RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF1RP08069 1367 aa45.2■■■■■ 4.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.17■■■■■ 4.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF27Q86VH2 1401 aa45.17■■■■■ 4.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.12■■■■■ 4.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL7Q14999 1698 aa45.09■■■■■ 4.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.03■■■■■ 4.8
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.01■■■■■ 4.8
CAPNS1-211ENST00000590874 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45■■■■■ 4.79
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKBP1O60336 1514 aa45■■■■■ 4.79
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.96■■■■■ 4.79
CAPNS1-211ENST00000590874 DIP2BQ9P265 1576 aa44.89■■■■■ 4.78
CAPNS1-211ENST00000590874 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.88■■■■■ 4.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRGP23470 1445 aa44.75■■■■■ 4.76
CAPNS1-211ENST00000590874 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.66■■■■■ 4.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.66■■■■■ 4.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IQGAP2Q13576 1575 aa44.65■■■■■ 4.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC2Q92887 1545 aa44.56■■■■■ 4.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM6BO15054 1643 aa44.54■■■■■ 4.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DISP1Q96F81 1524 aa44.5■■■■■ 4.71
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPOAP1O95153 1857 aa44.49■■■■■ 4.71
CAPNS1-211ENST00000590874 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.45■■■■■ 4.71
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.45■■■■■ 4.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ASXL2Q76L83 1435 aa44.44■■■■■ 4.7
CAPNS1-211ENST00000590874 UACAQ9BZF9 1416 aa44.41■■■■■ 4.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.39■■■■■ 4.7
CAPNS1-211ENST00000590874 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.37■■■■■ 4.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GLI2P10070 1586 aa44.32■■■■■ 4.69
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0556O60303 1618 aa44.27■■■■■ 4.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.25■■■■■ 4.67
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.25■■■■■ 4.67
CAPNS1-211ENST00000590874 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.07■■■■■ 4.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.05■■■■■ 4.64
CAPNS1-211ENST00000590874 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
CAPNS1-211ENST00000590874 PRXQ9BXM0 1461 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA3Q08378 1498 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.96■■■■■ 4.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA8O94911 1581 aa43.88■■■■■ 4.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRL1O94910 1474 aa43.83■■■■■ 4.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CD109Q6YHK3 1445 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH8Q96L42 1107 aa43.7■■■■■ 4.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.69■■■■■ 4.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.66■■■■■ 4.58
CAPNS1-211ENST00000590874 P3H3Q8IVL6 736 aa43.6■■■■■ 4.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID3CA6NKF2 412 aa43.56■■■■■ 4.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP10BO94823 1461 aa43.52■■■■■ 4.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.51■■■■■ 4.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD9Q5K651 1589 aa43.47■■■■■ 4.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.35■■■■■ 4.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.34■■■■■ 4.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.33■■■■■ 4.53
CAPNS1-211ENST00000590874 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.31■■■■■ 4.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF21BO75037 1637 aa43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EEA1Q15075 1411 aa43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.21■■■■■ 4.51
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.18■■■■■ 4.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
CAPNS1-211ENST00000590874 NEO1Q92859 1461 aa43.13■■■■■ 4.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF3O95398 923 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.03■■■■■ 4.48
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.97■■■■■ 4.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.95■■■■■ 4.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.93■■■■■ 4.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRMP28827 1452 aa42.88■■■■■ 4.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.87■■■■■ 4.456e-24■■□□□ 13
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCAO15360 1455 aa42.82■■■■■ 4.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AKNAQ7Z591 1439 aa42.82■■■■■ 4.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.81■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.8■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.8■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RICTORQ6R327 1708 aa42.78■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MADDQ8WXG6 1647 aa42.74■■■■■ 4.43
CAPNS1-211ENST00000590874 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.71■■■■■ 4.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.66■■■■■ 4.42
CAPNS1-211ENST00000590874 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
CAPNS1-211ENST00000590874 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.6■■■■■ 4.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.6■■■■■ 4.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.58■■■■■ 4.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCH2O75038 1416 aa42.58■■■■■ 4.41
CAPNS1-211ENST00000590874 FMN1Q68DA7 1419 aa42.58■■■■■ 4.41
CAPNS1-211ENST00000590874 HECW1Q76N89 1606 aa42.57■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.54■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.53■■■■■ 4.4
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.52■■■■■ 4.4
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