RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W SET4P42948 560 aa6.49□□□□□ -1.37
NTF2YER009W BCK2P33306 851 aa6.47□□□□□ -1.37
NTF2YER009W PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
NTF2YER009W VPS70P47161 811 aa6.47□□□□□ -1.37
NTF2YER009W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
NTF2YER009W SAM3Q08986 587 aa6.44□□□□□ -1.38
NTF2YER009W CKB1P43639 278 aa6.42□□□□□ -1.38
NTF2YER009W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
NTF2YER009W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
NTF2YER009W ATH1P48016 1211 aa6.39□□□□□ -1.39
NTF2YER009W GYP5Q12344 894 aa6.39□□□□□ -1.39
NTF2YER009W SAP30P38429 201 aa6.38□□□□□ -1.39
NTF2YER009W GUT1P32190 709 aa6.37□□□□□ -1.39
NTF2YER009W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NTF2YER009W DAN4P47179 1161 aa6.35□□□□□ -1.39
NTF2YER009W JIP4Q03361 876 aa6.35□□□□□ -1.39
NTF2YER009W LEU3P08638 886 aa6.34□□□□□ -1.39
NTF2YER009W PRE3P38624 215 aa6.34□□□□□ -1.39
NTF2YER009W YDL129WQ07555 291 aa6.34□□□□□ -1.39
NTF2YER009W ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NTF2YER009W DCW1P36091 449 aa6.33□□□□□ -1.4
NTF2YER009W REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NTF2YER009W PBS2P08018 668 aa6.31□□□□□ -1.4
NTF2YER009W YGR273CP53329 174 aa6.3□□□□□ -1.4
NTF2YER009W HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NTF2YER009W HTA2P04912 132 aa6.29□□□□□ -1.4
NTF2YER009W SOL3P38858 249 aa6.29□□□□□ -1.4
NTF2YER009W DSF2P38213 736 aa6.28□□□□□ -1.4
NTF2YER009W XDJ1P39102 459 aa6.28□□□□□ -1.4
NTF2YER009W VHR2P40041 505 aa6.28□□□□□ -1.4
NTF2YER009W UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
NTF2YER009W LEO1P38439 464 aa6.26□□□□□ -1.41
NTF2YER009W NST1P53935 1240 aa6.26□□□□□ -1.41
NTF2YER009W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
NTF2YER009W COX6P00427 148 aa6.24□□□□□ -1.41
NTF2YER009W RGA2Q06407 1009 aa6.24□□□□□ -1.41
NTF2YER009W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
NTF2YER009W MAM3Q12296 706 aa6.24□□□□□ -1.41
NTF2YER009W KEX1P09620 729 aa6.23□□□□□ -1.41
NTF2YER009W VRP1P37370 817 aa6.23□□□□□ -1.41
NTF2YER009W PTC4P38089 393 aa6.23□□□□□ -1.41
NTF2YER009W YEL023CP39992 682 aa6.23□□□□□ -1.41
NTF2YER009W YDR090CQ03193 310 aa6.23□□□□□ -1.41
NTF2YER009W MPH3P0CE00 602 aa6.21□□□□□ -1.42
NTF2YER009W AI4P03878 556 aa6.2□□□□□ -1.42
NTF2YER009W KIC1P38692 1080 aa6.2□□□□□ -1.42
NTF2YER009W RAD54P32863 898 aa6.19□□□□□ -1.42
NTF2YER009W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.19□□□□□ -1.42not detected
NTF2YER009W RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
NTF2YER009W ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
NTF2YER009W IES2P40154 320 aa6.19□□□□□ -1.42
NTF2YER009W DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
NTF2YER009W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
NTF2YER009W DIT2P21595 489 aa6.15□□□□□ -1.42
NTF2YER009W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
NTF2YER009W SLI15P38283 698 aa6.12□□□□□ -1.43
NTF2YER009W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NTF2YER009W GLC3P32775 704 aa6.1□□□□□ -1.43
NTF2YER009W PML39Q03760 334 aa6.09□□□□□ -1.43
NTF2YER009W ORC6P38826 435 aa6.08□□□□□ -1.44
NTF2YER009W RGA1P39083 1007 aa6.08□□□□□ -1.44
NTF2YER009W YDR344CQ05510 147 aa6.08□□□□□ -1.44
NTF2YER009W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
NTF2YER009W MID1P41821 548 aa6.07□□□□□ -1.44
NTF2YER009W CDC73Q06697 393 aa6.06□□□□□ -1.44
NTF2YER009W AIM7Q12156 149 aa6.06□□□□□ -1.44
NTF2YER009W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NTF2YER009W KIN1P13185 1064 aa6.05□□□□□ -1.44
NTF2YER009W ATF2P53296 535 aa6.05□□□□□ -1.44
NTF2YER009W ARH1P48360 493 aa6.04□□□□□ -1.44
NTF2YER009W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NTF2YER009W PEX29Q03370 554 aa6.02□□□□□ -1.45
NTF2YER009W DPL1Q05567 589 aa6.02□□□□□ -1.45
NTF2YER009W CSC1Q06538 782 aa6.02□□□□□ -1.45
NTF2YER009W MPC54Q08550 464 aa6.02□□□□□ -1.45
NTF2YER009W RGR1P19263 1082 aa6.01□□□□□ -1.45
NTF2YER009W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
NTF2YER009W SRC1Q03707 834 aa6.01□□□□□ -1.45
NTF2YER009W PEX21P50091 288 aa5.99□□□□□ -1.45
NTF2YER009W SPT23P35210 1082 aa5.98□□□□□ -1.45
NTF2YER009W TEA1P47988 759 aa5.98□□□□□ -1.45
NTF2YER009W TFB4Q12004 338 aa5.98□□□□□ -1.45
NTF2YER009W NMA111P53920 997 aa5.97□□□□□ -1.45
NTF2YER009W YPR109WQ06104 294 aa5.97□□□□□ -1.45
NTF2YER009W ISU2Q12056 156 aa5.97□□□□□ -1.45
NTF2YER009W CLB5P30283 435 aa5.96□□□□□ -1.46
NTF2YER009W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
NTF2YER009W YRR1Q12172 810 aa5.94□□□□□ -1.46
NTF2YER009W HAP5Q02516 242 aa5.93□□□□□ -1.46
NTF2YER009W GUA1P38625 525 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
NTF2YER009W DMA2P53924 522 aa5.92□□□□□ -1.46
NTF2YER009W NIS1P53939 407 aa5.9□□□□□ -1.46
NTF2YER009W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NTF2YER009W PDR1P12383 1068 aa5.88□□□□□ -1.47
NTF2YER009W CSN12P47130 423 aa5.88□□□□□ -1.47
NTF2YER009W FPK1P53739 893 aa5.88□□□□□ -1.47
NTF2YER009W BNI4P53858 892 aa5.88□□□□□ -1.47
NTF2YER009W NUD1P32336 851 aa5.86□□□□□ -1.47
NTF2YER009W PTC2P39966 464 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
NTF2YER009W HPC2Q01448 625 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms