RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639560.1

TNNT3-215, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

TSL 5

Gene TNNT3, Length 878 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-215ENST00000639560 KDM6BO15054 1643 aa20.99■□□□□ 0.95
TNNT3-215ENST00000639560 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
TNNT3-215ENST00000639560 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.94■□□□□ 0.94
TNNT3-215ENST00000639560 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.92■□□□□ 0.94
TNNT3-215ENST00000639560 JPH4Q96JJ6 628 aa20.91■□□□□ 0.94
TNNT3-215ENST00000639560 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.89■□□□□ 0.94
TNNT3-215ENST00000639560 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
TNNT3-215ENST00000639560 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.86■□□□□ 0.93
TNNT3-215ENST00000639560 TOP2BQ02880 1626 aa20.85■□□□□ 0.93
TNNT3-215ENST00000639560 TSPOAP1O95153 1857 aa20.82■□□□□ 0.92
TNNT3-215ENST00000639560 ADGRL1O94910 1474 aa20.77■□□□□ 0.92
TNNT3-215ENST00000639560 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.72■□□□□ 0.91
TNNT3-215ENST00000639560 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TNNT3-215ENST00000639560 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.66■□□□□ 0.9
TNNT3-215ENST00000639560 GLI2P10070 1586 aa20.63■□□□□ 0.89
TNNT3-215ENST00000639560 ABCC2Q92887 1545 aa20.6■□□□□ 0.89
TNNT3-215ENST00000639560 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNNT3-215ENST00000639560 ASXL2Q76L83 1435 aa20.59■□□□□ 0.89
TNNT3-215ENST00000639560 PTPRGP23470 1445 aa20.58■□□□□ 0.88
TNNT3-215ENST00000639560 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.57■□□□□ 0.88
TNNT3-215ENST00000639560 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.5■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 CUL7Q14999 1698 aa20.5■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.49■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.49■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 IGF1RP08069 1367 aa20.48■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.46■□□□□ 0.87
TNNT3-215ENST00000639560 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
TNNT3-215ENST00000639560 FBXO41Q8TF61 875 aa20.44■□□□□ 0.86
TNNT3-215ENST00000639560 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TNNT3-215ENST00000639560 UACAQ9BZF9 1416 aa20.42■□□□□ 0.86
TNNT3-215ENST00000639560 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.4■□□□□ 0.86
TNNT3-215ENST00000639560 KIF27Q86VH2 1401 aa20.39■□□□□ 0.85
TNNT3-215ENST00000639560 IQGAP2Q13576 1575 aa20.37■□□□□ 0.85
TNNT3-215ENST00000639560 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TNNT3-215ENST00000639560 DISP1Q96F81 1524 aa20.35■□□□□ 0.85
TNNT3-215ENST00000639560 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.32■□□□□ 0.84
TNNT3-215ENST00000639560 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.29■□□□□ 0.84
TNNT3-215ENST00000639560 KIF21BO75037 1637 aa20.27■□□□□ 0.83
TNNT3-215ENST00000639560 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.25■□□□□ 0.83
TNNT3-215ENST00000639560 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.23■□□□□ 0.83
TNNT3-215ENST00000639560 KIAA0556O60303 1618 aa20.21■□□□□ 0.83
TNNT3-215ENST00000639560 CD109Q6YHK3 1445 aa20.2■□□□□ 0.82
TNNT3-215ENST00000639560 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.2■□□□□ 0.82
TNNT3-215ENST00000639560 PTPRMP28827 1452 aa20.17■□□□□ 0.82
TNNT3-215ENST00000639560 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.15■□□□□ 0.82
TNNT3-215ENST00000639560 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.12■□□□□ 0.81
TNNT3-215ENST00000639560 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TNNT3-215ENST00000639560 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
TNNT3-215ENST00000639560 ABCA8O94911 1581 aa20.08■□□□□ 0.8
TNNT3-215ENST00000639560 KCNH8Q96L42 1107 aa20.07■□□□□ 0.8
TNNT3-215ENST00000639560 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.06■□□□□ 0.8
TNNT3-215ENST00000639560 MADDQ8WXG6 1647 aa20.02■□□□□ 0.8
TNNT3-215ENST00000639560 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.02■□□□□ 0.79
TNNT3-215ENST00000639560 GOLGA3Q08378 1498 aa19.96■□□□□ 0.79
TNNT3-215ENST00000639560 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.95■□□□□ 0.79
TNNT3-215ENST00000639560 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.95■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.94■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.94■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 RAPGEF3O95398 923 aa19.93■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 ILDR2Q71H61 639 aa19.91■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 HSPA2P54652 639 aa19.9■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 NEO1Q92859 1461 aa19.9■□□□□ 0.78
TNNT3-215ENST00000639560 CERKQ8TCT0 537 aa19.89■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.88■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 ATP10BO94823 1461 aa19.88■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 SOCS7O14512 581 aa19.88■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.85■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 ARID3CA6NKF2 412 aa19.85■□□□□ 0.77
TNNT3-215ENST00000639560 RICTORQ6R327 1708 aa19.77■□□□□ 0.76
TNNT3-215ENST00000639560 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.76■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 FANCAO15360 1455 aa19.74■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.74■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.74■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.73■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.73■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.72■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.72■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 PRXQ9BXM0 1461 aa19.72■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 AKNAQ7Z591 1439 aa19.71■□□□□ 0.75
TNNT3-215ENST00000639560 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.7■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 P3H3Q8IVL6 736 aa19.69■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.69■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.68■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.68■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.67■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 SAMD9Q5K651 1589 aa19.66■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.66■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.65■□□□□ 0.74
TNNT3-215ENST00000639560 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.62■□□□□ 0.73
TNNT3-215ENST00000639560 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
TNNT3-215ENST00000639560 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
TNNT3-215ENST00000639560 STRCQ7RTU9 1775 aa19.62■□□□□ 0.73
TNNT3-215ENST00000639560 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms