RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026125.2

Alyref-201, Transcript of THO complex subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Alyref, Length 3,527 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ift88Q61371 824 aa20.42■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cwc25Q9DBF7 416 aa20.42■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Syde2E9PUP1 1314 aa20.42■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Casz1Q9CWL2 1761 aa20.42■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc20a2Q80UP8 656 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 9230110C19RikQ8CC70 267 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ric8aQ3TIR3 530 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sun3Q5SS91 320 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tc2nQ91XT6 489 aa20.41■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pde1cQ64338 706 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Usp49Q6P9L4 685 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gimap5Q8BWF2 308 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim55G3X8Y1 545 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Hgh1Q8C3I8 393 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Bola3Q8CEI1 110 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Bicdl1A0JNT9 577 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc4a1P04919 929 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Phldb2Q8K1N2 1249 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa20.4■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ppm1eQ80TL0 749 aa20.39■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cdc23Q8BGZ4 597 aa20.39■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Iqcb1Q8BP00 598 aa20.39■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sos2Q02384 1333 aa20.39■□□□□ 0.86
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pik3c2aQ61194 1686 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Abcd1P48410 736 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Vsnl1P62761 191 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sh2b1Q91ZM2 756 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Abl1P00520 1123 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Asap2Q7SIG6 958 aa20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 CrcpO35427 148 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 C87499Q3UX49 493 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Asnsd1Q8BFS9 627 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nek3Q9R0A5 511 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 TnrQ8BYI9 1358 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ercc4Q9QZD4 917 aa20.38■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Myo1aO88329 1043 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cct5P80316 541 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rnf187Q8BFX1 236 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Vps37dQ810I0 261 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Appbp2Q9DAX9 585 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tfcp2Q9ERA0 502 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Col16a1Q8BLX7 1580 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Enc1O35709 589 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nek1P51954 1203 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Eno4Q8C042 619 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Shisa4Q8CA71 197 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trpm3Q5F4S9 1721 aa20.37■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ano2Q8CFW1 1002 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Klhl10Q9D5V2 608 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dpf1Q9QX66 387 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slit3Q9WVB4 1523 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 RictorQ6QI06 1708 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm21969J3QJZ1 289 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tnni2P13412 182 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Arhgef16Q3U5C8 713 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cfap69Q8BH53 942 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ttc12Q8BW49 704 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Def6Q8C2K1 630 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccne2Q9Z238 404 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Myo3bQ1EG27 1305 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 SsbP32067 415 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam177a1Q8BR63 207 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kif2bQ8C0N1 668 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pcdha7Q91Y13 937 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Emilin1Q99K41 1017 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Arfgef2A2A5R2 1792 aa20.36■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sox5P35710 763 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nab2Q61127 525 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nek5Q7TSC3 627 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Krt84Q99M73 603 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm11983V9GXS8 105 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Lrrc1Q80VQ1 524 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cap2Q9CYT6 476 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Wdr64Q9D565 1086 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tulp1Q9Z273 543 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kifc2O08672 792 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 NapgQ9CWZ7 312 aa20.35■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ampd3O08739 766 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sept12Q9D451 317 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cfap45Q9D9U9 551 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rsph10bE9PYQ0 876 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Il7P10168 154 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pde5aQ8CG03 865 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ptpn23Q6PB44 1692 aa20.34■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Atp8b5A3FIN4 1183 aa20.33■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 TsksO54887 585 aa20.33■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa20.33■□□□□ 0.85
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zkscan8Q8BSL0 588 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31 ms