RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610462.1

CSPG5-205, Transcript of chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSPG5, Length 2,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5-205ENST00000610462 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.38■■■■■ 4.38
CSPG5-205ENST00000610462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.34■■■■■ 4.37
CSPG5-205ENST00000610462 TIAM1Q13009 1591 aa42.33■■■■■ 4.37
CSPG5-205ENST00000610462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
CSPG5-205ENST00000610462 PBRM1Q86U86 1689 aa42.24■■■■■ 4.35
CSPG5-205ENST00000610462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
CSPG5-205ENST00000610462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.18■■■■■ 4.34
CSPG5-205ENST00000610462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.18■■■■■ 4.34
CSPG5-205ENST00000610462 P3H3Q8IVL6 736 aa42.17■■■■■ 4.34
CSPG5-205ENST00000610462 WDR62O43379 1518 aa42.15■■■■■ 4.34
CSPG5-205ENST00000610462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
CSPG5-205ENST00000610462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.11■■■■■ 4.33
CSPG5-205ENST00000610462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.1■■■■■ 4.33
CSPG5-205ENST00000610462 SAMD9Q5K651 1589 aa42.09■■■■■ 4.33
CSPG5-205ENST00000610462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.06■■■■■ 4.32
CSPG5-205ENST00000610462 IFT140Q96RY7 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
CSPG5-205ENST00000610462 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.04■■■■■ 4.32
CSPG5-205ENST00000610462 ADAMTS12P58397 1594 aa42.02■■■■■ 4.32
CSPG5-205ENST00000610462 FMN1Q68DA7 1419 aa42.01■■■■■ 4.32
CSPG5-205ENST00000610462 GRIN2BQ13224 1484 aa41.99■■■■■ 4.31
CSPG5-205ENST00000610462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.9■■■■■ 4.3
CSPG5-205ENST00000610462 ERCC6Q03468 1493 aa41.88■■■■■ 4.29
CSPG5-205ENST00000610462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
CSPG5-205ENST00000610462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
CSPG5-205ENST00000610462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
CSPG5-205ENST00000610462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.8■■■■■ 4.28
CSPG5-205ENST00000610462 IQGAP2Q13576 1575 aa41.79■■■■■ 4.28
CSPG5-205ENST00000610462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.73■■■■■ 4.27
CSPG5-205ENST00000610462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
CSPG5-205ENST00000610462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CSPG5-205ENST00000610462 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.69■■■■■ 4.26
CSPG5-205ENST00000610462 ITGAEP38570 1179 aa41.6■■■■■ 4.25
CSPG5-205ENST00000610462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.58■■■■■ 4.25
CSPG5-205ENST00000610462 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.54■■■■■ 4.24
CSPG5-205ENST00000610462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
CSPG5-205ENST00000610462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.51■■■■■ 4.24
CSPG5-205ENST00000610462 GRIN2AQ12879 1464 aa41.51■■■■■ 4.24
CSPG5-205ENST00000610462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
CSPG5-205ENST00000610462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
CSPG5-205ENST00000610462 HECW1Q76N89 1606 aa41.49■■■■■ 4.23
CSPG5-205ENST00000610462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.48■■■■■ 4.23
CSPG5-205ENST00000610462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.46■■■■■ 4.23
CSPG5-205ENST00000610462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.44■■■■■ 4.22
CSPG5-205ENST00000610462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CSPG5-205ENST00000610462 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.42■■■■■ 4.22
CSPG5-205ENST00000610462 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.41■■■■■ 4.22
CSPG5-205ENST00000610462 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CSPG5-205ENST00000610462 NCOA2Q15596 1464 aa41.37■■■■■ 4.21
CSPG5-205ENST00000610462 KIAA0556O60303 1618 aa41.36■■■■■ 4.21
CSPG5-205ENST00000610462 SYNJ2O15056 1496 aa41.35■■■■■ 4.21
CSPG5-205ENST00000610462 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CSPG5-205ENST00000610462 DISP1Q96F81 1524 aa41.32■■■■■ 4.21
CSPG5-205ENST00000610462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.31■■■■■ 4.2
CSPG5-205ENST00000610462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CSPG5-205ENST00000610462 ARHGEF11O15085 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
CSPG5-205ENST00000610462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.28■■■■■ 4.2
CSPG5-205ENST00000610462 CEP170Q5SW79 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
CSPG5-205ENST00000610462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
CSPG5-205ENST00000610462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CSPG5-205ENST00000610462 MAPKBP1O60336 1514 aa41.16■■■■■ 4.18
CSPG5-205ENST00000610462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.13■■■■■ 4.18
CSPG5-205ENST00000610462 NUP160Q12769 1436 aa41.12■■■■■ 4.17
CSPG5-205ENST00000610462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.11■■■■■ 4.17
CSPG5-205ENST00000610462 FBLN2P98095 1184 aa41.05■■■■■ 4.16
CSPG5-205ENST00000610462 PTPRKQ15262 1439 aa41.04■■■■■ 4.16
CSPG5-205ENST00000610462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CSPG5-205ENST00000610462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CSPG5-205ENST00000610462 HFM1A2PYH4 1435 aa40.98■■■■■ 4.15
CSPG5-205ENST00000610462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.94■■■■■ 4.14
CSPG5-205ENST00000610462 MIA2Q96PC5 1412 aa40.94■■■■■ 4.14
CSPG5-205ENST00000610462 ARID3CA6NKF2 412 aa40.92■■■■■ 4.14
CSPG5-205ENST00000610462 JPH4Q96JJ6 628 aa40.9■■■■■ 4.14
CSPG5-205ENST00000610462 NAIPQ13075 1403 aa40.85■■■■■ 4.13
CSPG5-205ENST00000610462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
CSPG5-205ENST00000610462 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.8■■■■■ 4.12
CSPG5-205ENST00000610462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.77■■■■■ 4.12
CSPG5-205ENST00000610462 UACAQ9BZF9 1416 aa40.77■■■■■ 4.12
CSPG5-205ENST00000610462 AKNAQ7Z591 1439 aa40.73■■■■■ 4.11
CSPG5-205ENST00000610462 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
CSPG5-205ENST00000610462 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.7■■■■■ 4.11
CSPG5-205ENST00000610462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.68■■■■■ 4.1
CSPG5-205ENST00000610462 CHD1O14646 1710 aa40.68■■■■■ 4.1
CSPG5-205ENST00000610462 ABCA8O94911 1581 aa40.68■■■■■ 4.1
CSPG5-205ENST00000610462 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.67■■■■■ 4.1
CSPG5-205ENST00000610462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CSPG5-205ENST00000610462 NEUROD1Q13562 356 aa40.62■■■■■ 4.09
CSPG5-205ENST00000610462 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.6■■■■■ 4.09
CSPG5-205ENST00000610462 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
CSPG5-205ENST00000610462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.58■■■■■ 4.09
CSPG5-205ENST00000610462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.58■■■■■ 4.09
CSPG5-205ENST00000610462 DAPK1P53355 1430 aa40.55■■■■■ 4.08
CSPG5-205ENST00000610462 KIF14Q15058 1648 aa40.54■■■■■ 4.08
CSPG5-205ENST00000610462 MIER1Q8N108 512 aa40.52■■■■■ 4.08
CSPG5-205ENST00000610462 ROCK1Q13464 1354 aa40.49■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 KDM6BO15054 1643 aa40.49■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 ABCC5O15440 1437 aa40.49■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 ATP10BO94823 1461 aa40.46■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 SHROOM2Q13796 1616 aa40.45■■■■■ 4.07
CSPG5-205ENST00000610462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms