RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-215	ENST00000589485	JPH4	Q96JJ6	628 aa		35.06	■■■■□ 3.2
ILF3-215	ENST00000589485	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	35.03	■■■■□ 3.2
ILF3-215	ENST00000589485	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		35.02	■■■■□ 3.2
ILF3-215	ENST00000589485	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.95	■■■■□ 3.19
ILF3-215	ENST00000589485	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.83	■■■■□ 3.17
ILF3-215	ENST00000589485	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	34.79	■■■■□ 3.16
ILF3-215	ENST00000589485	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.72	■■■■□ 3.15
ILF3-215	ENST00000589485	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		34.71	■■■■□ 3.15
ILF3-215	ENST00000589485	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.7	■■■■□ 3.15
ILF3-215	ENST00000589485	EEA1	Q15075	1411 aa		34.67	■■■■□ 3.14
ILF3-215	ENST00000589485	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.67	■■■■□ 3.14
ILF3-215	ENST00000589485	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.66	■■■■□ 3.14
ILF3-215	ENST00000589485	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.6	■■■■□ 3.13
ILF3-215	ENST00000589485	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		34.6	■■■■□ 3.13
ILF3-215	ENST00000589485	PTPRG	P23470	1445 aa		34.58	■■■■□ 3.13
ILF3-215	ENST00000589485	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	34.58	■■■■□ 3.13
ILF3-215	ENST00000589485	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.58	■■■■□ 3.13
ILF3-215	ENST00000589485	DISP1	Q96F81	1524 aa		34.55	■■■■□ 3.12
ILF3-215	ENST00000589485	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.54	■■■■□ 3.12
ILF3-215	ENST00000589485	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	34.52	■■■■□ 3.12
ILF3-215	ENST00000589485	KIAA0556	O60303	1618 aa		34.5	■■■■□ 3.11
ILF3-215	ENST00000589485	GOLGA3	Q08378	1498 aa		34.43	■■■■□ 3.1
ILF3-215	ENST00000589485	KIF21B	O75037	1637 aa		34.35	■■■■□ 3.09
ILF3-215	ENST00000589485	MAPKBP1	O60336	1514 aa		34.35	■■■■□ 3.09
ILF3-215	ENST00000589485	UACA	Q9BZF9	1416 aa		34.33	■■■■□ 3.09
ILF3-215	ENST00000589485	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		34.31	■■■■□ 3.08
ILF3-215	ENST00000589485	ABCC2	Q92887	1545 aa		34.3	■■■■□ 3.08
ILF3-215	ENST00000589485	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		34.29	■■■■□ 3.08
ILF3-215	ENST00000589485	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		34.21	■■■■□ 3.07
ILF3-215	ENST00000589485	P3H3	Q8IVL6	736 aa		34.2	■■■■□ 3.07
ILF3-215	ENST00000589485	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		34.19	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	34.18	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	SAMD9	Q5K651	1589 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	DIP2B	Q9P265	1576 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		34.16	■■■■□ 3.06
ILF3-215	ENST00000589485	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	34.13	■■■■□ 3.05
ILF3-215	ENST00000589485	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ILF3-215	ENST00000589485	ABCA8	O94911	1581 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ILF3-215	ENST00000589485	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	34.11	■■■■□ 3.05
ILF3-215	ENST00000589485	ASXL2	Q76L83	1435 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ILF3-215	ENST00000589485	TSPOAP1	O95153	1857 aa		34.01	■■■■□ 3.03
ILF3-215	ENST00000589485	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.99	■■■■□ 3.03
ILF3-215	ENST00000589485	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.98	■■■■□ 3.03
ILF3-215	ENST00000589485	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ILF3-215	ENST00000589485	GLI2	P10070	1586 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ILF3-215	ENST00000589485	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
ILF3-215	ENST00000589485	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ILF3-215	ENST00000589485	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ILF3-215	ENST00000589485	ATP10B	O94823	1461 aa		33.82	■■■■□ 3
ILF3-215	ENST00000589485	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.79	■■■■□ 3
ILF3-215	ENST00000589485	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.78	■■■■□ 3
ILF3-215	ENST00000589485	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
ILF3-215	ENST00000589485	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
ILF3-215	ENST00000589485	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
ILF3-215	ENST00000589485	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.76	■■■□□ 2.99
ILF3-215	ENST00000589485	KDM6B	O15054	1643 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ILF3-215	ENST00000589485	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ILF3-215	ENST00000589485	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ILF3-215	ENST00000589485	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.66	■■■□□ 2.98
ILF3-215	ENST00000589485	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ILF3-215	ENST00000589485	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
ILF3-215	ENST00000589485	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ILF3-215	ENST00000589485	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ILF3-215	ENST00000589485	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ILF3-215	ENST00000589485	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
ILF3-215	ENST00000589485	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ILF3-215	ENST00000589485	CLIP1	P30622	1438 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ILF3-215	ENST00000589485	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
ILF3-215	ENST00000589485	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
ILF3-215	ENST00000589485	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ILF3-215	ENST00000589485	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
ILF3-215	ENST00000589485	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ILF3-215	ENST00000589485	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	33.33	■■■□□ 2.93
ILF3-215	ENST00000589485	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	NEO1	Q92859	1461 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ILF3-215	ENST00000589485	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	KIF14	Q15058	1648 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ILF3-215	ENST00000589485	FANCA	O15360	1455 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ILF3-215	ENST00000589485	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ILF3-215	ENST00000589485	AKNA	Q7Z591	1439 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ILF3-215	ENST00000589485	PLCH2	O75038	1416 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ILF3-215	ENST00000589485	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ILF3-215	ENST00000589485	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
ILF3-215	ENST00000589485	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ILF3-215	ENST00000589485	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ILF3-215	ENST00000589485	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ILF3-215	ENST00000589485	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ILF3-215	ENST00000589485	ADGRL1	O94910	1474 aa		33	■■■□□ 2.87
ILF3-215	ENST00000589485	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ILF3-215	ENST00000589485	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.97	■■■□□ 2.87

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