RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264400.6

RASGEF1B-201, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-201ENST00000264400 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 CHST3Q7LGC8 479 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 TEKT1Q969V4 418 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 LAMB1P07942 1786 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 APOBRQ0VD83 1088 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 TEX11Q8IYF3 940 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 NECAB1Q8N987 351 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 MXD3Q9BW11 206 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1B-201ENST00000264400 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ORC4O43929 436 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 KDM4AO75164 1064 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 C12orf60Q5U649 245 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ESR2Q92731 530 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 YDJCA8MPS7 323 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 INCENPQ9NQS7 918 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 F8W031 263 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 LIFRP42702 1097 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SPON1Q9HCB6 807 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PSME4Q14997 1843 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 USP17L8P0C7I0 530 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 CRKP46108 304 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PDE4BQ07343 736 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 STK3Q13188 491 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 NFKBIBQ15653 356 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 NIM1KQ8IY84 436 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TOMM22Q9NS69 142 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SCN9AQ15858 1988 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 FLT1P17948 1338 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 GJB2P29033 226 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SCRN1Q12765 414 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TMTC2Q8N394 836 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 CYP2D6P10635 497 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SCNN1DP51172 638 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 KLHL34Q8N239 644 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 LY9Q9HBG7 655 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ERICH2A1L162 156 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 BRD1O95696 1058 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 USP40Q9NVE5 1235 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 BCS1LQ9Y276 419 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 COL4A5P29400 1685 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 FOCADQ5VW36 1801 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 SMIM22K7EJ46 135 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 PDCP20941 246 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 RCAN1P53805 252 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-201ENST00000264400 GBP4Q96PP9 640 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms