RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
POLR2E-210ENST00000592597 KDM6BO15054 1643 aa27.89■■■□□ 2.05
POLR2E-210ENST00000592597 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
POLR2E-210ENST00000592597 DIP2BQ9P265 1576 aa27.88■■■□□ 2.05
POLR2E-210ENST00000592597 MAPKBP1O60336 1514 aa27.81■■■□□ 2.04
POLR2E-210ENST00000592597 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.79■■■□□ 2.04
POLR2E-210ENST00000592597 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
POLR2E-210ENST00000592597 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.75■■■□□ 2.03
POLR2E-210ENST00000592597 TOP2BQ02880 1626 aa27.74■■■□□ 2.03
POLR2E-210ENST00000592597 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.72■■■□□ 2.03
POLR2E-210ENST00000592597 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
POLR2E-210ENST00000592597 ADGRL1O94910 1474 aa27.57■■■□□ 2
POLR2E-210ENST00000592597 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
POLR2E-210ENST00000592597 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
POLR2E-210ENST00000592597 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.48■■□□□ 1.99
POLR2E-210ENST00000592597 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.46■■□□□ 1.99
POLR2E-210ENST00000592597 PTPRGP23470 1445 aa27.42■■□□□ 1.98
POLR2E-210ENST00000592597 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
POLR2E-210ENST00000592597 ASXL2Q76L83 1435 aa27.39■■□□□ 1.97
POLR2E-210ENST00000592597 CUL7Q14999 1698 aa27.36■■□□□ 1.97
POLR2E-210ENST00000592597 ABCC2Q92887 1545 aa27.35■■□□□ 1.97
POLR2E-210ENST00000592597 GLI2P10070 1586 aa27.34■■□□□ 1.97
POLR2E-210ENST00000592597 IGF1RP08069 1367 aa27.31■■□□□ 1.96
POLR2E-210ENST00000592597 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.31■■□□□ 1.96
POLR2E-210ENST00000592597 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.26■■□□□ 1.95
POLR2E-210ENST00000592597 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.22■■□□□ 1.95
POLR2E-210ENST00000592597 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.21■■□□□ 1.95
POLR2E-210ENST00000592597 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
POLR2E-210ENST00000592597 KIF27Q86VH2 1401 aa27.16■■□□□ 1.94
POLR2E-210ENST00000592597 UACAQ9BZF9 1416 aa27.16■■□□□ 1.94
POLR2E-210ENST00000592597 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.15■■□□□ 1.94
POLR2E-210ENST00000592597 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.13■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 FBXO41Q8TF61 875 aa27.12■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.1■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 IQGAP2Q13576 1575 aa27.09■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.08■■□□□ 1.93
POLR2E-210ENST00000592597 DISP1Q96F81 1524 aa27.06■■□□□ 1.92
POLR2E-210ENST00000592597 KIF21BO75037 1637 aa26.98■■□□□ 1.91
POLR2E-210ENST00000592597 KCNH8Q96L42 1107 aa26.94■■□□□ 1.9
POLR2E-210ENST00000592597 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.93■■□□□ 1.9
POLR2E-210ENST00000592597 CD109Q6YHK3 1445 aa26.9■■□□□ 1.9
POLR2E-210ENST00000592597 KIAA0556O60303 1618 aa26.87■■□□□ 1.89
POLR2E-210ENST00000592597 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.86■■□□□ 1.89
POLR2E-210ENST00000592597 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.86■■□□□ 1.89
POLR2E-210ENST00000592597 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.85■■□□□ 1.89
POLR2E-210ENST00000592597 PTPRMP28827 1452 aa26.78■■□□□ 1.88
POLR2E-210ENST00000592597 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.75■■□□□ 1.87
POLR2E-210ENST00000592597 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.73■■□□□ 1.87
POLR2E-210ENST00000592597 ARID3CA6NKF2 412 aa26.7■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.68■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 ABCA8O94911 1581 aa26.68■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.68■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 RAPGEF3O95398 923 aa26.65■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
POLR2E-210ENST00000592597 MADDQ8WXG6 1647 aa26.63■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.62■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.61■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 HSPA2P54652 639 aa26.59■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.58■■□□□ 1.85
POLR2E-210ENST00000592597 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
POLR2E-210ENST00000592597 GOLGA3Q08378 1498 aa26.54■■□□□ 1.84
POLR2E-210ENST00000592597 ILDR2Q71H61 639 aa26.52■■□□□ 1.84
POLR2E-210ENST00000592597 ATP10BO94823 1461 aa26.49■■□□□ 1.83
POLR2E-210ENST00000592597 P3H3Q8IVL6 736 aa26.49■■□□□ 1.83
POLR2E-210ENST00000592597 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.49■■□□□ 1.83
POLR2E-210ENST00000592597 CERKQ8TCT0 537 aa26.48■■□□□ 1.83
POLR2E-210ENST00000592597 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.47■■□□□ 1.83
POLR2E-210ENST00000592597 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.45■■□□□ 1.82
POLR2E-210ENST00000592597 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.43■■□□□ 1.82
POLR2E-210ENST00000592597 NEO1Q92859 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
POLR2E-210ENST00000592597 SOCS7O14512 581 aa26.38■■□□□ 1.81
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POLR2E-210ENST00000592597 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.33■■□□□ 1.81
POLR2E-210ENST00000592597 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.33■■□□□ 1.81
POLR2E-210ENST00000592597 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
POLR2E-210ENST00000592597 MLECQ14165 292 aa26.31■■□□□ 1.8
POLR2E-210ENST00000592597 RICTORQ6R327 1708 aa26.31■■□□□ 1.8
POLR2E-210ENST00000592597 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.25■■□□□ 1.79
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POLR2E-210ENST00000592597 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.23■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 FANCAO15360 1455 aa26.22■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 AKNAQ7Z591 1439 aa26.22■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.22■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.21■■□□□ 1.79
POLR2E-210ENST00000592597 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.17■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.16■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 SAMD9Q5K651 1589 aa26.14■■□□□ 1.78
POLR2E-210ENST00000592597 STRCQ7RTU9 1775 aa26.13■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.13■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.12■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.12■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.11■■□□□ 1.77
POLR2E-210ENST00000592597 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.1■■□□□ 1.77
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