RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
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PTPRQ-209ENST00000616559 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa2.79□□□□□ -1.96
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PTPRQ-209ENST00000616559 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRQ-209ENST00000616559 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
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PTPRQ-209ENST00000616559 G3V3G9 751 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRQ-209ENST00000616559 ATXN8OSP0DMR3 200 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRQ-209ENST00000616559 WWC2Q6AWC2 1192 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRQ-209ENST00000616559 EVPLQ92817 2033 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 APPP05067 770 aa2.7□□□□□ -1.98
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PTPRQ-209ENST00000616559 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 GOLGA6L22H0YM25 854 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 VGFO15240 615 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 RFX1P22670 979 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 RP1P56715 2156 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 PCM1Q15154 2024 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 PTMAP06454 111 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 KNL1Q8NG31 2342 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF318Q5VUA4 2279 aa2.68□□□□□ -1.98
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