RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.11□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 HMGCRP04035 888 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 PTPRAP18433 802 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 PNMA3Q9UL41 463 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 RPTORQ8N122 1335 aa13.1□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 PHF20L1A8MW92 1017 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 NFIAQ12857 509 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 FAM198AQ9UFP1 575 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.09□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 ATRNL1Q5VV63 1379 aa13.08□□□□□ -0.31
USP41-201ENST00000292729 ENTPD3O75355 529 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SYN1P17600 705 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 LRRC24Q50LG9 513 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 KAZALD1Q96I82 304 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SUCLG2Q96I99 432 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 USP40Q9NVE5 1235 aa13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 FGFR2P21802 821 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 MAP3K10Q02779 954 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 IDI2Q9BXS1 227 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 UTYO14607 1347 aa13.07□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PLXNB2O15031 1838 aa13.06□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 DIXDC1Q155Q3 683 aa13.06□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.06□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 POTEB2H3BUK9 544 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SLC5A1P13866 664 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 LPIN2Q92539 896 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 GJD2Q9UKL4 321 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SALL1Q9NSC2 1324 aa13.05□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 TRIM75PA6NK02 468 aa13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PRDX5P30044 214 aa13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 RGS3P49796 1198 aa13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 WDR63Q8IWG1 891 aa13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.04□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 TREML2Q5T2D2 321 aa13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 GUCD1Q96NT3 240 aa13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 PFASO15067 1338 aa13.03□□□□□ -0.32
USP41-201ENST00000292729 SEMA3EO15041 775 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 ZBTB22O15209 634 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 TBC1D12O60347 775 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 COL6A1P12109 1028 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 TRIM32Q13049 653 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 SLF2Q8IX21 1173 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 TRIB2Q92519 343 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 DENND2AQ9ULE3 1009 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.02□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 EYA2O00167 538 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP41-201ENST00000292729 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms