RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590056.1

KDSR-210, Transcript of 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

TSL 3

Gene KDSR, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSR-210ENST00000590056 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.93■■■■■ 4.62
KDSR-210ENST00000590056 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.93■■■■■ 4.62
KDSR-210ENST00000590056 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.93■■■■■ 4.62
KDSR-210ENST00000590056 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
KDSR-210ENST00000590056 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.73■■■■■ 4.59
KDSR-210ENST00000590056 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.56■■■■■ 4.56
KDSR-210ENST00000590056 IQGAP2Q13576 1575 aa43.54■■■■■ 4.56
KDSR-210ENST00000590056 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.48■■■■■ 4.55
KDSR-210ENST00000590056 PTPRGP23470 1445 aa43.42■■■■■ 4.54
KDSR-210ENST00000590056 PRXQ9BXM0 1461 aa43.42■■■■■ 4.54
KDSR-210ENST00000590056 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.41■■■■■ 4.54
KDSR-210ENST00000590056 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.38■■■■■ 4.53
KDSR-210ENST00000590056 EEA1Q15075 1411 aa43.35■■■■■ 4.53
KDSR-210ENST00000590056 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.31■■■■■ 4.52
KDSR-210ENST00000590056 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
KDSR-210ENST00000590056 DISP1Q96F81 1524 aa43.25■■■■■ 4.51
KDSR-210ENST00000590056 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.22■■■■■ 4.51
KDSR-210ENST00000590056 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.18■■■■■ 4.5
KDSR-210ENST00000590056 GOLGA3Q08378 1498 aa43.15■■■■■ 4.5
KDSR-210ENST00000590056 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.14■■■■■ 4.5
KDSR-210ENST00000590056 MAPKBP1O60336 1514 aa43.13■■■■■ 4.5
KDSR-210ENST00000590056 KIAA0556O60303 1618 aa43.09■■■■■ 4.49
KDSR-210ENST00000590056 UACAQ9BZF9 1416 aa43.09■■■■■ 4.49
KDSR-210ENST00000590056 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.06■■■■■ 4.48
KDSR-210ENST00000590056 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
KDSR-210ENST00000590056 ABCC2Q92887 1545 aa43.03■■■■■ 4.48
KDSR-210ENST00000590056 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.02■■■■■ 4.48
KDSR-210ENST00000590056 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.02■■■■■ 4.48
KDSR-210ENST00000590056 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.9■■■■■ 4.46
KDSR-210ENST00000590056 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.85■■■■■ 4.45
KDSR-210ENST00000590056 DIP2BQ9P265 1576 aa42.84■■■■■ 4.45
KDSR-210ENST00000590056 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.82■■■■■ 4.45
KDSR-210ENST00000590056 ASXL2Q76L83 1435 aa42.8■■■■■ 4.44
KDSR-210ENST00000590056 KIF21BO75037 1637 aa42.79■■■■■ 4.44
KDSR-210ENST00000590056 P3H3Q8IVL6 736 aa42.74■■■■■ 4.43
KDSR-210ENST00000590056 ABCA8O94911 1581 aa42.67■■■■■ 4.42
KDSR-210ENST00000590056 SAMD9Q5K651 1589 aa42.65■■■■■ 4.42
KDSR-210ENST00000590056 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
KDSR-210ENST00000590056 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
KDSR-210ENST00000590056 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
KDSR-210ENST00000590056 GLI2P10070 1586 aa42.6■■■■■ 4.41
KDSR-210ENST00000590056 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
KDSR-210ENST00000590056 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.51■■■■■ 4.4
KDSR-210ENST00000590056 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.48■■■■■ 4.39
KDSR-210ENST00000590056 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.48■■■■■ 4.39
KDSR-210ENST00000590056 TSPOAP1O95153 1857 aa42.44■■■■■ 4.38
KDSR-210ENST00000590056 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.42■■■■■ 4.38
KDSR-210ENST00000590056 KCNH8Q96L42 1107 aa42.38■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 ATP10BO94823 1461 aa42.37■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.36■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 ARID3CA6NKF2 412 aa42.35■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 KDM6BO15054 1643 aa42.32■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.32■■■■■ 4.37
KDSR-210ENST00000590056 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
KDSR-210ENST00000590056 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
KDSR-210ENST00000590056 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.3■■■■■ 4.36
KDSR-210ENST00000590056 CD109Q6YHK3 1445 aa42.22■■■■■ 4.35
KDSR-210ENST00000590056 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
KDSR-210ENST00000590056 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
KDSR-210ENST00000590056 FMN1Q68DA7 1419 aa42.16■■■■■ 4.34
KDSR-210ENST00000590056 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.15■■■■■ 4.34
KDSR-210ENST00000590056 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.13■■■■■ 4.33
KDSR-210ENST00000590056 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.13■■■■■ 4.33
KDSR-210ENST00000590056 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.12■■■■■ 4.33
KDSR-210ENST00000590056 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
KDSR-210ENST00000590056 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
KDSR-210ENST00000590056 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.96■■■■■ 4.31
KDSR-210ENST00000590056 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
KDSR-210ENST00000590056 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.93■■■■■ 4.3
KDSR-210ENST00000590056 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
KDSR-210ENST00000590056 HECW1Q76N89 1606 aa41.9■■■■■ 4.3
KDSR-210ENST00000590056 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
KDSR-210ENST00000590056 CLIP1P30622 1438 aa41.8■■■■■ 4.28
KDSR-210ENST00000590056 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.79■■■■■ 4.28
KDSR-210ENST00000590056 NEO1Q92859 1461 aa41.78■■■■■ 4.28
KDSR-210ENST00000590056 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.72■■■■■ 4.27
KDSR-210ENST00000590056 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
KDSR-210ENST00000590056 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.63■■■■■ 4.25
KDSR-210ENST00000590056 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
KDSR-210ENST00000590056 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.59■■■■■ 4.25
KDSR-210ENST00000590056 FANCAO15360 1455 aa41.58■■■■■ 4.25
KDSR-210ENST00000590056 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.58■■■■■ 4.25
KDSR-210ENST00000590056 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.56■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 AKNAQ7Z591 1439 aa41.55■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 RAPGEF3O95398 923 aa41.55■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 PLCH2O75038 1416 aa41.54■■■■■ 4.24
KDSR-210ENST00000590056 KIF14Q15058 1648 aa41.5■■■■■ 4.23
KDSR-210ENST00000590056 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
KDSR-210ENST00000590056 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.48■■■■■ 4.23
KDSR-210ENST00000590056 CEP162Q5TB80 1403 aa41.46■■■■■ 4.23
KDSR-210ENST00000590056 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.44■■■■■ 4.22
KDSR-210ENST00000590056 ADGRL1O94910 1474 aa41.43■■■■■ 4.22
KDSR-210ENST00000590056 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.35■■■■■ 4.21
KDSR-210ENST00000590056 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.35■■■■■ 4.21
KDSR-210ENST00000590056 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.32■■■■■ 4.21
KDSR-210ENST00000590056 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.31■■■■■ 4.2
KDSR-210ENST00000590056 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.28■■■■■ 4.2
KDSR-210ENST00000590056 RICTORQ6R327 1708 aa41.25■■■■■ 4.19
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