RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
VIM-AS1-202ENST00000605833 CUL7Q14999 1698 aa36.8■■■■□ 3.48
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.77■■■■□ 3.48
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIF27Q86VH2 1401 aa36.76■■■■□ 3.47
VIM-AS1-202ENST00000605833 IGF1RP08069 1367 aa36.75■■■■□ 3.47
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.73■■■■□ 3.47
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAPKBP1O60336 1514 aa36.69■■■■□ 3.46
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.67■■■■□ 3.46
VIM-AS1-202ENST00000605833 DIP2BQ9P265 1576 aa36.66■■■■□ 3.46
VIM-AS1-202ENST00000605833 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.62■■■■□ 3.45
VIM-AS1-202ENST00000605833 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.52■■■■□ 3.44
VIM-AS1-202ENST00000605833 TSPOAP1O95153 1857 aa36.47■■■■□ 3.43
VIM-AS1-202ENST00000605833 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTPRGP23470 1445 aa36.42■■■■□ 3.42
VIM-AS1-202ENST00000605833 IQGAP2Q13576 1575 aa36.42■■■■□ 3.42
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDM6BO15054 1643 aa36.39■■■■□ 3.42
VIM-AS1-202ENST00000605833 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.35■■■■□ 3.41
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.34■■■■□ 3.41
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCC2Q92887 1545 aa36.3■■■■□ 3.4
VIM-AS1-202ENST00000605833 DISP1Q96F81 1524 aa36.24■■■■□ 3.39
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASXL2Q76L83 1435 aa36.21■■■■□ 3.39
VIM-AS1-202ENST00000605833 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.18■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 UACAQ9BZF9 1416 aa36.16■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.14■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.14■■■■□ 3.38
VIM-AS1-202ENST00000605833 GLI2P10070 1586 aa36.12■■■■□ 3.37
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA0556O60303 1618 aa36.12■■■■□ 3.37
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.05■■■■□ 3.36
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.03■■■■□ 3.36
VIM-AS1-202ENST00000605833 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.03■■■■□ 3.36
VIM-AS1-202ENST00000605833 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.98■■■■□ 3.35
VIM-AS1-202ENST00000605833 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.82■■■■□ 3.32
VIM-AS1-202ENST00000605833 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.81■■■■□ 3.32
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADGRL1O94910 1474 aa35.79■■■■□ 3.32
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA3Q08378 1498 aa35.79■■■■□ 3.32
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCA8O94911 1581 aa35.77■■■■□ 3.32
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRXQ9BXM0 1461 aa35.75■■■■□ 3.31
VIM-AS1-202ENST00000605833 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.67■■■■□ 3.3
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCNH8Q96L42 1107 aa35.6■■■■□ 3.29
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD109Q6YHK3 1445 aa35.59■■■■□ 3.29
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.57■■■■□ 3.29
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARID3CA6NKF2 412 aa35.52■■■■□ 3.28
VIM-AS1-202ENST00000605833 P3H3Q8IVL6 736 aa35.51■■■■□ 3.28
VIM-AS1-202ENST00000605833 SAMD9Q5K651 1589 aa35.45■■■■□ 3.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATP10BO94823 1461 aa35.43■■■■□ 3.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIF21BO75037 1637 aa35.4■■■■□ 3.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.4■■■■□ 3.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.36■■■■□ 3.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.35■■■■□ 3.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.35■■■■□ 3.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.31■■■■□ 3.24
VIM-AS1-202ENST00000605833 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
VIM-AS1-202ENST00000605833 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
VIM-AS1-202ENST00000605833 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.2■■■■□ 3.23
VIM-AS1-202ENST00000605833 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
VIM-AS1-202ENST00000605833 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
VIM-AS1-202ENST00000605833 EEA1Q15075 1411 aa35.16■■■■□ 3.22
VIM-AS1-202ENST00000605833 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.13■■■■□ 3.21
VIM-AS1-202ENST00000605833 NEO1Q92859 1461 aa35.12■■■■□ 3.21
VIM-AS1-202ENST00000605833 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.11■■■■□ 3.21
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAPGEF3O95398 923 aa35.1■■■■□ 3.21
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.05■■■■□ 3.2
VIM-AS1-202ENST00000605833 EFCAB5A4FU69 1503 aa35■■■■□ 3.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.98■■■■□ 3.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTPRMP28827 1452 aa34.97■■■■□ 3.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.96■■■■□ 3.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 RICTORQ6R327 1708 aa34.95■■■■□ 3.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.194e-8■■■■□ 20.7
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.94■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 MADDQ8WXG6 1647 aa34.94■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.92■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.91■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 FANCAO15360 1455 aa34.89■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 AKNAQ7Z591 1439 aa34.88■■■■□ 3.17
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
VIM-AS1-202ENST00000605833 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.84■■■■□ 3.17
VIM-AS1-202ENST00000605833 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.77■■■■□ 3.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.77■■■■□ 3.16
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.74■■■■□ 3.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 HECW1Q76N89 1606 aa34.73■■■■□ 3.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.72■■■■□ 3.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.68■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.67■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.66■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLCH2O75038 1416 aa34.64■■■■□ 3.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 FMN1Q68DA7 1419 aa34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms