RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618673.4

SYTL1-211, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-211ENST00000618673 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SYTL1-211ENST00000618673 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.05■■■□□ 2.72
SYTL1-211ENST00000618673 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
SYTL1-211ENST00000618673 SYNJ2O15056 1496 aa32.01■■■□□ 2.71
SYTL1-211ENST00000618673 GRIN2AQ12879 1464 aa32■■■□□ 2.71
SYTL1-211ENST00000618673 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.98■■■□□ 2.71
SYTL1-211ENST00000618673 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
SYTL1-211ENST00000618673 IQGAP2Q13576 1575 aa31.92■■■□□ 2.7
SYTL1-211ENST00000618673 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SYTL1-211ENST00000618673 SAMD9Q5K651 1589 aa31.9■■■□□ 2.7
SYTL1-211ENST00000618673 APLP2Q06481 763 aa31.89■■■□□ 2.69
SYTL1-211ENST00000618673 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.86■■■□□ 2.69
SYTL1-211ENST00000618673 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.84■■■□□ 2.69
SYTL1-211ENST00000618673 P3H3Q8IVL6 736 aa31.81■■■□□ 2.68
SYTL1-211ENST00000618673 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.78■■■□□ 2.68
SYTL1-211ENST00000618673 CEP170Q5SW79 1584 aa31.78■■■□□ 2.68
SYTL1-211ENST00000618673 NUP160Q12769 1436 aa31.78■■■□□ 2.68
SYTL1-211ENST00000618673 FBLN2P98095 1184 aa31.78■■■□□ 2.68
SYTL1-211ENST00000618673 FMN1Q68DA7 1419 aa31.75■■■□□ 2.67
SYTL1-211ENST00000618673 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
SYTL1-211ENST00000618673 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
SYTL1-211ENST00000618673 MAP3K1Q13233 1512 aa31.69■■■□□ 2.66
SYTL1-211ENST00000618673 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.68■■■□□ 2.66
SYTL1-211ENST00000618673 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.68■■■□□ 2.66
SYTL1-211ENST00000618673 TIAM1Q13009 1591 aa31.61■■■□□ 2.65
SYTL1-211ENST00000618673 KIAA0556O60303 1618 aa31.6■■■□□ 2.65
SYTL1-211ENST00000618673 CHD1O14646 1710 aa31.6■■■□□ 2.65
SYTL1-211ENST00000618673 DISP1Q96F81 1524 aa31.6■■■□□ 2.65
SYTL1-211ENST00000618673 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.55■■■□□ 2.64
SYTL1-211ENST00000618673 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
SYTL1-211ENST00000618673 JPH4Q96JJ6 628 aa31.49■■■□□ 2.63
SYTL1-211ENST00000618673 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
SYTL1-211ENST00000618673 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.47■■■□□ 2.63
SYTL1-211ENST00000618673 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.47■■■□□ 2.63
SYTL1-211ENST00000618673 HECW1Q76N89 1606 aa31.42■■■□□ 2.62
SYTL1-211ENST00000618673 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.37■■■□□ 2.61
SYTL1-211ENST00000618673 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.35■■■□□ 2.61
SYTL1-211ENST00000618673 SHROOM2Q13796 1616 aa31.33■■■□□ 2.61
SYTL1-211ENST00000618673 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
SYTL1-211ENST00000618673 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.29■■■□□ 2.6
SYTL1-211ENST00000618673 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.28■■■□□ 2.6
SYTL1-211ENST00000618673 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
SYTL1-211ENST00000618673 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
SYTL1-211ENST00000618673 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.24■■■□□ 2.59
SYTL1-211ENST00000618673 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.21■■■□□ 2.59
SYTL1-211ENST00000618673 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
SYTL1-211ENST00000618673 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.18■■■□□ 2.58
SYTL1-211ENST00000618673 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SYTL1-211ENST00000618673 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.16■■■□□ 2.58
SYTL1-211ENST00000618673 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.15■■■□□ 2.58
SYTL1-211ENST00000618673 ABCA8O94911 1581 aa31.14■■■□□ 2.58
SYTL1-211ENST00000618673 PTPRGP23470 1445 aa31.13■■■□□ 2.57
SYTL1-211ENST00000618673 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.12■■■□□ 2.57
SYTL1-211ENST00000618673 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
SYTL1-211ENST00000618673 HRCP23327 699 aa31.09■■■□□ 2.57
SYTL1-211ENST00000618673 NCOA2Q15596 1464 aa31.06■■■□□ 2.56
SYTL1-211ENST00000618673 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.05■■■□□ 2.56
SYTL1-211ENST00000618673 ARID3CA6NKF2 412 aa31.04■■■□□ 2.56
SYTL1-211ENST00000618673 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SYTL1-211ENST00000618673 ARHGEF11O15085 1522 aa31.03■■■□□ 2.56
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SYTL1-211ENST00000618673 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
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SYTL1-211ENST00000618673 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.96■■■□□ 2.55
SYTL1-211ENST00000618673 UACAQ9BZF9 1416 aa30.96■■■□□ 2.55
SYTL1-211ENST00000618673 OSCARQ8IYS5 282 aa30.95■■■□□ 2.55
SYTL1-211ENST00000618673 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
SYTL1-211ENST00000618673 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
SYTL1-211ENST00000618673 ATP10BO94823 1461 aa30.92■■■□□ 2.54
SYTL1-211ENST00000618673 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
SYTL1-211ENST00000618673 ABCC2Q92887 1545 aa30.87■■■□□ 2.53
SYTL1-211ENST00000618673 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.83■■■□□ 2.53
SYTL1-211ENST00000618673 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.81■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 MIA2Q96PC5 1412 aa30.8■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.8■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.78■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 ITGAEP38570 1179 aa30.78■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
SYTL1-211ENST00000618673 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
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SYTL1-211ENST00000618673 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.67■■■□□ 2.5
SYTL1-211ENST00000618673 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.64■■■□□ 2.5
SYTL1-211ENST00000618673 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SYTL1-211ENST00000618673 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SYTL1-211ENST00000618673 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.59■■■□□ 2.49
SYTL1-211ENST00000618673 PTPRKQ15262 1439 aa30.57■■■□□ 2.48
SYTL1-211ENST00000618673 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SYTL1-211ENST00000618673 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.54■■■□□ 2.48
SYTL1-211ENST00000618673 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.53■■■□□ 2.48
SYTL1-211ENST00000618673 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.51■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 HFM1A2PYH4 1435 aa30.49■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 DAPK1P53355 1430 aa30.45■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.47
SYTL1-211ENST00000618673 AKNAQ7Z591 1439 aa30.45■■■□□ 2.46
SYTL1-211ENST00000618673 PREX2Q70Z35 1606 aa30.43■■■□□ 2.46
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