RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599454.5

PNKP-212, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-212ENST00000599454 CUL7Q14999 1698 aa37.25■■■■□ 3.55
PNKP-212ENST00000599454 KIF27Q86VH2 1401 aa37.23■■■■□ 3.55
PNKP-212ENST00000599454 IGF1RP08069 1367 aa37.17■■■■□ 3.54
PNKP-212ENST00000599454 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.17■■■■□ 3.54
PNKP-212ENST00000599454 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
PNKP-212ENST00000599454 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.08■■■■□ 3.53
PNKP-212ENST00000599454 MAPKBP1O60336 1514 aa37.08■■■■□ 3.53
PNKP-212ENST00000599454 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.07■■■■□ 3.52
PNKP-212ENST00000599454 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.03■■■■□ 3.52
PNKP-212ENST00000599454 DIP2BQ9P265 1576 aa36.95■■■■□ 3.51
PNKP-212ENST00000599454 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.95■■■■□ 3.51
PNKP-212ENST00000599454 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.94■■■■□ 3.5
PNKP-212ENST00000599454 PTPRGP23470 1445 aa36.83■■■■□ 3.49
PNKP-212ENST00000599454 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.82■■■■□ 3.48
PNKP-212ENST00000599454 IQGAP2Q13576 1575 aa36.82■■■■□ 3.48
PNKP-212ENST00000599454 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.77■■■■□ 3.48
PNKP-212ENST00000599454 TSPOAP1O95153 1857 aa36.74■■■■□ 3.47
PNKP-212ENST00000599454 KDM6BO15054 1643 aa36.69■■■■□ 3.46
PNKP-212ENST00000599454 ABCC2Q92887 1545 aa36.69■■■■□ 3.46
PNKP-212ENST00000599454 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.63■■■■□ 3.45
PNKP-212ENST00000599454 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.62■■■■□ 3.45
PNKP-212ENST00000599454 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
PNKP-212ENST00000599454 DISP1Q96F81 1524 aa36.6■■■■□ 3.45
PNKP-212ENST00000599454 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.58■■■■□ 3.45
PNKP-212ENST00000599454 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.57■■■■□ 3.44
PNKP-212ENST00000599454 UACAQ9BZF9 1416 aa36.56■■■■□ 3.44
PNKP-212ENST00000599454 GLI2P10070 1586 aa36.55■■■■□ 3.44
PNKP-212ENST00000599454 ASXL2Q76L83 1435 aa36.54■■■■□ 3.44
PNKP-212ENST00000599454 KIAA0556O60303 1618 aa36.48■■■■□ 3.43
PNKP-212ENST00000599454 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
PNKP-212ENST00000599454 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.45■■■■□ 3.43
PNKP-212ENST00000599454 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.43■■■■□ 3.42
PNKP-212ENST00000599454 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
PNKP-212ENST00000599454 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.34■■■■□ 3.41
PNKP-212ENST00000599454 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PNKP-212ENST00000599454 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.28■■■■□ 3.4
PNKP-212ENST00000599454 GOLGA3Q08378 1498 aa36.28■■■■□ 3.4
PNKP-212ENST00000599454 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.25■■■■□ 3.39
PNKP-212ENST00000599454 PRXQ9BXM0 1461 aa36.19■■■■□ 3.38
PNKP-212ENST00000599454 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.19■■■■□ 3.38
PNKP-212ENST00000599454 ABCA8O94911 1581 aa36.15■■■■□ 3.38
PNKP-212ENST00000599454 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
PNKP-212ENST00000599454 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.08■■■■□ 3.37
PNKP-212ENST00000599454 ADGRL1O94910 1474 aa36.02■■■■□ 3.36
PNKP-212ENST00000599454 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36■■■■□ 3.35
PNKP-212ENST00000599454 CD109Q6YHK3 1445 aa35.97■■■■□ 3.35
PNKP-212ENST00000599454 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
PNKP-212ENST00000599454 KCNH8Q96L42 1107 aa35.91■■■■□ 3.34
PNKP-212ENST00000599454 SAMD9Q5K651 1589 aa35.85■■■■□ 3.33
PNKP-212ENST00000599454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.83■■■■□ 3.33
PNKP-212ENST00000599454 ATP10BO94823 1461 aa35.8■■■■□ 3.32
PNKP-212ENST00000599454 P3H3Q8IVL6 736 aa35.77■■■■□ 3.32
PNKP-212ENST00000599454 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.75■■■■□ 3.31
PNKP-212ENST00000599454 EEA1Q15075 1411 aa35.74■■■■□ 3.31
PNKP-212ENST00000599454 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.73■■■■□ 3.31
PNKP-212ENST00000599454 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.73■■■■□ 3.31
PNKP-212ENST00000599454 ARID3CA6NKF2 412 aa35.69■■■■□ 3.3
PNKP-212ENST00000599454 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.67■■■■□ 3.3
PNKP-212ENST00000599454 KIF21BO75037 1637 aa35.63■■■■□ 3.29
PNKP-212ENST00000599454 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.6■■■■□ 3.29
PNKP-212ENST00000599454 NEO1Q92859 1461 aa35.56■■■■□ 3.28
PNKP-212ENST00000599454 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PNKP-212ENST00000599454 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
PNKP-212ENST00000599454 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PNKP-212ENST00000599454 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.5■■■■□ 3.27
PNKP-212ENST00000599454 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.47■■■■□ 3.27
PNKP-212ENST00000599454 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PNKP-212ENST00000599454 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.39■■■■□ 3.26
PNKP-212ENST00000599454 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.39■■■■□ 3.26
PNKP-212ENST00000599454 RAPGEF3O95398 923 aa35.39■■■■□ 3.26
PNKP-212ENST00000599454 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.38■■■■□ 3.25
PNKP-212ENST00000599454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.35■■■■□ 3.25
PNKP-212ENST00000599454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PNKP-212ENST00000599454 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.3■■■■□ 3.24
PNKP-212ENST00000599454 RICTORQ6R327 1708 aa35.3■■■■□ 3.24
PNKP-212ENST00000599454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.24
PNKP-212ENST00000599454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
PNKP-212ENST00000599454 PTPRMP28827 1452 aa35.27■■■■□ 3.24
PNKP-212ENST00000599454 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.26■■■■□ 3.23
PNKP-212ENST00000599454 AKNAQ7Z591 1439 aa35.25■■■■□ 3.23
PNKP-212ENST00000599454 FANCAO15360 1455 aa35.25■■■■□ 3.23
PNKP-212ENST00000599454 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.24■■■■□ 3.23
PNKP-212ENST00000599454 MADDQ8WXG6 1647 aa35.18■■■■□ 3.22
PNKP-212ENST00000599454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PNKP-212ENST00000599454 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PNKP-212ENST00000599454 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.16■■■■□ 3.22
PNKP-212ENST00000599454 FMN1Q68DA7 1419 aa35.14■■■■□ 3.22
PNKP-212ENST00000599454 HECW1Q76N89 1606 aa35.13■■■■□ 3.21
PNKP-212ENST00000599454 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
PNKP-212ENST00000599454 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.09■■■■□ 3.21
PNKP-212ENST00000599454 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.07■■■■□ 3.21
PNKP-212ENST00000599454 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.06■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 PLCH2O75038 1416 aa35.06■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.05■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.05■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
PNKP-212ENST00000599454 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.98■■■■□ 3.19
PNKP-212ENST00000599454 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.98■■■■□ 3.19
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