RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635178.1

N4BP2L1-211, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene N4BP2L1, Length 2,009 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2L1-211ENST00000635178 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
N4BP2L1-211ENST00000635178 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
N4BP2L1-211ENST00000635178 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.47■■□□□ 1.19
N4BP2L1-211ENST00000635178 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.43■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.43■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.42■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 SAMD9Q5K651 1589 aa22.4■■□□□ 1.18
N4BP2L1-211ENST00000635178 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.38■■□□□ 1.17
N4BP2L1-211ENST00000635178 PBRM1Q86U86 1689 aa22.35■■□□□ 1.17
N4BP2L1-211ENST00000635178 FMN1Q68DA7 1419 aa22.33■■□□□ 1.17
N4BP2L1-211ENST00000635178 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.29■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
N4BP2L1-211ENST00000635178 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.25■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 ADAMTS12P58397 1594 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 WDR62O43379 1518 aa22.21■■□□□ 1.15
N4BP2L1-211ENST00000635178 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.18■■□□□ 1.14
N4BP2L1-211ENST00000635178 GRIN2BQ13224 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
N4BP2L1-211ENST00000635178 IFT140Q96RY7 1462 aa22.16■■□□□ 1.14
N4BP2L1-211ENST00000635178 IQGAP2Q13576 1575 aa22.14■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 P3H3Q8IVL6 736 aa22.12■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.11■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.09■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
N4BP2L1-211ENST00000635178 HECW1Q76N89 1606 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP2L1-211ENST00000635178 MAPKBP1O60336 1514 aa22.06■■□□□ 1.12
N4BP2L1-211ENST00000635178 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.06■■□□□ 1.12
N4BP2L1-211ENST00000635178 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.06■■□□□ 1.12
N4BP2L1-211ENST00000635178 ARHGEF11O15085 1522 aa22.03■■□□□ 1.12
N4BP2L1-211ENST00000635178 MTUS2Q5JR59 1369 aa22■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 NCOA2Q15596 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.97■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
N4BP2L1-211ENST00000635178 ITGAEP38570 1179 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.94■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 KIAA0556O60303 1618 aa21.91■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.91■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 GRIN2AQ12879 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 HFM1A2PYH4 1435 aa21.89■■□□□ 1.1
N4BP2L1-211ENST00000635178 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 ERCC6Q03468 1493 aa21.86■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.85■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 DISP1Q96F81 1524 aa21.85■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.84■■□□□ 1.09
N4BP2L1-211ENST00000635178 AKNAQ7Z591 1439 aa21.82■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 MIA2Q96PC5 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 SYNJ2O15056 1496 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 PTPRKQ15262 1439 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.8■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 UACAQ9BZF9 1416 aa21.79■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 NAIPQ13075 1403 aa21.77■■□□□ 1.08
N4BP2L1-211ENST00000635178 CEP170Q5SW79 1584 aa21.75■■□□□ 1.07
N4BP2L1-211ENST00000635178 NEUROD1Q13562 356 aa21.75■■□□□ 1.07
N4BP2L1-211ENST00000635178 MIER1Q8N108 512 aa21.74■■□□□ 1.07
N4BP2L1-211ENST00000635178 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
N4BP2L1-211ENST00000635178 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
N4BP2L1-211ENST00000635178 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.67■■□□□ 1.06
N4BP2L1-211ENST00000635178 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
N4BP2L1-211ENST00000635178 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.64■■□□□ 1.05
N4BP2L1-211ENST00000635178 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.6■■□□□ 1.05
N4BP2L1-211ENST00000635178 ROCK1Q13464 1354 aa21.6■■□□□ 1.05
N4BP2L1-211ENST00000635178 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.59■■□□□ 1.05
N4BP2L1-211ENST00000635178 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
N4BP2L1-211ENST00000635178 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 DAPK1P53355 1430 aa21.55■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 ABCA8O94911 1581 aa21.54■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 TONSLQ96HA7 1378 aa21.53■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.52■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 KDM6BO15054 1643 aa21.52■■□□□ 1.04
N4BP2L1-211ENST00000635178 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.51■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.51■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.5■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 ABCC5O15440 1437 aa21.49■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.48■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 KIF14Q15058 1648 aa21.46■■□□□ 1.03
N4BP2L1-211ENST00000635178 JPH4Q96JJ6 628 aa21.45■■□□□ 1.02
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