RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589705.1

RUNDC1-202, Transcript of RUN domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene RUNDC1, Length 959 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1-202ENST00000589705 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.82■■■■■ 4.76
RUNDC1-202ENST00000589705 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
RUNDC1-202ENST00000589705 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.75■■■■■ 4.75
RUNDC1-202ENST00000589705 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
RUNDC1-202ENST00000589705 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.48■■■■■ 4.71
RUNDC1-202ENST00000589705 IQGAP2Q13576 1575 aa44.36■■■■■ 4.69
RUNDC1-202ENST00000589705 PRXQ9BXM0 1461 aa44.25■■■■■ 4.67
RUNDC1-202ENST00000589705 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.23■■■■■ 4.67
RUNDC1-202ENST00000589705 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.17■■■■■ 4.66
RUNDC1-202ENST00000589705 PTPRGP23470 1445 aa44.16■■■■■ 4.66
RUNDC1-202ENST00000589705 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.16■■■■■ 4.66
RUNDC1-202ENST00000589705 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.16■■■■■ 4.66
RUNDC1-202ENST00000589705 DISP1Q96F81 1524 aa44.15■■■■■ 4.66
RUNDC1-202ENST00000589705 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.07■■■■■ 4.65
RUNDC1-202ENST00000589705 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.05■■■■■ 4.64
RUNDC1-202ENST00000589705 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.05■■■■■ 4.64
RUNDC1-202ENST00000589705 MAPKBP1O60336 1514 aa44.02■■■■■ 4.64
RUNDC1-202ENST00000589705 EEA1Q15075 1411 aa43.99■■■■■ 4.63
RUNDC1-202ENST00000589705 KIAA0556O60303 1618 aa43.95■■■■■ 4.63
RUNDC1-202ENST00000589705 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.94■■■■■ 4.63
RUNDC1-202ENST00000589705 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
RUNDC1-202ENST00000589705 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.89■■■■■ 4.62
RUNDC1-202ENST00000589705 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.89■■■■■ 4.62
RUNDC1-202ENST00000589705 ABCC2Q92887 1545 aa43.86■■■■■ 4.61
RUNDC1-202ENST00000589705 UACAQ9BZF9 1416 aa43.86■■■■■ 4.61
RUNDC1-202ENST00000589705 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.83■■■■■ 4.61
RUNDC1-202ENST00000589705 GOLGA3Q08378 1498 aa43.83■■■■■ 4.61
RUNDC1-202ENST00000589705 DIP2BQ9P265 1576 aa43.77■■■■■ 4.6
RUNDC1-202ENST00000589705 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.77■■■■■ 4.6
RUNDC1-202ENST00000589705 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.69■■■■■ 4.59
RUNDC1-202ENST00000589705 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
RUNDC1-202ENST00000589705 ASXL2Q76L83 1435 aa43.62■■■■■ 4.57
RUNDC1-202ENST00000589705 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.61■■■■■ 4.57
RUNDC1-202ENST00000589705 KIF21BO75037 1637 aa43.56■■■■■ 4.56
RUNDC1-202ENST00000589705 ABCA8O94911 1581 aa43.55■■■■■ 4.56
RUNDC1-202ENST00000589705 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
RUNDC1-202ENST00000589705 SAMD9Q5K651 1589 aa43.51■■■■■ 4.56
RUNDC1-202ENST00000589705 GLI2P10070 1586 aa43.48■■■■■ 4.55
RUNDC1-202ENST00000589705 P3H3Q8IVL6 736 aa43.44■■■■■ 4.54
RUNDC1-202ENST00000589705 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
RUNDC1-202ENST00000589705 TSPOAP1O95153 1857 aa43.35■■■■■ 4.53
RUNDC1-202ENST00000589705 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.31■■■■■ 4.52
RUNDC1-202ENST00000589705 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
RUNDC1-202ENST00000589705 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.23■■■■■ 4.51
RUNDC1-202ENST00000589705 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
RUNDC1-202ENST00000589705 ATP10BO94823 1461 aa43.2■■■■■ 4.51
RUNDC1-202ENST00000589705 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.19■■■■■ 4.5
RUNDC1-202ENST00000589705 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.18■■■■■ 4.5
RUNDC1-202ENST00000589705 KDM6BO15054 1643 aa43.18■■■■■ 4.5
