RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
TIMM50-210ENST00000597782 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TIMM50-210ENST00000597782 IGF1RP08069 1367 aa28.91■■■□□ 2.22
TIMM50-210ENST00000597782 CUL7Q14999 1698 aa28.9■■■□□ 2.22
TIMM50-210ENST00000597782 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.88■■■□□ 2.21
TIMM50-210ENST00000597782 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM50-210ENST00000597782 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMM50-210ENST00000597782 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-210ENST00000597782 MAPKBP1O60336 1514 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-210ENST00000597782 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-210ENST00000597782 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM50-210ENST00000597782 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.69■■■□□ 2.18
TIMM50-210ENST00000597782 PTPRGP23470 1445 aa28.67■■■□□ 2.18
TIMM50-210ENST00000597782 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TIMM50-210ENST00000597782 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.61■■■□□ 2.17
TIMM50-210ENST00000597782 IQGAP2Q13576 1575 aa28.59■■■□□ 2.17
TIMM50-210ENST00000597782 DIP2BQ9P265 1576 aa28.59■■■□□ 2.17
TIMM50-210ENST00000597782 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
TIMM50-210ENST00000597782 ABCC2Q92887 1545 aa28.48■■■□□ 2.15
TIMM50-210ENST00000597782 KDM6BO15054 1643 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 UACAQ9BZF9 1416 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 DISP1Q96F81 1524 aa28.39■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 ASXL2Q76L83 1435 aa28.39■■■□□ 2.14
TIMM50-210ENST00000597782 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-210ENST00000597782 TSPOAP1O95153 1857 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM50-210ENST00000597782 KIAA0556O60303 1618 aa28.3■■■□□ 2.12
TIMM50-210ENST00000597782 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM50-210ENST00000597782 GLI2P10070 1586 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM50-210ENST00000597782 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-210ENST00000597782 GOLGA3Q08378 1498 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-210ENST00000597782 PRXQ9BXM0 1461 aa28.26■■■□□ 2.11
TIMM50-210ENST00000597782 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TIMM50-210ENST00000597782 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TIMM50-210ENST00000597782 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TIMM50-210ENST00000597782 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.17■■■□□ 2.1
TIMM50-210ENST00000597782 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.12■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.1■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 EEA1Q15075 1411 aa28.09■■■□□ 2.09
TIMM50-210ENST00000597782 ABCA8O94911 1581 aa28.03■■■□□ 2.08
TIMM50-210ENST00000597782 KCNH8Q96L42 1107 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM50-210ENST00000597782 CD109Q6YHK3 1445 aa27.97■■■□□ 2.07
TIMM50-210ENST00000597782 P3H3Q8IVL6 736 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMM50-210ENST00000597782 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
TIMM50-210ENST00000597782 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM50-210ENST00000597782 ADGRL1O94910 1474 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM50-210ENST00000597782 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.92■■■□□ 2.06
TIMM50-210ENST00000597782 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.91■■■□□ 2.06
TIMM50-210ENST00000597782 ARID3CA6NKF2 412 aa27.9■■■□□ 2.06
TIMM50-210ENST00000597782 KIF21BO75037 1637 aa27.89■■■□□ 2.05
TIMM50-210ENST00000597782 SAMD9Q5K651 1589 aa27.87■■■□□ 2.05
TIMM50-210ENST00000597782 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TIMM50-210ENST00000597782 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TIMM50-210ENST00000597782 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TIMM50-210ENST00000597782 ATP10BO94823 1461 aa27.81■■■□□ 2.04
TIMM50-210ENST00000597782 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.77■■■□□ 2.04
TIMM50-210ENST00000597782 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.75■■■□□ 2.03
TIMM50-210ENST00000597782 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.73■■■□□ 2.03
TIMM50-210ENST00000597782 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM50-210ENST00000597782 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM50-210ENST00000597782 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.68■■■□□ 2.02
TIMM50-210ENST00000597782 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.67■■■□□ 2.02
TIMM50-210ENST00000597782 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TIMM50-210ENST00000597782 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TIMM50-210ENST00000597782 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.62■■■□□ 2.01
TIMM50-210ENST00000597782 NEO1Q92859 1461 aa27.61■■■□□ 2.01
TIMM50-210ENST00000597782 RAPGEF3O95398 923 aa27.54■■■□□ 2
TIMM50-210ENST00000597782 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.53■■■□□ 2
TIMM50-210ENST00000597782 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TIMM50-210ENST00000597782 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.46■■□□□ 1.99
TIMM50-210ENST00000597782 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.44■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 FANCAO15360 1455 aa27.43■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 AKNAQ7Z591 1439 aa27.41■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 FMN1Q68DA7 1419 aa27.4■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
TIMM50-210ENST00000597782 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.38■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 HECW1Q76N89 1606 aa27.38■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 PTPRMP28827 1452 aa27.35■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.34■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.33■■□□□ 1.97
TIMM50-210ENST00000597782 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.32■■□□□ 1.96
TIMM50-210ENST00000597782 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.29■■□□□ 1.96
TIMM50-210ENST00000597782 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.28■■□□□ 1.96
TIMM50-210ENST00000597782 RICTORQ6R327 1708 aa27.28■■□□□ 1.96
TIMM50-210ENST00000597782 PLCH2O75038 1416 aa27.26■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.25■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 MADDQ8WXG6 1647 aa27.24■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.24■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.24■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.24■■□□□ 1.95
TIMM50-210ENST00000597782 CLIP1P30622 1438 aa27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms