RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.32■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 BECN2A8MW95 431 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.31■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 RAI14Q9P0K7 980 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 SLC39A14Q15043 492 aa22.31■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.31■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 STK36Q9NRP7 1315 aa22.3■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.29■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ZNF202O95125 648 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 CMA1P23946 247 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 CDC25BP30305 580 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 UBE4AQ14139 1066 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 NID2Q14112 1375 aa22.29■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 ERICH2A1L162 156 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 IFNAR1P17181 557 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.162e-8■■■□□ 17
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USP21-201ENST00000289865 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.28■■□□□ 1.16
USP21-201ENST00000289865 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.27■■□□□ 1.16
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USP21-201ENST00000289865 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 GUCY1A2P33402 732 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 JMYQ8N9B5 988 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 MAP3K14Q99558 947 aa22.26■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 PPP6R2O75170 966 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.25■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP21-201ENST00000289865 MTA3Q9BTC8 594 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP21-201ENST00000289865 TMTC2Q8N394 836 aa22.24■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.24■■□□□ 1.15
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USP21-201ENST00000289865 SYKP43405 635 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 SHC4Q6S5L8 630 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.23■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 MMP1P03956 469 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 NBPF11Q86T75 865 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 ESR2Q92731 530 aa22.22■■□□□ 1.15
USP21-201ENST00000289865 C8orf37Q96NL8 207 aa22.22■■□□□ 1.15
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