RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PPP4C-214ENST00000627746 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.25■■■■■ 4.03
PPP4C-214ENST00000627746 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP4C-214ENST00000627746 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.11■■■■■ 4.01
PPP4C-214ENST00000627746 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP4C-214ENST00000627746 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PPP4C-214ENST00000627746 IQGAP2Q13576 1575 aa39.81■■■■□ 3.96
PPP4C-214ENST00000627746 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4C-214ENST00000627746 PTPRGP23470 1445 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4C-214ENST00000627746 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP4C-214ENST00000627746 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.94
PPP4C-214ENST00000627746 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.64■■■■□ 3.94
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PPP4C-214ENST00000627746 PRXQ9BXM0 1461 aa39.62■■■■□ 3.93
PPP4C-214ENST00000627746 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.56■■■■□ 3.92
PPP4C-214ENST00000627746 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-214ENST00000627746 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.53■■■■□ 3.92
PPP4C-214ENST00000627746 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.51■■■■□ 3.92
PPP4C-214ENST00000627746 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.48■■■■□ 3.91
PPP4C-214ENST00000627746 MAPKBP1O60336 1514 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-214ENST00000627746 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-214ENST00000627746 KIAA0556O60303 1618 aa39.44■■■■□ 3.9
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.43■■■■□ 3.9
PPP4C-214ENST00000627746 UACAQ9BZF9 1416 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC2Q92887 1545 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-214ENST00000627746 DIP2BQ9P265 1576 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP4C-214ENST00000627746 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4C-214ENST00000627746 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.32■■■■□ 3.88
PPP4C-214ENST00000627746 EEA1Q15075 1411 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-214ENST00000627746 GOLGA3Q08378 1498 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP4C-214ENST00000627746 P3H3Q8IVL6 736 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4C-214ENST00000627746 ASXL2Q76L83 1435 aa39.23■■■■□ 3.87
PPP4C-214ENST00000627746 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.2■■■■□ 3.87
PPP4C-214ENST00000627746 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4C-214ENST00000627746 TSPOAP1O95153 1857 aa39.16■■■■□ 3.86
PPP4C-214ENST00000627746 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
PPP4C-214ENST00000627746 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PPP4C-214ENST00000627746 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.09■■■■□ 3.85
PPP4C-214ENST00000627746 ABCA8O94911 1581 aa39.06■■■■□ 3.84
PPP4C-214ENST00000627746 ARID3CA6NKF2 412 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP4C-214ENST00000627746 KIF21BO75037 1637 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP4C-214ENST00000627746 SAMD9Q5K651 1589 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP4C-214ENST00000627746 GLI2P10070 1586 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4C-214ENST00000627746 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
PPP4C-214ENST00000627746 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP4C-214ENST00000627746 KCNH8Q96L42 1107 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP4C-214ENST00000627746 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
PPP4C-214ENST00000627746 KDM6BO15054 1643 aa38.87■■■■□ 3.81
PPP4C-214ENST00000627746 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
PPP4C-214ENST00000627746 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP4C-214ENST00000627746 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP4C-214ENST00000627746 ATP10BO94823 1461 aa38.8■■■■□ 3.8
PPP4C-214ENST00000627746 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.75■■■■□ 3.79
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PPP4C-214ENST00000627746 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PPP4C-214ENST00000627746 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP4C-214ENST00000627746 CD109Q6YHK3 1445 aa38.64■■■■□ 3.78
PPP4C-214ENST00000627746 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
PPP4C-214ENST00000627746 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.62■■■■□ 3.77
PPP4C-214ENST00000627746 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP4C-214ENST00000627746 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.51■■■■□ 3.76
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-214ENST00000627746 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-214ENST00000627746 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.42■■■■□ 3.74
PPP4C-214ENST00000627746 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.4■■■■□ 3.74
PPP4C-214ENST00000627746 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.38■■■■□ 3.73
PPP4C-214ENST00000627746 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
PPP4C-214ENST00000627746 FMN1Q68DA7 1419 aa38.33■■■■□ 3.73
PPP4C-214ENST00000627746 HECW1Q76N89 1606 aa38.21■■■■□ 3.71
PPP4C-214ENST00000627746 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.21■■■■□ 3.71
PPP4C-214ENST00000627746 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.75e-11■■□□□ 12.7
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PPP4C-214ENST00000627746 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.13■■■■□ 3.69
PPP4C-214ENST00000627746 NEO1Q92859 1461 aa38.13■■■■□ 3.69
PPP4C-214ENST00000627746 ADGRL1O94910 1474 aa38.1■■■■□ 3.69
PPP4C-214ENST00000627746 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.1■■■■□ 3.69
PPP4C-214ENST00000627746 CLIP1P30622 1438 aa38.07■■■■□ 3.69
PPP4C-214ENST00000627746 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
PPP4C-214ENST00000627746 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
PPP4C-214ENST00000627746 FANCAO15360 1455 aa38.02■■■■□ 3.68
PPP4C-214ENST00000627746 AKNAQ7Z591 1439 aa38.01■■■■□ 3.68
PPP4C-214ENST00000627746 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.01■■■■□ 3.68
PPP4C-214ENST00000627746 KIF14Q15058 1648 aa37.97■■■■□ 3.67
PPP4C-214ENST00000627746 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.97■■■■□ 3.67
PPP4C-214ENST00000627746 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
PPP4C-214ENST00000627746 PLCH2O75038 1416 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP4C-214ENST00000627746 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
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PPP4C-214ENST00000627746 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.86■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.85■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 RICTORQ6R327 1708 aa37.85■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.85■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.85■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.83■■■■□ 3.65
PPP4C-214ENST00000627746 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.81■■■■□ 3.64
PPP4C-214ENST00000627746 CEP162Q5TB80 1403 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.74■■■■□ 3.63
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