RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 M0R2C6 588 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 NF2P35240 595 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 TICAM2Q86XR7 235 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 TEPSINQ96N21 525 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 FLT1P17948 1338 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 GPAA1O43292 621 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.86■■□□□ 1.89
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HOXD4-201ENST00000306324 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 FAM227BQ96M60 508 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 HIP1O00291 1037 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 APLP1P51693 650 aa26.85■■□□□ 1.89
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HOXD4-201ENST00000306324 PRKG1Q13976 671 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD4-201ENST00000306324 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.84■■□□□ 1.89
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HOXD4-201ENST00000306324 CSRNP1Q96S65 589 aa26.83■■□□□ 1.89
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HOXD4-201ENST00000306324 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 PALD1Q9ULE6 856 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 FZD1Q9UP38 647 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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HOXD4-201ENST00000306324 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 GNAT2P19087 354 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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HOXD4-201ENST00000306324 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 SIPA1L1O43166 1804 aa26.8■■□□□ 1.88
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HOXD4-201ENST00000306324 MOB2Q70IA6 237 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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HOXD4-201ENST00000306324 DCAF15Q66K64 600 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD4-201ENST00000306324 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 FKBP1BP68106 108 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 MYH8P13535 1937 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 HTRA3P83110 453 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 HUNKP57058 714 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 VPS53Q5VIR6 699 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 TTC6Q86TZ1 520 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 LAMB1P07942 1786 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 FAM196BA6NMK8 535 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 USP17L12C9JPN9 530 aa26.72■■□□□ 1.87
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