RUNDC1-202ENST00000589705 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.17■■■■■ 4.5
RUNDC1-202ENST00000589705 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
RUNDC1-202ENST00000589705 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.08■■■■■ 4.49
RUNDC1-202ENST00000589705 ARID3CA6NKF2 412 aa43.05■■■■■ 4.48
RUNDC1-202ENST00000589705 KCNH8Q96L42 1107 aa43.05■■■■■ 4.48
RUNDC1-202ENST00000589705 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
RUNDC1-202ENST00000589705 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.03■■■■■ 4.48
RUNDC1-202ENST00000589705 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43■■■■■ 4.47
RUNDC1-202ENST00000589705 CD109Q6YHK3 1445 aa42.97■■■■■ 4.47
RUNDC1-202ENST00000589705 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.96■■■■■ 4.47
RUNDC1-202ENST00000589705 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.93■■■■■ 4.46
RUNDC1-202ENST00000589705 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
RUNDC1-202ENST00000589705 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
RUNDC1-202ENST00000589705 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
RUNDC1-202ENST00000589705 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.82■■■■■ 4.45
RUNDC1-202ENST00000589705 FMN1Q68DA7 1419 aa42.8■■■■■ 4.44
RUNDC1-202ENST00000589705 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.74■■■■■ 4.43
RUNDC1-202ENST00000589705 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
RUNDC1-202ENST00000589705 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
RUNDC1-202ENST00000589705 HECW1Q76N89 1606 aa42.63■■■■■ 4.41
RUNDC1-202ENST00000589705 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.61■■■■■ 4.41
RUNDC1-202ENST00000589705 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.61■■■■■ 4.41
RUNDC1-202ENST00000589705 NEO1Q92859 1461 aa42.54■■■■■ 4.4
RUNDC1-202ENST00000589705 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
RUNDC1-202ENST00000589705 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.52■■■■■ 4.4
RUNDC1-202ENST00000589705 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
RUNDC1-202ENST00000589705 CLIP1P30622 1438 aa42.45■■■■■ 4.39
RUNDC1-202ENST00000589705 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.44■■■■■ 4.38
RUNDC1-202ENST00000589705 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
RUNDC1-202ENST00000589705 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.43■■■■■ 4.38
RUNDC1-202ENST00000589705 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.43■■■■■ 4.38
RUNDC1-202ENST00000589705 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
RUNDC1-202ENST00000589705 FANCAO15360 1455 aa42.32■■■■■ 4.37
RUNDC1-202ENST00000589705 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
RUNDC1-202ENST00000589705 RAPGEF3O95398 923 aa42.32■■■■■ 4.37
RUNDC1-202ENST00000589705 AKNAQ7Z591 1439 aa42.3■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.3■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 PLCH2O75038 1416 aa42.29■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.29■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 ADGRL1O94910 1474 aa42.28■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.28■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.27■■■■■ 4.36
RUNDC1-202ENST00000589705 KIF14Q15058 1648 aa42.24■■■■■ 4.35
RUNDC1-202ENST00000589705 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
RUNDC1-202ENST00000589705 RICTORQ6R327 1708 aa42.16■■■■■ 4.34
RUNDC1-202ENST00000589705 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.16■■■■■ 4.34
RUNDC1-202ENST00000589705 CEP162Q5TB80 1403 aa42.12■■■■■ 4.33
RUNDC1-202ENST00000589705 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.11■■■■■ 4.33
RUNDC1-202ENST00000589705 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.04■■■■■ 4.32
RUNDC1-202ENST00000589705 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.03■■■■■ 4.32
RUNDC1-202ENST00000589705 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.01■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms