RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 EEA1Q15075 1411 aa28.66■■■□□ 2.18
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CLN6-218ENST00000637223 NUP160Q12769 1436 aa28.61■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 CEP170Q5SW79 1584 aa28.6■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 PRXQ9BXM0 1461 aa28.56■■■□□ 2.16
CLN6-218ENST00000637223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.41■■■□□ 2.14
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CLN6-218ENST00000637223 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.34■■■□□ 2.13
CLN6-218ENST00000637223 KIF21BO75037 1637 aa28.33■■■□□ 2.13
CLN6-218ENST00000637223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.33■■■□□ 2.12
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CLN6-218ENST00000637223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.11■■■□□ 2.09
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CLN6-218ENST00000637223 KIAA0556O60303 1618 aa28.03■■■□□ 2.08
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CLN6-218ENST00000637223 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.01■■■□□ 2.07
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CLN6-218ENST00000637223 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.94■■■□□ 2.06
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CLN6-218ENST00000637223 ARID3CA6NKF2 412 aa27.6■■■□□ 2.01
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CLN6-218ENST00000637223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.38■■□□□ 1.97
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CLN6-218ENST00000637223 KCNH8Q96L42 1107 aa27.32■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 GLI2P10070 1586 aa27.31■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.3■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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CLN6-218ENST00000637223 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.28■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.27■■□□□ 1.96
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CLN6-218ENST00000637223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.94
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CLN6-218ENST00000637223 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.97■■□□□ 1.91
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CLN6-218ENST00000637223 NCOA2Q15596 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.86■■□□□ 1.89
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