RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 KIF18AQ8NI77 898 aa23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.39■■□□□ 1.34
VGF-201ENST00000249330 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.39■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.39■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.39■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.39■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ABCF2Q9UG63 623 aa23.39■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 MYH7P12883 1935 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 PFKFB2O60825 505 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 MAP3K12Q12852 859 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 AKT1S1Q96B36 256 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FOSBP53539 338 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 E7EWF7 191 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CCZ1BP86790 482 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 GRAPQ13588 217 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ATL3Q6DD88 541 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CHST3Q7LGC8 479 aa23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 A0A1B0GUL6 1792 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 APPP05067 770 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ST5P78524 1137 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ERO1AQ96HE7 468 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.36■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 GSDMDP57764 484 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 AIDAQ96BJ3 306 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 USP28Q96RU2 1077 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 FSIP1Q8NA03 581 aa23.35■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 KRT222Q8N1A0 295 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ME1P48163 572 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 CRY2Q49AN0 593 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ARMT1Q9H993 441 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 KCND1Q9NSA2 647 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 JAG2Q9Y219 1238 aa23.34■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 MBD4O95243 580 aa23.33■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.33■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VGF-201ENST00000249330 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.33■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 A0A087WWV3 80 aa23.32■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 TAF3Q5VWG9 929 aa23.32■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 RAI14Q9P0K7 980 aa23.32■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 PRKAB2O43741 272 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 CTDNEP1O95476 244 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 APOBRQ0VD83 1088 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 ZNF213O14771 459 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 MSL1Q68DK7 614 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.31■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 ELF2Q15723 593 aa23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 LCORLQ8N3X6 602 aa23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 LAMA4Q16363 1823 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 SLFN14P0C7P3 912 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 CYP7A1P22680 504 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 FBXW7Q969H0 707 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NBPF3Q9H094 633 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 DOCK2Q92608 1830 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.29■■□□□ 1.32
VGF-201ENST00000249330 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.29■■□□□ 1.32
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