RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635747.1

CLN6-210, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-210ENST00000635747 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.2■■■□□ 2.58
CLN6-210ENST00000635747 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CLN6-210ENST00000635747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.16■■■□□ 2.58
CLN6-210ENST00000635747 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.16■■■□□ 2.58
CLN6-210ENST00000635747 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.99■■■□□ 2.55
CLN6-210ENST00000635747 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.89■■■□□ 2.53
CLN6-210ENST00000635747 IQGAP2Q13576 1575 aa30.88■■■□□ 2.53
CLN6-210ENST00000635747 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
CLN6-210ENST00000635747 PTPRGP23470 1445 aa30.81■■■□□ 2.52
CLN6-210ENST00000635747 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN6-210ENST00000635747 PRXQ9BXM0 1461 aa30.76■■■□□ 2.51
CLN6-210ENST00000635747 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.72■■■□□ 2.51
CLN6-210ENST00000635747 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.7■■■□□ 2.51
CLN6-210ENST00000635747 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.69■■■□□ 2.5
CLN6-210ENST00000635747 DISP1Q96F81 1524 aa30.68■■■□□ 2.5
CLN6-210ENST00000635747 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CLN6-210ENST00000635747 EEA1Q15075 1411 aa30.66■■■□□ 2.5
CLN6-210ENST00000635747 MAPKBP1O60336 1514 aa30.64■■■□□ 2.5
CLN6-210ENST00000635747 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.58■■■□□ 2.49
CLN6-210ENST00000635747 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.57■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 GOLGA3Q08378 1498 aa30.57■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 UACAQ9BZF9 1416 aa30.56■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.56■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.56■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 KIAA0556O60303 1618 aa30.55■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 ABCC2Q92887 1545 aa30.54■■■□□ 2.48
CLN6-210ENST00000635747 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.5■■■□□ 2.47
CLN6-210ENST00000635747 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.48■■■□□ 2.47
CLN6-210ENST00000635747 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CLN6-210ENST00000635747 DIP2BQ9P265 1576 aa30.43■■■□□ 2.46
CLN6-210ENST00000635747 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.42■■■□□ 2.46
CLN6-210ENST00000635747 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.4■■■□□ 2.46
CLN6-210ENST00000635747 ASXL2Q76L83 1435 aa30.39■■■□□ 2.45
CLN6-210ENST00000635747 P3H3Q8IVL6 736 aa30.28■■■□□ 2.44
CLN6-210ENST00000635747 KIF21BO75037 1637 aa30.27■■■□□ 2.44
CLN6-210ENST00000635747 ABCA8O94911 1581 aa30.26■■■□□ 2.43
CLN6-210ENST00000635747 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CLN6-210ENST00000635747 GLI2P10070 1586 aa30.24■■■□□ 2.43
CLN6-210ENST00000635747 SAMD9Q5K651 1589 aa30.21■■■□□ 2.43
CLN6-210ENST00000635747 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CLN6-210ENST00000635747 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.17■■■□□ 2.42
CLN6-210ENST00000635747 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CLN6-210ENST00000635747 TSPOAP1O95153 1857 aa30.14■■■□□ 2.42
CLN6-210ENST00000635747 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CLN6-210ENST00000635747 KDM6BO15054 1643 aa30.07■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.07■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 KCNH8Q96L42 1107 aa30.06■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 ATP10BO94823 1461 aa30.06■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.05■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.04■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.04■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.03■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 ARID3CA6NKF2 412 aa30.02■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.02■■■□□ 2.4
CLN6-210ENST00000635747 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CLN6-210ENST00000635747 CD109Q6YHK3 1445 aa29.97■■■□□ 2.39
CLN6-210ENST00000635747 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CLN6-210ENST00000635747 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CLN6-210ENST00000635747 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CLN6-210ENST00000635747 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CLN6-210ENST00000635747 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN6-210ENST00000635747 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.91■■■□□ 2.38
CLN6-210ENST00000635747 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.86■■■□□ 2.37
CLN6-210ENST00000635747 FMN1Q68DA7 1419 aa29.86■■■□□ 2.37
CLN6-210ENST00000635747 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.83■■■□□ 2.37
CLN6-210ENST00000635747 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CLN6-210ENST00000635747 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.77■■■□□ 2.36
CLN6-210ENST00000635747 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.76■■■□□ 2.35
CLN6-210ENST00000635747 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CLN6-210ENST00000635747 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CLN6-210ENST00000635747 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.67■■■□□ 2.34
CLN6-210ENST00000635747 HECW1Q76N89 1606 aa29.67■■■□□ 2.34
CLN6-210ENST00000635747 NEO1Q92859 1461 aa29.65■■■□□ 2.34
CLN6-210ENST00000635747 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CLN6-210ENST00000635747 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.62■■■□□ 2.33
CLN6-210ENST00000635747 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.322e-6■■■■□ 19.9
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CLN6-210ENST00000635747 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.54■■■□□ 2.32
CLN6-210ENST00000635747 FANCAO15360 1455 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 RAPGEF3O95398 923 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 AKNAQ7Z591 1439 aa29.48■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.48■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.47■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 PLCH2O75038 1416 aa29.46■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 ADGRL1O94910 1474 aa29.46■■■□□ 2.31
CLN6-210ENST00000635747 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CLN6-210ENST00000635747 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.43■■■□□ 2.3
CLN6-210ENST00000635747 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CLN6-210ENST00000635747 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.4■■■□□ 2.3
CLN6-210ENST00000635747 KIF14Q15058 1648 aa29.4■■■□□ 2.3
CLN6-210ENST00000635747 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.35■■■□□ 2.29
CLN6-210ENST00000635747 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.33■■■□□ 2.29
CLN6-210ENST00000635747 CEP162Q5TB80 1403 aa29.31■■■□□ 2.28
CLN6-210ENST00000635747 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.31■■■□□ 2.28
CLN6-210ENST00000635747 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.3■■■□□ 2.28
CLN6-210ENST00000635747 RICTORQ6R327 1708 aa29.28■■■□□ 2.28
CLN6-210ENST00000635747 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.25■■■□□ 2.27
CLN6-210ENST00000635747 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.25■■■□□ 2.27
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