 LRMPQ12912 555 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 TRIM37O94972 964 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.38■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 PFKFB1P16118 471 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 STK36Q9NRP7 1315 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.37■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 CYP7A1P22680 504 aa21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 RFC4P35249 363 aa21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.36■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 PPP6R2O75170 966 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 WTAPQ15007 396 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 NYXQ9GZU5 481 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 ABCF2Q9UG63 623 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 IFNAR1P17181 557 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 JMYQ8N9B5 988 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGER3-201ENST00000306666 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms