RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635774.1

ATP6AP2-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene ATP6AP2, Length 1,995 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP2-209ENST00000635774 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ATP6AP2-209ENST00000635774 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP2-209ENST00000635774 ARAP1Q96P48 1450 aa24■■□□□ 1.43
ATP6AP2-209ENST00000635774 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP2-209ENST00000635774 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP2-209ENST00000635774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 P3H3Q8IVL6 736 aa23.94■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 FBLN2P98095 1184 aa23.94■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 GRIN2AQ12879 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ATP6AP2-209ENST00000635774 SYNJ2O15056 1496 aa23.89■■□□□ 1.41
ATP6AP2-209ENST00000635774 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.83■■□□□ 1.4
ATP6AP2-209ENST00000635774 IQGAP2Q13576 1575 aa23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP2-209ENST00000635774 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.79■■□□□ 1.4
ATP6AP2-209ENST00000635774 APLP2Q06481 763 aa23.78■■□□□ 1.4
ATP6AP2-209ENST00000635774 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP2-209ENST00000635774 CEP170Q5SW79 1584 aa23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP2-209ENST00000635774 SAMD9Q5K651 1589 aa23.75■■□□□ 1.39
ATP6AP2-209ENST00000635774 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
ATP6AP2-209ENST00000635774 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ATP6AP2-209ENST00000635774 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.67■■□□□ 1.38
ATP6AP2-209ENST00000635774 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ATP6AP2-209ENST00000635774 CHD1O14646 1710 aa23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP2-209ENST00000635774 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ATP6AP2-209ENST00000635774 FMN1Q68DA7 1419 aa23.63■■□□□ 1.37
ATP6AP2-209ENST00000635774 JPH4Q96JJ6 628 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP2-209ENST00000635774 DISP1Q96F81 1524 aa23.61■■□□□ 1.37
ATP6AP2-209ENST00000635774 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.59■■□□□ 1.37
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ATP6AP2-209ENST00000635774 KIAA0556O60303 1618 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP2-209ENST00000635774 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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ATP6AP2-209ENST00000635774 MAP3K1Q13233 1512 aa23.49■■□□□ 1.35
ATP6AP2-209ENST00000635774 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
ATP6AP2-209ENST00000635774 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP2-209ENST00000635774 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP2-209ENST00000635774 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP2-209ENST00000635774 ARID3CA6NKF2 412 aa23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP2-209ENST00000635774 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP2-209ENST00000635774 HECW1Q76N89 1606 aa23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP2-209ENST00000635774 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP2-209ENST00000635774 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP2-209ENST00000635774 SHROOM2Q13796 1616 aa23.35■■□□□ 1.33
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ATP6AP2-209ENST00000635774 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
ATP6AP2-209ENST00000635774 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP2-209ENST00000635774 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP2-209ENST00000635774 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP2-209ENST00000635774 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP2-209ENST00000635774 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.31■■□□□ 1.32
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ATP6AP2-209ENST00000635774 OSCARQ8IYS5 282 aa23.24■■□□□ 1.31
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ATP6AP2-209ENST00000635774 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.21■■□□□ 1.31
ATP6AP2-209ENST00000635774 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.2■■□□□ 1.3
ATP6AP2-209ENST00000635774 NCOA2Q15596 1464 aa23.18■■□□□ 1.3
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ATP6AP2-209ENST00000635774 ITGAEP38570 1179 aa23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 UACAQ9BZF9 1416 aa23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 ATP10BO94823 1461 aa23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 ARHGEF11O15085 1522 aa23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP2-209ENST00000635774 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP2-209ENST00000635774 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP2-209ENST00000635774 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP2-209ENST00000635774 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP2-209ENST00000635774 ABCC2Q92887 1545 aa23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP2-209ENST00000635774 KIF14Q15058 1648 aa22.98■■□□□ 1.27
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ATP6AP2-209ENST00000635774 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP2-209ENST00000635774 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP2-209ENST00000635774 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP2-209ENST00000635774 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.91■■□□□ 1.26
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ATP6AP2-209ENST00000635774 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.89■■□□□ 1.25
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ATP6AP2-209ENST00000635774 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 PTPRKQ15262 1439 aa22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 KCNH8Q96L42 1107 aa22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP2-209ENST00000635774 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP2-209ENST00000635774 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
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