RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-215ENST00000602164 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.29■■■■■ 4.84
USF2-215ENST00000602164 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.29■■■■■ 4.84
USF2-215ENST00000602164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.24■■■■■ 4.83
USF2-215ENST00000602164 PRXQ9BXM0 1461 aa45.19■■■■■ 4.82
USF2-215ENST00000602164 JPH4Q96JJ6 628 aa45.18■■■■■ 4.82
USF2-215ENST00000602164 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
USF2-215ENST00000602164 EEA1Q15075 1411 aa45.12■■■■■ 4.81
USF2-215ENST00000602164 IQGAP2Q13576 1575 aa45.04■■■■■ 4.8
USF2-215ENST00000602164 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.02■■■■■ 4.8
USF2-215ENST00000602164 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.9■■■■■ 4.78
USF2-215ENST00000602164 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.83■■■■■ 4.77
USF2-215ENST00000602164 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
USF2-215ENST00000602164 DISP1Q96F81 1524 aa44.76■■■■■ 4.76
USF2-215ENST00000602164 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.73■■■■■ 4.75
USF2-215ENST00000602164 KIF21BO75037 1637 aa44.72■■■■■ 4.75
USF2-215ENST00000602164 KIAA0556O60303 1618 aa44.64■■■■■ 4.74
USF2-215ENST00000602164 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.62■■■■■ 4.73
USF2-215ENST00000602164 PTPRGP23470 1445 aa44.58■■■■■ 4.73
USF2-215ENST00000602164 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.53■■■■■ 4.72
USF2-215ENST00000602164 GOLGA3Q08378 1498 aa44.49■■■■■ 4.71
USF2-215ENST00000602164 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
USF2-215ENST00000602164 SAMD9Q5K651 1589 aa44.37■■■■■ 4.69
USF2-215ENST00000602164 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.33■■■■■ 4.69
USF2-215ENST00000602164 UACAQ9BZF9 1416 aa44.31■■■■■ 4.68
USF2-215ENST00000602164 ABCC2Q92887 1545 aa44.28■■■■■ 4.68
USF2-215ENST00000602164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
USF2-215ENST00000602164 MAPKBP1O60336 1514 aa44.24■■■■■ 4.67
USF2-215ENST00000602164 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.2■■■■■ 4.67
USF2-215ENST00000602164 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.17■■■■■ 4.66
USF2-215ENST00000602164 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.17■■■■■ 4.66
USF2-215ENST00000602164 ABCA8O94911 1581 aa44.17■■■■■ 4.66
USF2-215ENST00000602164 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
USF2-215ENST00000602164 P3H3Q8IVL6 736 aa44.13■■■■■ 4.66
USF2-215ENST00000602164 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.12■■■■■ 4.65
USF2-215ENST00000602164 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.12■■■■■ 4.65
USF2-215ENST00000602164 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
USF2-215ENST00000602164 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.05■■■■■ 4.64
USF2-215ENST00000602164 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.04■■■■■ 4.64
USF2-215ENST00000602164 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
USF2-215ENST00000602164 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.02■■■■■ 4.64
USF2-215ENST00000602164 DIP2BQ9P265 1576 aa43.99■■■■■ 4.63
USF2-215ENST00000602164 ASXL2Q76L83 1435 aa43.94■■■■■ 4.62
USF2-215ENST00000602164 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.91■■■■■ 4.62
USF2-215ENST00000602164 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.89■■■■■ 4.62
USF2-215ENST00000602164 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.81■■■■■ 4.6
USF2-215ENST00000602164 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
USF2-215ENST00000602164 ATP10BO94823 1461 aa43.76■■■■■ 4.6
USF2-215ENST00000602164 GLI2P10070 1586 aa43.73■■■■■ 4.59
USF2-215ENST00000602164 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.73■■■■■ 4.59
USF2-215ENST00000602164 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
USF2-215ENST00000602164 FMN1Q68DA7 1419 aa43.65■■■■■ 4.58
USF2-215ENST00000602164 ARID3CA6NKF2 412 aa43.64■■■■■ 4.58
USF2-215ENST00000602164 CLIP1P30622 1438 aa43.59■■■■■ 4.57
USF2-215ENST00000602164 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.55■■■■■ 4.56
USF2-215ENST00000602164 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
USF2-215ENST00000602164 TSPOAP1O95153 1857 aa43.51■■■■■ 4.56
USF2-215ENST00000602164 HECW1Q76N89 1606 aa43.49■■■■■ 4.55
USF2-215ENST00000602164 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.42■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 CEP162Q5TB80 1403 aa43.41■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 KCNH8Q96L42 1107 aa43.39■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.39■■■■■ 4.54
USF2-215ENST00000602164 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
USF2-215ENST00000602164 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
USF2-215ENST00000602164 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.36■■■■■ 4.53
USF2-215ENST00000602164 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.34■■■■■ 4.53
USF2-215ENST00000602164 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.31■■■■■ 4.52
USF2-215ENST00000602164 CD109Q6YHK3 1445 aa43.28■■■■■ 4.52
USF2-215ENST00000602164 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.27■■■■■ 4.52
USF2-215ENST00000602164 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.26■■■■■ 4.52
USF2-215ENST00000602164 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
USF2-215ENST00000602164 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.25■■■■■ 4.51
USF2-215ENST00000602164 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.24■■■■■ 4.51
USF2-215ENST00000602164 KDM6BO15054 1643 aa43.22■■■■■ 4.51
USF2-215ENST00000602164 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.17■■■■■ 4.5
USF2-215ENST00000602164 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.492e-6■□□□□ 9.6
USF2-215ENST00000602164 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.08■■■■■ 4.49
USF2-215ENST00000602164 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
USF2-215ENST00000602164 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
USF2-215ENST00000602164 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
USF2-215ENST00000602164 KIF14Q15058 1648 aa43■■■■■ 4.47
USF2-215ENST00000602164 NEO1Q92859 1461 aa42.92■■■■■ 4.46
USF2-215ENST00000602164 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.89■■■■■ 4.46
USF2-215ENST00000602164 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.89■■■■■ 4.46
USF2-215ENST00000602164 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.87■■■■■ 4.45
USF2-215ENST00000602164 PLCH2O75038 1416 aa42.82■■■■■ 4.45
USF2-215ENST00000602164 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.81■■■■■ 4.44
USF2-215ENST00000602164 FANCAO15360 1455 aa42.81■■■■■ 4.44
USF2-215ENST00000602164 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.8■■■■■ 4.44
USF2-215ENST00000602164 AKNAQ7Z591 1439 aa42.72■■■■■ 4.43
USF2-215ENST00000602164 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.69■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.67■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 TIAM1Q13009 1591 aa42.67■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 PREX2Q70Z35 1606 aa42.67■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.65■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.65■■■■■ 4.42
USF2-215ENST00000602164 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.62■■■■■ 4.41
USF2-215ENST00000602164 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.61■■■■■ 4.41
USF2-215ENST00000602164 RICTORQ6R327 1708 aa42.6■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.8 ms