RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638985.1

FTX-216, Transcript of FTX transcript, XIST regulator, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FTX, Length 1,367 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTX-216ENST00000638985 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.47■■□□□ 1.35
FTX-216ENST00000638985 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FTX-216ENST00000638985 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.45■■□□□ 1.34
FTX-216ENST00000638985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.44■■□□□ 1.34
FTX-216ENST00000638985 SHROOM2Q13796 1616 aa23.43■■□□□ 1.34
FTX-216ENST00000638985 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.39■■□□□ 1.33
FTX-216ENST00000638985 PRXQ9BXM0 1461 aa23.36■■□□□ 1.33
FTX-216ENST00000638985 EEA1Q15075 1411 aa23.31■■□□□ 1.32
FTX-216ENST00000638985 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
FTX-216ENST00000638985 IQGAP2Q13576 1575 aa23.26■■□□□ 1.31
FTX-216ENST00000638985 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
FTX-216ENST00000638985 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 PTPRGP23470 1445 aa23.18■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.17■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 DISP1Q96F81 1524 aa23.16■■□□□ 1.3
FTX-216ENST00000638985 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
FTX-216ENST00000638985 GOLGA3Q08378 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
FTX-216ENST00000638985 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.04■■□□□ 1.28
FTX-216ENST00000638985 KIAA0556O60303 1618 aa23.03■■□□□ 1.28
FTX-216ENST00000638985 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.02■■□□□ 1.28
FTX-216ENST00000638985 KIF21BO75037 1637 aa23.01■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.01■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 UACAQ9BZF9 1416 aa23■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 P3H3Q8IVL6 736 aa22.99■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
FTX-216ENST00000638985 ABCC2Q92887 1545 aa22.93■■□□□ 1.26
FTX-216ENST00000638985 MAPKBP1O60336 1514 aa22.89■■□□□ 1.26
FTX-216ENST00000638985 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.89■■□□□ 1.26
FTX-216ENST00000638985 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.88■■□□□ 1.25
FTX-216ENST00000638985 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.85■■□□□ 1.25
FTX-216ENST00000638985 SAMD9Q5K651 1589 aa22.85■■□□□ 1.25
FTX-216ENST00000638985 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.84■■□□□ 1.25
FTX-216ENST00000638985 ASXL2Q76L83 1435 aa22.82■■□□□ 1.24
FTX-216ENST00000638985 ABCA8O94911 1581 aa22.81■■□□□ 1.24
FTX-216ENST00000638985 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.81■■□□□ 1.24
FTX-216ENST00000638985 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.75■■□□□ 1.23
FTX-216ENST00000638985 ARID3CA6NKF2 412 aa22.75■■□□□ 1.23
FTX-216ENST00000638985 DIP2BQ9P265 1576 aa22.74■■□□□ 1.23
FTX-216ENST00000638985 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FTX-216ENST00000638985 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.69■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.69■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 ATP10BO94823 1461 aa22.68■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.66■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 KCNH8Q96L42 1107 aa22.65■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.64■■□□□ 1.22
FTX-216ENST00000638985 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
FTX-216ENST00000638985 GLI2P10070 1586 aa22.62■■□□□ 1.21
FTX-216ENST00000638985 FMN1Q68DA7 1419 aa22.61■■□□□ 1.21
FTX-216ENST00000638985 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
FTX-216ENST00000638985 CLIP1P30622 1438 aa22.56■■□□□ 1.2
FTX-216ENST00000638985 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.53■■□□□ 1.2
FTX-216ENST00000638985 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.53■■□□□ 1.2
FTX-216ENST00000638985 CD109Q6YHK3 1445 aa22.5■■□□□ 1.19
FTX-216ENST00000638985 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.47■■□□□ 1.19
FTX-216ENST00000638985 TSPOAP1O95153 1857 aa22.46■■□□□ 1.19
FTX-216ENST00000638985 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.44■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 CEP162Q5TB80 1403 aa22.43■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.43■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 HECW1Q76N89 1606 aa22.42■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.42■■□□□ 1.18
FTX-216ENST00000638985 KDM6BO15054 1643 aa22.39■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.38■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.35■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.33■■□□□ 1.17
FTX-216ENST00000638985 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
FTX-216ENST00000638985 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
FTX-216ENST00000638985 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 52.5
FTX-216ENST00000638985 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
FTX-216ENST00000638985 NEO1Q92859 1461 aa22.24■■□□□ 1.15
FTX-216ENST00000638985 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.23■■□□□ 1.15
FTX-216ENST00000638985 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.23■■□□□ 1.15
FTX-216ENST00000638985 PLCH2O75038 1416 aa22.22■■□□□ 1.15
FTX-216ENST00000638985 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
FTX-216ENST00000638985 RAPGEF3O95398 923 aa22.2■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 FANCAO15360 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 AKNAQ7Z591 1439 aa22.19■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.17■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 KIF14Q15058 1648 aa22.17■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.15■■□□□ 1.14
FTX-216ENST00000638985 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
FTX-216ENST00000638985 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FTX-216ENST00000638985 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.09■■□□□ 1.13
FTX-216ENST00000638985 ADGRL1O94910 1474 aa22.07■■□□□ 1.12
FTX-216ENST00000638985 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
FTX-216ENST00000638985 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.06■■□□□ 1.12
FTX-216ENST00000638985 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FTX-216ENST00000638985 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.05■■□□□ 1.12
FTX-216ENST00000638985 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms