RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603544.5

KIAA0391-205, Transcript of KIAA0391, human

TSL 5 BASIC

Gene KIAA0391, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-205	ENST00000603544	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.67	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.65	□□□□□ -0.22
KIAA0391-205	ENST00000603544	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KIAA0391-205	ENST00000603544	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	ITGAE	P38570	1179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
KIAA0391-205	ENST00000603544	WDR62	O43379	1518 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.47	□□□□□ -0.25
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.43	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.42	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.4	□□□□□ -0.26
KIAA0391-205	ENST00000603544	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.33	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.32	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	MIER1	Q8N108	512 aa		13.32	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.31	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.3	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.3	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.28	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.28	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
KIAA0391-205	ENST00000603544	NAIP	Q13075	1403 aa		13.27	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.25	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	FBLN2	P98095	1184 aa		13.24	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	NUP160	Q12769	1436 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.21	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	KDM6B	O15054	1643 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0391-205	ENST00000603544	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIF14	Q15058	1648 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	DAPK1	P53355	1430 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	ABCC5	O15440	1437 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0391-205	ENST00000603544	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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