RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPKBP1O60336 1514 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPNS1-214ENST00000592483 DIP2BQ9P265 1576 aa41.04■■■■■ 4.16
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM6BO15054 1643 aa41■■■■■ 4.15
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP2BQ02880 1626 aa40.97■■■■■ 4.15
CAPNS1-214ENST00000592483 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.96■■■■■ 4.15
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPNS1-214ENST00000592483 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.85■■■■■ 4.13
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPOAP1O95153 1857 aa40.79■■■■■ 4.12
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.6■■■■■ 4.09
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRL1O94910 1474 aa40.52■■■■■ 4.08
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRGP23470 1445 aa40.47■■■■■ 4.07
CAPNS1-214ENST00000592483 GLI2P10070 1586 aa40.4■■■■■ 4.06
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC2Q92887 1545 aa40.39■■■■■ 4.06
CAPNS1-214ENST00000592483 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.39■■■■■ 4.06
CAPNS1-214ENST00000592483 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CAPNS1-214ENST00000592483 ASXL2Q76L83 1435 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-214ENST00000592483 IGF1RP08069 1367 aa40.35■■■■■ 4.05
CAPNS1-214ENST00000592483 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.34■■■■■ 4.05
CAPNS1-214ENST00000592483 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
CAPNS1-214ENST00000592483 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.29■■■■■ 4.04
CAPNS1-214ENST00000592483 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-214ENST00000592483 CUL7Q14999 1698 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPNS1-214ENST00000592483 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPNS1-214ENST00000592483 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.19■■■■■ 4.03
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF27Q86VH2 1401 aa40.18■■■■■ 4.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.13■■■■■ 4.01
CAPNS1-214ENST00000592483 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CAPNS1-214ENST00000592483 UACAQ9BZF9 1416 aa40.11■■■■■ 4.01
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.04■■■■■ 4
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.01■■■■■ 4
CAPNS1-214ENST00000592483 IQGAP2Q13576 1575 aa39.98■■■■□ 3.99
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO41Q8TF61 875 aa39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-214ENST00000592483 DISP1Q96F81 1524 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPNS1-214ENST00000592483 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.77■■■■□ 3.96
CAPNS1-214ENST00000592483 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.72■■■■□ 3.95
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.7■■■■□ 3.95
CAPNS1-214ENST00000592483 CD109Q6YHK3 1445 aa39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-214ENST00000592483 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0556O60303 1618 aa39.62■■■■□ 3.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNH8Q96L42 1107 aa39.57■■■■□ 3.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF21BO75037 1637 aa39.56■■■■□ 3.92
CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.51■■■■□ 3.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRMP28827 1452 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA8O94911 1581 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA3Q08378 1498 aa39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-214ENST00000592483 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEF3O95398 923 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-214ENST00000592483 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.14■■■■□ 3.86
CAPNS1-214ENST00000592483 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 EEA1Q15075 1411 aa39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MADDQ8WXG6 1647 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP10BO94823 1461 aa39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-214ENST00000592483 NEO1Q92859 1461 aa39.06■■■■□ 3.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ARID3CA6NKF2 412 aa39.04■■■■□ 3.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CERKQ8TCT0 537 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPA2P54652 639 aa38.96■■■■□ 3.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.95■■■■□ 3.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-214ENST00000592483 P3H3Q8IVL6 736 aa38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PRXQ9BXM0 1461 aa38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SOCS7O14512 581 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.79■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ILDR2Q71H61 639 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-214ENST00000592483 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RICTORQ6R327 1708 aa38.72■■■■□ 3.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.72■■■■□ 3.79
CAPNS1-214ENST00000592483 FANCAO15360 1455 aa38.71■■■■□ 3.79
CAPNS1-214ENST00000592483 AKNAQ7Z591 1439 aa38.7■■■■□ 3.79
CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD9Q5K651 1589 aa38.59■■■■□ 3.77
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.57■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.57■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.57■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 MLECQ14165 292 aa38.55■■■■□ 3.76
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms