RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C ATH1P48016 1211 aa7.55□□□□□ -1.2
SOP4YJL192C YEL023CP39992 682 aa7.54□□□□□ -1.2
SOP4YJL192C NCR1Q12200 1170 aa7.52□□□□□ -1.21
SOP4YJL192C SEC61P32915 480 aa7.51□□□□□ -1.21
SOP4YJL192C DAN4P47179 1161 aa7.51□□□□□ -1.21
SOP4YJL192C GUT1P32190 709 aa7.5□□□□□ -1.21
SOP4YJL192C JIP4Q03361 876 aa7.49□□□□□ -1.21
SOP4YJL192C PTC4P38089 393 aa7.46□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C SOL3P38858 249 aa7.45□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C NST1P53935 1240 aa7.44□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C SAP30P38429 201 aa7.43□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C YDL129WQ07555 291 aa7.4□□□□□ -1.22
SOP4YJL192C PML39Q03760 334 aa7.39□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C YGR273CP53329 174 aa7.37□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C YDR344CQ05510 147 aa7.37□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C MID1P41821 548 aa7.35□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C MPH3P0CE00 602 aa7.34□□□□□ -1.23
SOP4YJL192C AI4P03878 556 aa7.33□□□□□ -1.24
SOP4YJL192C DMA1P38823 416 aa7.29□□□□□ -1.24
SOP4YJL192C VHR2P40041 505 aa7.27□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C KEX1P09620 729 aa7.26□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C PEX29Q03370 554 aa7.26□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C PRE3P38624 215 aa7.25□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C SLI15P38283 698 aa7.24□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C YPR148CQ06523 435 aa7.23□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C BCK2P33306 851 aa7.22□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C MPC54Q08550 464 aa7.22□□□□□ -1.25
SOP4YJL192C IFH1P39520 1085 aa7.21□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C VPS70P47161 811 aa7.21□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C ARH1P48360 493 aa7.19□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.18□□□□□ -1.26not detected
SOP4YJL192C RAD54P32863 898 aa7.16□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C YDR090CQ03193 310 aa7.15□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C CDC73Q06697 393 aa7.15□□□□□ -1.26
SOP4YJL192C HAP5Q02516 242 aa7.14□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C DPL1Q05567 589 aa7.13□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C NMA111P53920 997 aa7.12□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C SPT23P35210 1082 aa7.09□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C VRP1P37370 817 aa7.09□□□□□ -1.27
SOP4YJL192C KIC1P38692 1080 aa7.08□□□□□ -1.28
SOP4YJL192C BNI4P53858 892 aa7.08□□□□□ -1.28
SOP4YJL192C PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SOP4YJL192C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SOP4YJL192C ISU2Q12056 156 aa7.03□□□□□ -1.28
SOP4YJL192C PDR1P12383 1068 aa7.02□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C YPR015CQ12531 247 aa7.02□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C COX6P00427 148 aa7□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C ORC6P38826 435 aa7□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C XDJ1P39102 459 aa7□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C PBS2P08018 668 aa6.99□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C RAM1P22007 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C CKB1P43639 278 aa6.98□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SOP4YJL192C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C YRR1Q12172 810 aa6.95□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C PEX21P50091 288 aa6.94□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C CSC1Q06538 782 aa6.92□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C IES2P40154 320 aa6.91□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C RGA2Q06407 1009 aa6.91□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C TFB4Q12004 338 aa6.91□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C MAM3Q12296 706 aa6.91□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SOP4YJL192C DSF2P38213 736 aa6.89□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C STR2P47164 639 aa6.88□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C RGR1P19263 1082 aa6.87□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C NUD1P32336 851 aa6.87□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C ISM1P48526 1002 aa6.86□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C GYP1Q08484 637 aa6.86□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C YPR109WQ06104 294 aa6.85□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOP4YJL192C SRC1Q03707 834 aa6.83□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C SDH2P21801 266 aa6.81□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-DR4O74302 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-AP0CX57 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-ORP0CX59 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.8□□□□□ -1.32
SOP4YJL192C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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