RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.45■■■■■ 4.87
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BRD4-208ENST00000597315 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.36■■■■■ 4.85
BRD4-208ENST00000597315 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
BRD4-208ENST00000597315 IQGAP2Q13576 1575 aa45.15■■■■■ 4.82
BRD4-208ENST00000597315 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.07■■■■■ 4.81
BRD4-208ENST00000597315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.06■■■■■ 4.8
BRD4-208ENST00000597315 EEA1Q15075 1411 aa45.05■■■■■ 4.8
BRD4-208ENST00000597315 PRXQ9BXM0 1461 aa45.04■■■■■ 4.8
BRD4-208ENST00000597315 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.03■■■■■ 4.8
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BRD4-208ENST00000597315 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.9■■■■■ 4.78
BRD4-208ENST00000597315 PTPRGP23470 1445 aa44.89■■■■■ 4.78
BRD4-208ENST00000597315 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.88■■■■■ 4.78
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BRD4-208ENST00000597315 DISP1Q96F81 1524 aa44.78■■■■■ 4.76
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BRD4-208ENST00000597315 KIAA0556O60303 1618 aa44.69■■■■■ 4.74
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BRD4-208ENST00000597315 UACAQ9BZF9 1416 aa44.55■■■■■ 4.72
BRD4-208ENST00000597315 KIF21BO75037 1637 aa44.53■■■■■ 4.72
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BRD4-208ENST00000597315 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.47■■■■■ 4.71
BRD4-208ENST00000597315 ABCC2Q92887 1545 aa44.47■■■■■ 4.71
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BRD4-208ENST00000597315 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.35■■■■■ 4.69
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BRD4-208ENST00000597315 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.25■■■■■ 4.67
BRD4-208ENST00000597315 DIP2BQ9P265 1576 aa44.24■■■■■ 4.67
BRD4-208ENST00000597315 ASXL2Q76L83 1435 aa44.24■■■■■ 4.67
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BRD4-208ENST00000597315 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.07■■■■■ 4.65
BRD4-208ENST00000597315 ARID3CA6NKF2 412 aa43.98■■■■■ 4.63
BRD4-208ENST00000597315 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.96■■■■■ 4.63
BRD4-208ENST00000597315 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.96■■■■■ 4.63
BRD4-208ENST00000597315 GLI2P10070 1586 aa43.95■■■■■ 4.63
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BRD4-208ENST00000597315 KCNH8Q96L42 1107 aa43.86■■■■■ 4.61
BRD4-208ENST00000597315 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.78■■■■■ 4.6
BRD4-208ENST00000597315 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
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BRD4-208ENST00000597315 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.73■■■■■ 4.59
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BRD4-208ENST00000597315 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.68■■■■■ 4.58
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BRD4-208ENST00000597315 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.61■■■■■ 4.57
BRD4-208ENST00000597315 HECW1Q76N89 1606 aa43.54■■■■■ 4.56
BRD4-208ENST00000597315 CLIP1P30622 1438 aa43.52■■■■■ 4.56
BRD4-208ENST00000597315 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.49■■■■■ 4.55
BRD4-208ENST00000597315 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
BRD4-208ENST00000597315 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
BRD4-208ENST00000597315 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.42■■■■■ 4.54
BRD4-208ENST00000597315 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
BRD4-208ENST00000597315 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.31■■■■■ 4.52
BRD4-208ENST00000597315 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
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BRD4-208ENST00000597315 CEP162Q5TB80 1403 aa43.22■■■■■ 4.51
BRD4-208ENST00000597315 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.22■■■■■ 4.51
BRD4-208ENST00000597315 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.22■■■■■ 4.51
BRD4-208ENST00000597315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.21■■■■■ 4.51
BRD4-208ENST00000597315 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.2■■■■■ 4.51
BRD4-208ENST00000597315 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.54e-7■■■□□ 15.4
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BRD4-208ENST00000597315 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.12■■■■■ 4.49
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BRD4-208ENST00000597315 FANCAO15360 1455 aa43.04■■■■■ 4.48
BRD4-208ENST00000597315 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.03■■■■■ 4.48
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BRD4-208ENST00000597315 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.93■■■■■ 4.46
BRD4-208ENST00000597315 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.91■■■■■ 4.46
BRD4-208ENST00000597315 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
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BRD4-208ENST00000597315 ADGRL1O94910 1474 aa42.81■■■■■ 4.44
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BRD4-208ENST00000597315 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.74■■■■■ 4.43
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