RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
YCT1	YLL055W	CKB1	P43639	278 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YCT1	YLL055W	IOC2	Q12072	812 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YCT1	YLL055W	SOL3	P38858	249 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	YGR273C	P53329	174 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	YEL023C	P39992	682 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.82	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	LDB19	Q12502	818 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	NST1	P53935	1240 aa		6.81	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	JIP4	Q03361	876 aa		6.81	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	PTC4	P38089	393 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	RTG1	P32607	177 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	VHR2	P40041	505 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YCT1	YLL055W	MPH3	P0CE00	602 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	6.77	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	DAN4	P47179	1161 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	AI4	P03878	556 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	PBS2	P08018	668 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	KEX1	P09620	729 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	SEC61	P32915	480 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	FKH1	P40466	484 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	NCR1	Q12200	1170 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YCT1	YLL055W	COX6	P00427	148 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	DSF2	P38213	736 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	YDR090C	Q03193	310 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	RAD54	P32863	898 aa		6.7	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	KIC1	P38692	1080 aa		6.7	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.69	□□□□□ -1.34	not detected
YCT1	YLL055W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	MAM3	Q12296	706 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	LEU3	P08638	886 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	PML39	Q03760	334 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	SLI15	P38283	698 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YCT1	YLL055W	YDL129W	Q07555	291 aa		6.65	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	IES2	P40154	320 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	MID1	P41821	548 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	YJL171C	P46992	396 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	SAP30	P38429	201 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	PEX29	Q03370	554 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	BMT6	Q12291	365 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YCT1	YLL055W	CDC73	Q06697	393 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	MPC54	Q08550	464 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	ORC6	P38826	435 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	DPL1	Q05567	589 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	DIT2	P21595	489 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	CSC1	Q06538	782 aa		6.52	□□□□□ -1.36
YCT1	YLL055W	ARH1	P48360	493 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	NMA111	P53920	997 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	ISU2	Q12056	156 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	PEX21	P50091	288 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	YDR344C	Q05510	147 aa		6.5	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	GLC3	P32775	704 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	LEO1	P38439	464 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	HAP5	Q02516	242 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	TFB4	Q12004	338 aa		6.49	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	RGR1	P19263	1082 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	PRE3	P38624	215 aa		6.48	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	ATF2	P53296	535 aa		6.47	□□□□□ -1.37
YCT1	YLL055W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	AIM7	Q12156	149 aa		6.45	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	SPT23	P35210	1082 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	YPR109W	Q06104	294 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	YRR1	Q12172	810 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	BNI4	P53858	892 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	CLB5	P30283	435 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	TEA1	P47988	759 aa		6.43	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	KIN1	P13185	1064 aa		6.4	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
YCT1	YLL055W	PDR1	P12383	1068 aa		6.4	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	NUD1	P32336	851 aa		6.36	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	RAM1	P22007	431 aa		6.35	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	NPL4	P33755	580 aa		6.34	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	NIS1	P53939	407 aa		6.34	□□□□□ -1.39
YCT1	YLL055W	YPR015C	Q12531	247 aa		6.32	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	STR2	P47164	639 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	ISM1	P48526	1002 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	FPK1	P53739	893 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	YMR196W	Q04336	1088 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	SIT4	P20604	311 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	VRP1	P37370	817 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	BCK2	P33306	851 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
YCT1	YLL055W	KEX2	P13134	814 aa		6.28	□□□□□ -1.4

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.9 ms