RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592372.5

SLC25A39-215, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 867 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-215ENST00000592372 JPH4Q96JJ6 628 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A39-215ENST00000592372 SHROOM2Q13796 1616 aa28.43■■■□□ 2.14
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SLC25A39-215ENST00000592372 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-215ENST00000592372 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-215ENST00000592372 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-215ENST00000592372 PRXQ9BXM0 1461 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC25A39-215ENST00000592372 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-215ENST00000592372 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SLC25A39-215ENST00000592372 IQGAP2Q13576 1575 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-215ENST00000592372 EEA1Q15075 1411 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-215ENST00000592372 DISP1Q96F81 1524 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-215ENST00000592372 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-215ENST00000592372 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC25A39-215ENST00000592372 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC25A39-215ENST00000592372 PTPRGP23470 1445 aa28.01■■■□□ 2.08
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SLC25A39-215ENST00000592372 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28■■■□□ 2.07
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SLC25A39-215ENST00000592372 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.92■■■□□ 2.06
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SLC25A39-215ENST00000592372 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A39-215ENST00000592372 GOLGA3Q08378 1498 aa27.84■■■□□ 2.05
SLC25A39-215ENST00000592372 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
SLC25A39-215ENST00000592372 P3H3Q8IVL6 736 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC25A39-215ENST00000592372 UACAQ9BZF9 1416 aa27.81■■■□□ 2.04
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SLC25A39-215ENST00000592372 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.77■■■□□ 2.04
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SLC25A39-215ENST00000592372 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.74■■■□□ 2.03
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SLC25A39-215ENST00000592372 ASXL2Q76L83 1435 aa27.6■■■□□ 2.01
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SLC25A39-215ENST00000592372 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.42■■□□□ 1.98
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SLC25A39-215ENST00000592372 CD109Q6YHK3 1445 aa27.2■■□□□ 1.94
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SLC25A39-215ENST00000592372 CEP162Q5TB80 1403 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC25A39-215ENST00000592372 HECW1Q76N89 1606 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC25A39-215ENST00000592372 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.15■■□□□ 1.94
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SLC25A39-215ENST00000592372 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC25A39-215ENST00000592372 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.12■■□□□ 1.93
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SLC25A39-215ENST00000592372 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC25A39-215ENST00000592372 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC25A39-215ENST00000592372 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.07■■□□□ 1.92
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SLC25A39-215ENST00000592372 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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SLC25A39-215ENST00000592372 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
SLC25A39-215ENST00000592372 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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SLC25A39-215ENST00000592372 AKNAQ7Z591 1439 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC25A39-215ENST00000592372 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC25A39-215ENST00000592372 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-215ENST00000592372 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.7■■□□□ 1.87
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