RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620977.1

KCNK3-202, Transcript of potassium two pore domain channel subfamily K member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNK3, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3-202ENST00000620977 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.33■■■■■ 4.21
KCNK3-202ENST00000620977 WDR62O43379 1518 aa41.27■■■■■ 4.2
KCNK3-202ENST00000620977 TIAM1Q13009 1591 aa41.25■■■■■ 4.19
KCNK3-202ENST00000620977 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
KCNK3-202ENST00000620977 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
KCNK3-202ENST00000620977 PBRM1Q86U86 1689 aa41.19■■■■■ 4.18
KCNK3-202ENST00000620977 IFT140Q96RY7 1462 aa41.17■■■■■ 4.18
KCNK3-202ENST00000620977 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.16■■■■■ 4.18
KCNK3-202ENST00000620977 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
KCNK3-202ENST00000620977 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
KCNK3-202ENST00000620977 P3H3Q8IVL6 736 aa41.11■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.09■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 SAMD9Q5K651 1589 aa41.09■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.08■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.08■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.07■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 GRIN2BQ13224 1484 aa41.07■■■■■ 4.17
KCNK3-202ENST00000620977 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
KCNK3-202ENST00000620977 FMN1Q68DA7 1419 aa41.02■■■■■ 4.16
KCNK3-202ENST00000620977 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.99■■■■■ 4.15
KCNK3-202ENST00000620977 ERCC6Q03468 1493 aa40.97■■■■■ 4.15
KCNK3-202ENST00000620977 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
KCNK3-202ENST00000620977 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
KCNK3-202ENST00000620977 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.92■■■■■ 4.14
KCNK3-202ENST00000620977 IQGAP2Q13576 1575 aa40.8■■■■■ 4.12
KCNK3-202ENST00000620977 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.78■■■■■ 4.12
KCNK3-202ENST00000620977 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
KCNK3-202ENST00000620977 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
KCNK3-202ENST00000620977 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.66■■■■■ 4.1
KCNK3-202ENST00000620977 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.65■■■■■ 4.1
KCNK3-202ENST00000620977 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.63■■■■■ 4.09
KCNK3-202ENST00000620977 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
KCNK3-202ENST00000620977 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.61■■■■■ 4.09
KCNK3-202ENST00000620977 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
KCNK3-202ENST00000620977 GRIN2AQ12879 1464 aa40.6■■■■■ 4.09
KCNK3-202ENST00000620977 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.08
KCNK3-202ENST00000620977 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.51■■■■■ 4.08
KCNK3-202ENST00000620977 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.49■■■■■ 4.07
KCNK3-202ENST00000620977 SYNJ2O15056 1496 aa40.46■■■■■ 4.07
KCNK3-202ENST00000620977 ITGAEP38570 1179 aa40.45■■■■■ 4.07
KCNK3-202ENST00000620977 HECW1Q76N89 1606 aa40.45■■■■■ 4.07
KCNK3-202ENST00000620977 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.44■■■■■ 4.06
KCNK3-202ENST00000620977 DISP1Q96F81 1524 aa40.41■■■■■ 4.06
KCNK3-202ENST00000620977 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.4■■■■■ 4.06
KCNK3-202ENST00000620977 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
KCNK3-202ENST00000620977 KIAA0556O60303 1618 aa40.39■■■■■ 4.06
KCNK3-202ENST00000620977 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.36■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 NCOA2Q15596 1464 aa40.36■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.36■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 ARHGEF11O15085 1522 aa40.33■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
KCNK3-202ENST00000620977 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.32■■■■■ 4.04
KCNK3-202ENST00000620977 CEP170Q5SW79 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
KCNK3-202ENST00000620977 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.28■■■■■ 4.04
KCNK3-202ENST00000620977 NUP160Q12769 1436 aa40.27■■■■■ 4.04
KCNK3-202ENST00000620977 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
KCNK3-202ENST00000620977 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
KCNK3-202ENST00000620977 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.1■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 MAPKBP1O60336 1514 aa40.09■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 FBLN2P98095 1184 aa40.09■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.07■■■■■ 4.01
KCNK3-202ENST00000620977 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
KCNK3-202ENST00000620977 PTPRKQ15262 1439 aa40.05■■■■■ 4
KCNK3-202ENST00000620977 JPH4Q96JJ6 628 aa40.03■■■■■ 4
KCNK3-202ENST00000620977 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.02■■■■■ 4
KCNK3-202ENST00000620977 HFM1A2PYH4 1435 aa39.99■■■■□ 3.99
KCNK3-202ENST00000620977 MIA2Q96PC5 1412 aa39.99■■■■□ 3.99
KCNK3-202ENST00000620977 ARID3CA6NKF2 412 aa39.88■■■■□ 3.98
KCNK3-202ENST00000620977 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.87■■■■□ 3.97
KCNK3-202ENST00000620977 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
KCNK3-202ENST00000620977 NAIPQ13075 1403 aa39.86■■■■□ 3.97
KCNK3-202ENST00000620977 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
KCNK3-202ENST00000620977 AKNAQ7Z591 1439 aa39.77■■■■□ 3.96
KCNK3-202ENST00000620977 ABCA8O94911 1581 aa39.76■■■■□ 3.96
KCNK3-202ENST00000620977 UACAQ9BZF9 1416 aa39.75■■■■□ 3.95
KCNK3-202ENST00000620977 CHD1O14646 1710 aa39.7■■■■□ 3.95
KCNK3-202ENST00000620977 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
KCNK3-202ENST00000620977 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.68■■■■□ 3.94
KCNK3-202ENST00000620977 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.68■■■■□ 3.94
KCNK3-202ENST00000620977 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.68■■■■□ 3.94
KCNK3-202ENST00000620977 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.61■■■■□ 3.93
KCNK3-202ENST00000620977 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 DAPK1P53355 1430 aa39.57■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 SHROOM2Q13796 1616 aa39.56■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 ATP10BO94823 1461 aa39.56■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 ROCK1Q13464 1354 aa39.55■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.54■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.54■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.53■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 ABCC5O15440 1437 aa39.53■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 PTPRGP23470 1445 aa39.53■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 KIF14Q15058 1648 aa39.53■■■■□ 3.92
KCNK3-202ENST00000620977 NEUROD1Q13562 356 aa39.5■■■■□ 3.91
KCNK3-202ENST00000620977 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
KCNK3-202ENST00000620977 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms