RNA–Protein interactions for RNA: YDL062W

YDL062W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YDL062W, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL062WYDL062W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
YDL062WYDL062W DCW1P36091 449 aa5.91□□□□□ -1.46
YDL062WYDL062W YEL023CP39992 682 aa5.91□□□□□ -1.46
YDL062WYDL062W BCK2P33306 851 aa5.89□□□□□ -1.47
YDL062WYDL062W PRE3P38624 215 aa5.87□□□□□ -1.47
YDL062WYDL062W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YDL062WYDL062W MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
YDL062WYDL062W ATH1P48016 1211 aa5.82□□□□□ -1.48
YDL062WYDL062W GUT1P32190 709 aa5.81□□□□□ -1.48
YDL062WYDL062W MIF2P35201 549 aa5.81□□□□□ -1.48
YDL062WYDL062W PTC3P34221 468 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YDL062WYDL062W PML39Q03760 334 aa5.78□□□□□ -1.48
YDL062WYDL062W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W RAM2P29703 316 aa5.75□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W XDJ1P39102 459 aa5.75□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W COQ8P27697 501 aa5.73□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W VRP1P37370 817 aa5.73□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W EDS1P38073 919 aa5.73□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W ARH1P48360 493 aa5.72□□□□□ -1.49
YDL062WYDL062W AI4P03878 556 aa5.71□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W PEX29Q03370 554 aa5.7□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W MPH3P0CE00 602 aa5.69□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W NST1P53935 1240 aa5.69□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W SPT23P35210 1082 aa5.67□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W MID1P41821 548 aa5.66□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W YDR344CQ05510 147 aa5.66□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W SOL3P38858 249 aa5.65□□□□□ -1.5
YDL062WYDL062W HAP5Q02516 242 aa5.64□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W BNI4P53858 892 aa5.62□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W YGR273CP53329 174 aa5.61□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W PTC2P39966 464 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YDL062WYDL062W ILV3P39522 585 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YDL062WYDL062W MPC54Q08550 464 aa5.57□□□□□ -1.52
YDL062WYDL062W SLI15P38283 698 aa5.53□□□□□ -1.52
YDL062WYDL062W NMA111P53920 997 aa5.53□□□□□ -1.52
YDL062WYDL062W DPL1Q05567 589 aa5.53□□□□□ -1.52
YDL062WYDL062W KEX1P09620 729 aa5.48□□□□□ -1.53
YDL062WYDL062W ISU2Q12056 156 aa5.48□□□□□ -1.53
YDL062WYDL062W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W SRC1Q03707 834 aa5.44□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W GYP1Q08484 637 aa5.42□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W RAM1P22007 431 aa5.41□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W SAS4Q04003 481 aa5.41□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W IFH1P39520 1085 aa5.4□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W CDC73Q06697 393 aa5.4□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W YPR015CQ12531 247 aa5.4□□□□□ -1.54
YDL062WYDL062W RAD54P32863 898 aa5.39□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W UBP14P38237 781 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W AMS1P22855 1083 aa5.38□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W VHR2P40041 505 aa5.38□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.36□□□□□ -1.55not detected
YDL062WYDL062W RAS1P01119 309 aa5.35□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W YEL077CQ3E7X8 1277 aa5.35□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W TRK1P12685 1235 aa5.34□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W KIC1P38692 1080 aa5.34□□□□□ -1.55
YDL062WYDL062W PDR1P12383 1068 aa5.33□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W PEX21P50091 288 aa5.32□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W RGA1P39083 1007 aa5.29□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W CSC1Q06538 782 aa5.29□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W TFB4Q12004 338 aa5.29□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W YDR090CQ03193 310 aa5.28□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W RGA2Q06407 1009 aa5.28□□□□□ -1.56
YDL062WYDL062W PRT1P06103 763 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W SDH2P21801 266 aa5.27□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W REF2P42073 533 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W YPR148CQ06523 435 aa5.26□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W YRR1Q12172 810 aa5.26□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W ERG12P07277 443 aa5.24□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W NPL4P33755 580 aa5.24□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W NUD1P32336 851 aa5.22□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W STR2P47164 639 aa5.22□□□□□ -1.57
YDL062WYDL062W ISM1P48526 1002 aa5.2□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W ORC6P38826 435 aa5.19□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W COX6P00427 148 aa5.18□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W GCR2Q01722 534 aa5.18□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W PAT1P25644 796 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W GCD11P32481 527 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W BRE2P43132 505 aa5.16□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W VPS70P47161 811 aa5.16□□□□□ -1.58
YDL062WYDL062W MVP1P40959 511 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W CST6P40535 587 aa5.13□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W YPL062WQ02781 134 aa5.13□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W LAM6Q08001 693 aa5.13□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-DR4O74302 440 aa5.12□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-AP0CX57 440 aa5.12□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-PR1P0CX58 440 aa5.12□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-ORP0CX59 440 aa5.12□□□□□ -1.59
YDL062WYDL062W TY1A-PR2P0CX60 440 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms