RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617962.1

GADD45A-205, Transcript of growth arrest and DNA damage inducible alpha, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45A, Length 1,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45A-205ENST00000617962 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.21■■■■■ 4.51
GADD45A-205ENST00000617962 IGF1RP08069 1367 aa43.16■■■■■ 4.5
GADD45A-205ENST00000617962 KIF27Q86VH2 1401 aa43.14■■■■■ 4.5
GADD45A-205ENST00000617962 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.09■■■■■ 4.49
GADD45A-205ENST00000617962 CUL7Q14999 1698 aa43.08■■■■■ 4.49
GADD45A-205ENST00000617962 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
GADD45A-205ENST00000617962 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.01■■■■■ 4.48
GADD45A-205ENST00000617962 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.99■■■■■ 4.47
GADD45A-205ENST00000617962 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.99■■■■■ 4.47
GADD45A-205ENST00000617962 MAPKBP1O60336 1514 aa42.97■■■■■ 4.47
GADD45A-205ENST00000617962 DIP2BQ9P265 1576 aa42.88■■■■■ 4.45
GADD45A-205ENST00000617962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.87■■■■■ 4.45
GADD45A-205ENST00000617962 PTPRGP23470 1445 aa42.76■■■■■ 4.44
GADD45A-205ENST00000617962 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
GADD45A-205ENST00000617962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.68■■■■■ 4.42
GADD45A-205ENST00000617962 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.65■■■■■ 4.42
GADD45A-205ENST00000617962 IQGAP2Q13576 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
GADD45A-205ENST00000617962 TSPOAP1O95153 1857 aa42.61■■■■■ 4.41
GADD45A-205ENST00000617962 KDM6BO15054 1643 aa42.58■■■■■ 4.41
GADD45A-205ENST00000617962 ABCC2Q92887 1545 aa42.56■■■■■ 4.4
GADD45A-205ENST00000617962 DISP1Q96F81 1524 aa42.47■■■■■ 4.39
GADD45A-205ENST00000617962 ASXL2Q76L83 1435 aa42.46■■■■■ 4.39
GADD45A-205ENST00000617962 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.44■■■■■ 4.38
GADD45A-205ENST00000617962 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.43■■■■■ 4.38
GADD45A-205ENST00000617962 UACAQ9BZF9 1416 aa42.42■■■■■ 4.38
GADD45A-205ENST00000617962 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.41■■■■■ 4.38
GADD45A-205ENST00000617962 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.36■■■■■ 4.37
GADD45A-205ENST00000617962 GLI2P10070 1586 aa42.34■■■■■ 4.37
GADD45A-205ENST00000617962 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GADD45A-205ENST00000617962 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.28■■■■■ 4.36
GADD45A-205ENST00000617962 KIAA0556O60303 1618 aa42.27■■■■■ 4.36
GADD45A-205ENST00000617962 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.25■■■■■ 4.35
GADD45A-205ENST00000617962 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
GADD45A-205ENST00000617962 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
GADD45A-205ENST00000617962 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.12■■■■■ 4.33
GADD45A-205ENST00000617962 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.11■■■■■ 4.33
GADD45A-205ENST00000617962 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
GADD45A-205ENST00000617962 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.01■■■■■ 4.32
GADD45A-205ENST00000617962 GOLGA3Q08378 1498 aa41.99■■■■■ 4.31
GADD45A-205ENST00000617962 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.98■■■■■ 4.31
GADD45A-205ENST00000617962 PRXQ9BXM0 1461 aa41.94■■■■■ 4.3
GADD45A-205ENST00000617962 ABCA8O94911 1581 aa41.9■■■■■ 4.3
GADD45A-205ENST00000617962 ADGRL1O94910 1474 aa41.88■■■■■ 4.29
GADD45A-205ENST00000617962 KCNH8Q96L42 1107 aa41.8■■■■■ 4.28
GADD45A-205ENST00000617962 CD109Q6YHK3 1445 aa41.77■■■■■ 4.28
GADD45A-205ENST00000617962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.74■■■■■ 4.27
GADD45A-205ENST00000617962 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.73■■■■■ 4.27
GADD45A-205ENST00000617962 P3H3Q8IVL6 736 aa41.67■■■■■ 4.26
GADD45A-205ENST00000617962 ARID3CA6NKF2 412 aa41.62■■■■■ 4.25
GADD45A-205ENST00000617962 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
GADD45A-205ENST00000617962 ATP10BO94823 1461 aa41.56■■■■■ 4.24
GADD45A-205ENST00000617962 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.56■■■■■ 4.24
GADD45A-205ENST00000617962 SAMD9Q5K651 1589 aa41.5■■■■■ 4.23
GADD45A-205ENST00000617962 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.41■■■■■ 4.22
GADD45A-205ENST00000617962 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.4■■■■■ 4.22
GADD45A-205ENST00000617962 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.39■■■■■ 4.22
GADD45A-205ENST00000617962 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.39■■■■■ 4.22
GADD45A-205ENST00000617962 KIF21BO75037 1637 aa41.36■■■■■ 4.21
GADD45A-205ENST00000617962 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 EEA1Q15075 1411 aa41.31■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.28■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
GADD45A-205ENST00000617962 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
GADD45A-205ENST00000617962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.24■■■■■ 4.19
GADD45A-205ENST00000617962 NEO1Q92859 1461 aa41.2■■■■■ 4.19
GADD45A-205ENST00000617962 RAPGEF3O95398 923 aa41.19■■■■■ 4.18
GADD45A-205ENST00000617962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.08■■■■■ 4.17
GADD45A-205ENST00000617962 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.06■■■■■ 4.16
GADD45A-205ENST00000617962 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.03■■■■■ 4.16
GADD45A-205ENST00000617962 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.03■■■■■ 4.16
GADD45A-205ENST00000617962 PTPRMP28827 1452 aa40.97■■■■■ 4.15
GADD45A-205ENST00000617962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
GADD45A-205ENST00000617962 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.143e-8■■□□□ 13.9
GADD45A-205ENST00000617962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
GADD45A-205ENST00000617962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.92■■■■■ 4.14
GADD45A-205ENST00000617962 AKNAQ7Z591 1439 aa40.91■■■■■ 4.14
GADD45A-205ENST00000617962 FANCAO15360 1455 aa40.9■■■■■ 4.14
GADD45A-205ENST00000617962 RICTORQ6R327 1708 aa40.88■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.87■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.87■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.87■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 MADDQ8WXG6 1647 aa40.85■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.82■■■■■ 4.13
GADD45A-205ENST00000617962 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
GADD45A-205ENST00000617962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.72■■■■■ 4.11
GADD45A-205ENST00000617962 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
GADD45A-205ENST00000617962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.67■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 FMN1Q68DA7 1419 aa40.67■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.67■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 PLCH2O75038 1416 aa40.66■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 HECW1Q76N89 1606 aa40.65■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.64■■■■■ 4.1
GADD45A-205ENST00000617962 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.62■■■■■ 4.09
GADD45A-205ENST00000617962 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.62■■■■■ 4.09
GADD45A-205ENST00000617962 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.62■■■■■ 4.09
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