RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 JPH4Q96JJ6 628 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-220ENST00000597474 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-220ENST00000597474 CUL7Q14999 1698 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-220ENST00000597474 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 IGF1RP08069 1367 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 MAPKBP1O60336 1514 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 DIP2BQ9P265 1576 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-220ENST00000597474 KIF27Q86VH2 1401 aa22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-220ENST00000597474 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-220ENST00000597474 TSPOAP1O95153 1857 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-220ENST00000597474 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-220ENST00000597474 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-220ENST00000597474 KDM6BO15054 1643 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-220ENST00000597474 IQGAP2Q13576 1575 aa22.78■■□□□ 1.24
FCHO1-220ENST00000597474 PTPRGP23470 1445 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-220ENST00000597474 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-220ENST00000597474 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-220ENST00000597474 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-220ENST00000597474 ABCC2Q92887 1545 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-220ENST00000597474 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-220ENST00000597474 DISP1Q96F81 1524 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-220ENST00000597474 ASXL2Q76L83 1435 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-220ENST00000597474 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 GLI2P10070 1586 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 UACAQ9BZF9 1416 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 KIAA0556O60303 1618 aa22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-220ENST00000597474 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-220ENST00000597474 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-220ENST00000597474 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-220ENST00000597474 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-220ENST00000597474 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-220ENST00000597474 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-220ENST00000597474 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-220ENST00000597474 ADGRL1O94910 1474 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-220ENST00000597474 ABCA8O94911 1581 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-220ENST00000597474 GOLGA3Q08378 1498 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-220ENST00000597474 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-220ENST00000597474 PRXQ9BXM0 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-220ENST00000597474 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-220ENST00000597474 CD109Q6YHK3 1445 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-220ENST00000597474 KCNH8Q96L42 1107 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-220ENST00000597474 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 KIF21BO75037 1637 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 SAMD9Q5K651 1589 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 ATP10BO94823 1461 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 P3H3Q8IVL6 736 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 ARID3CA6NKF2 412 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 FBXO41Q8TF61 875 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-220ENST00000597474 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-220ENST00000597474 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-220ENST00000597474 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-220ENST00000597474 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-220ENST00000597474 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
FCHO1-220ENST00000597474 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 NEO1Q92859 1461 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-220ENST00000597474 RAPGEF3O95398 923 aa21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 EEA1Q15075 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 RICTORQ6R327 1708 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-220ENST00000597474 PTPRMP28827 1452 aa21.89■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 MADDQ8WXG6 1647 aa21.88■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.84■■□□□ 1.09
FCHO1-220ENST00000597474 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 FANCAO15360 1455 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 AKNAQ7Z591 1439 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-220ENST00000597474 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 SOCS7O14512 581 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 HECW1Q76N89 1606 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-220ENST00000597474 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-220ENST00000597474 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-220ENST00000597474 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-220ENST00000597474 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-220ENST00000597474 KIF14Q15058 1648 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms