RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599650.1

TIMM44-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-209ENST00000599650 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM44-209ENST00000599650 SHROOM2Q13796 1616 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM44-209ENST00000599650 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM44-209ENST00000599650 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM44-209ENST00000599650 CUL7Q14999 1698 aa22.89■■□□□ 1.25
TIMM44-209ENST00000599650 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TIMM44-209ENST00000599650 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
TIMM44-209ENST00000599650 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
TIMM44-209ENST00000599650 PTPRGP23470 1445 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM44-209ENST00000599650 EEA1Q15075 1411 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM44-209ENST00000599650 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM44-209ENST00000599650 IQGAP2Q13576 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
TIMM44-209ENST00000599650 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM44-209ENST00000599650 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.61■■□□□ 1.21
TIMM44-209ENST00000599650 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM44-209ENST00000599650 DISP1Q96F81 1524 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM44-209ENST00000599650 PRXQ9BXM0 1461 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM44-209ENST00000599650 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM44-209ENST00000599650 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM44-209ENST00000599650 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMM44-209ENST00000599650 MAPKBP1O60336 1514 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM44-209ENST00000599650 UACAQ9BZF9 1416 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM44-209ENST00000599650 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TIMM44-209ENST00000599650 ABCC2Q92887 1545 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMM44-209ENST00000599650 KIAA0556O60303 1618 aa22.46■■□□□ 1.19
TIMM44-209ENST00000599650 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 DIP2BQ9P265 1576 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 ASXL2Q76L83 1435 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 GOLGA3Q08378 1498 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 P3H3Q8IVL6 736 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM44-209ENST00000599650 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM44-209ENST00000599650 KIF21BO75037 1637 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM44-209ENST00000599650 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM44-209ENST00000599650 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.35■■□□□ 1.17
TIMM44-209ENST00000599650 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM44-209ENST00000599650 ARID3CA6NKF2 412 aa22.29■■□□□ 1.16
TIMM44-209ENST00000599650 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM44-209ENST00000599650 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 ABCA8O94911 1581 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 GLI2P10070 1586 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 KCNH8Q96L42 1107 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-209ENST00000599650 TSPOAP1O95153 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
TIMM44-209ENST00000599650 KDM6BO15054 1643 aa22.17■■□□□ 1.14
TIMM44-209ENST00000599650 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM44-209ENST00000599650 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TIMM44-209ENST00000599650 SAMD9Q5K651 1589 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM44-209ENST00000599650 ATP10BO94823 1461 aa22.14■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.13■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 CD109Q6YHK3 1445 aa22.08■■□□□ 1.13
TIMM44-209ENST00000599650 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM44-209ENST00000599650 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM44-209ENST00000599650 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TIMM44-209ENST00000599650 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM44-209ENST00000599650 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM44-209ENST00000599650 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22■■□□□ 1.11
TIMM44-209ENST00000599650 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.98■■□□□ 1.11
TIMM44-209ENST00000599650 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.95■■□□□ 1.1
TIMM44-209ENST00000599650 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TIMM44-209ENST00000599650 CEP162Q5TB80 1403 aa21.95■■□□□ 1.1
TIMM44-209ENST00000599650 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.93■■□□□ 1.1
TIMM44-209ENST00000599650 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.91■■□□□ 1.1
TIMM44-209ENST00000599650 FMN1Q68DA7 1419 aa21.87■■□□□ 1.09
TIMM44-209ENST00000599650 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM44-209ENST00000599650 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM44-209ENST00000599650 CLIP1P30622 1438 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM44-209ENST00000599650 RAPGEF3O95398 923 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM44-209ENST00000599650 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.81■■□□□ 1.08
TIMM44-209ENST00000599650 ADGRL1O94910 1474 aa21.8■■□□□ 1.08
TIMM44-209ENST00000599650 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.8■■□□□ 1.08
TIMM44-209ENST00000599650 NEO1Q92859 1461 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM44-209ENST00000599650 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TIMM44-209ENST00000599650 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
TIMM44-209ENST00000599650 HECW1Q76N89 1606 aa21.73■■□□□ 1.07
TIMM44-209ENST00000599650 FANCAO15360 1455 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM44-209ENST00000599650 AKNAQ7Z591 1439 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM44-209ENST00000599650 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.7■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.67■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 PLCH2O75038 1416 aa21.66■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.65■■□□□ 1.06
TIMM44-209ENST00000599650 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.62■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.62■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.6■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 KIF14Q15058 1648 aa21.58■■□□□ 1.05
TIMM44-209ENST00000599650 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.58■■□□□ 1.04
TIMM44-209ENST00000599650 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
TIMM44-209ENST00000599650 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.55■■□□□ 1.04
TIMM44-209ENST00000599650 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.54■■□□□ 1.04
TIMM44-209ENST00000599650 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms