RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617744.4

NUDT13-208, Transcript of nudix hydrolase 13, human

TSL 5 BASIC

Gene NUDT13, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUDT13-208	ENST00000617744	NUP160	Q12769	1436 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NUDT13-208	ENST00000617744	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NUDT13-208	ENST00000617744	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NUDT13-208	ENST00000617744	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NUDT13-208	ENST00000617744	CUL7	Q14999	1698 aa		13.37	□□□□□ -0.27
NUDT13-208	ENST00000617744	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUDT13-208	ENST00000617744	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.34	□□□□□ -0.27
NUDT13-208	ENST00000617744	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
NUDT13-208	ENST00000617744	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUDT13-208	ENST00000617744	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUDT13-208	ENST00000617744	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUDT13-208	ENST00000617744	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
NUDT13-208	ENST00000617744	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPRG	P23470	1445 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.21	□□□□□ -0.29
NUDT13-208	ENST00000617744	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
NUDT13-208	ENST00000617744	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.18	□□□□□ -0.3
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.17	□□□□□ -0.3
NUDT13-208	ENST00000617744	EEA1	Q15075	1411 aa		13.16	□□□□□ -0.3
NUDT13-208	ENST00000617744	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.16	□□□□□ -0.3
NUDT13-208	ENST00000617744	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.14	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	GOLGA3	Q08378	1498 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
NUDT13-208	ENST00000617744	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF21B	O75037	1637 aa		13.02	□□□□□ -0.32
NUDT13-208	ENST00000617744	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.01	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	TSPOAP1	O95153	1857 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	DIP2B	Q9P265	1576 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCA8	O94911	1581 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NUDT13-208	ENST00000617744	SAMD9	Q5K651	1589 aa		12.95	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	ATP10B	O94823	1461 aa		12.93	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		12.92	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		12.91	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.91	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		12.9	□□□□□ -0.34
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	CD109	Q6YHK3	1445 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	GLI2	P10070	1586 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM6B	O15054	1643 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
NUDT13-208	ENST00000617744	CLIP1	P30622	1438 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	FMN1	Q68DA7	1419 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NUDT13-208	ENST00000617744	RAPGEF3	O95398	923 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	HECW1	Q76N89	1606 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	CEP162	Q5TB80	1403 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		12.72	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		12.71	□□□□□ -0.37
NUDT13-208	ENST00000617744	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.7	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	12.7	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		12.68	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		12.68	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		12.68	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.67	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	AKNA	Q7Z591	1439 aa		12.67	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	FANCA	O15360	1455 aa		12.66	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	KIF14	Q15058	1648 aa		12.66	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		12.65	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	NEO1	Q92859	1461 aa		12.65	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		12.65	□□□□□ -0.38
NUDT13-208	ENST00000617744	PLCH2	O75038	1416 aa		12.64	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		12.63	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.63	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		12.63	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		12.63	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12.62	□□□□□ -0.39
NUDT13-208	ENST00000617744	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		12.62	□□□□□ -0.39

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