RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614125.4

TTC8-216, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC8, Length 2,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC8-216ENST00000614125 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.56■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.56■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 PBRM1Q86U86 1689 aa25.55■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 MAP3K1Q13233 1512 aa25.55■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.53■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TTC8-216ENST00000614125 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.5■■□□□ 1.67
TTC8-216ENST00000614125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.49■■□□□ 1.67
TTC8-216ENST00000614125 SAMD9Q5K651 1589 aa25.45■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 P3H3Q8IVL6 736 aa25.44■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 WDR62O43379 1518 aa25.44■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.43■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.41■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 ADAMTS12P58397 1594 aa25.4■■□□□ 1.66
TTC8-216ENST00000614125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
TTC8-216ENST00000614125 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC8-216ENST00000614125 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.36■■□□□ 1.65
TTC8-216ENST00000614125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC8-216ENST00000614125 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.33■■□□□ 1.65
TTC8-216ENST00000614125 IFT140Q96RY7 1462 aa25.32■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 FMN1Q68DA7 1419 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 GRIN2BQ13224 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.28■■□□□ 1.64
TTC8-216ENST00000614125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC8-216ENST00000614125 IQGAP2Q13576 1575 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC8-216ENST00000614125 ERCC6Q03468 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
TTC8-216ENST00000614125 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
TTC8-216ENST00000614125 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TTC8-216ENST00000614125 ITGAEP38570 1179 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC8-216ENST00000614125 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC8-216ENST00000614125 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 GRIN2AQ12879 1464 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 HECW1Q76N89 1606 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.03■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.03■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TTC8-216ENST00000614125 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 FGD6Q6ZV73 1430 aa25■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 KIAA0556O60303 1618 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 NCOA2Q15596 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 DISP1Q96F81 1524 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 ARHGEF11O15085 1522 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TTC8-216ENST00000614125 CEP170Q5SW79 1584 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC8-216ENST00000614125 MAPKBP1O60336 1514 aa24.94■■□□□ 1.58
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TTC8-216ENST00000614125 SYNJ2O15056 1496 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC8-216ENST00000614125 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTC8-216ENST00000614125 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC8-216ENST00000614125 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.86■■□□□ 1.57
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TTC8-216ENST00000614125 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.83■■□□□ 1.56
TTC8-216ENST00000614125 NUP160Q12769 1436 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC8-216ENST00000614125 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TTC8-216ENST00000614125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TTC8-216ENST00000614125 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TTC8-216ENST00000614125 HFM1A2PYH4 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
TTC8-216ENST00000614125 ARID3CA6NKF2 412 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC8-216ENST00000614125 FBLN2P98095 1184 aa24.7■■□□□ 1.54
TTC8-216ENST00000614125 NAIPQ13075 1403 aa24.67■■□□□ 1.54
TTC8-216ENST00000614125 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.67■■□□□ 1.54
TTC8-216ENST00000614125 MIA2Q96PC5 1412 aa24.66■■□□□ 1.54
TTC8-216ENST00000614125 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.66■■□□□ 1.54
TTC8-216ENST00000614125 CHD1O14646 1710 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 JPH4Q96JJ6 628 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 UACAQ9BZF9 1416 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC8-216ENST00000614125 ABCA8O94911 1581 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC8-216ENST00000614125 KDM6BO15054 1643 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC8-216ENST00000614125 AKNAQ7Z591 1439 aa24.55■■□□□ 1.52
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TTC8-216ENST00000614125 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TTC8-216ENST00000614125 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 MIER1Q8N108 512 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 NEUROD1Q13562 356 aa24.49■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.49■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 DAPK1P53355 1430 aa24.48■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.47■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TTC8-216ENST00000614125 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 ABCC5O15440 1437 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC8-216ENST00000614125 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.41■■□□□ 1.5
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