RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588162.1

TXNL4A-208, Transcript of thioredoxin like 4A, human

TSL 2 BASIC

Gene TXNL4A, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNL4A-208	ENST00000588162	NUP160	Q12769	1436 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TXNL4A-208	ENST00000588162	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TXNL4A-208	ENST00000588162	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.05	■■■■■ 4.32
TXNL4A-208	ENST00000588162	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
TXNL4A-208	ENST00000588162	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TXNL4A-208	ENST00000588162	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.91	■■■■■ 4.3
TXNL4A-208	ENST00000588162	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.88	■■■■■ 4.29
TXNL4A-208	ENST00000588162	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TXNL4A-208	ENST00000588162	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.72	■■■■■ 4.27
TXNL4A-208	ENST00000588162	KIF21B	O75037	1637 aa		41.69	■■■■■ 4.27
TXNL4A-208	ENST00000588162	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TXNL4A-208	ENST00000588162	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TXNL4A-208	ENST00000588162	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.54	■■■■■ 4.24
TXNL4A-208	ENST00000588162	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.51	■■■■■ 4.24
TXNL4A-208	ENST00000588162	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.48	■■■■■ 4.23
TXNL4A-208	ENST00000588162	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.47	■■■■■ 4.23
TXNL4A-208	ENST00000588162	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.45	■■■■■ 4.23
TXNL4A-208	ENST00000588162	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.45	■■■■■ 4.23
TXNL4A-208	ENST00000588162	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.42	■■■■■ 4.22
TXNL4A-208	ENST00000588162	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
TXNL4A-208	ENST00000588162	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.4	■■■■■ 4.22
TXNL4A-208	ENST00000588162	MAPKBP1	O60336	1514 aa		41.37	■■■■■ 4.21
TXNL4A-208	ENST00000588162	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TXNL4A-208	ENST00000588162	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TXNL4A-208	ENST00000588162	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.18	■■■■■ 4.18
TXNL4A-208	ENST00000588162	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.13	■■■■■ 4.17
TXNL4A-208	ENST00000588162	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TXNL4A-208	ENST00000588162	KDM6B	O15054	1643 aa		41.1	■■■■■ 4.17
TXNL4A-208	ENST00000588162	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TXNL4A-208	ENST00000588162	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.05	■■■■■ 4.16
TXNL4A-208	ENST00000588162	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
TXNL4A-208	ENST00000588162	DISP1	Q96F81	1524 aa		41	■■■■■ 4.15
TXNL4A-208	ENST00000588162	PTPRG	P23470	1445 aa		40.99	■■■■■ 4.15
TXNL4A-208	ENST00000588162	TSPOAP1	O95153	1857 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TXNL4A-208	ENST00000588162	KIAA0556	O60303	1618 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TXNL4A-208	ENST00000588162	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TXNL4A-208	ENST00000588162	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TXNL4A-208	ENST00000588162	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
TXNL4A-208	ENST00000588162	ABCC2	Q92887	1545 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TXNL4A-208	ENST00000588162	P3H3	Q8IVL6	736 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TXNL4A-208	ENST00000588162	CLIP1	P30622	1438 aa		40.77	■■■■■ 4.12
TXNL4A-208	ENST00000588162	ASXL2	Q76L83	1435 aa		40.77	■■■■■ 4.12
TXNL4A-208	ENST00000588162	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TXNL4A-208	ENST00000588162	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TXNL4A-208	ENST00000588162	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.73	■■■■■ 4.11
TXNL4A-208	ENST00000588162	GLI2	P10070	1586 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TXNL4A-208	ENST00000588162	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.69	■■■■■ 4.1
TXNL4A-208	ENST00000588162	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.69	■■■■■ 4.1
TXNL4A-208	ENST00000588162	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
TXNL4A-208	ENST00000588162	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.65	■■■■■ 4.1
TXNL4A-208	ENST00000588162	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.55	■■■■■ 4.08
TXNL4A-208	ENST00000588162	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.53	■■■■■ 4.08
TXNL4A-208	ENST00000588162	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
TXNL4A-208	ENST00000588162	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.52	■■■■■ 4.08
TXNL4A-208	ENST00000588162	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
TXNL4A-208	ENST00000588162	ABCA8	O94911	1581 aa		40.48	■■■■■ 4.07
TXNL4A-208	ENST00000588162	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
TXNL4A-208	ENST00000588162	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TXNL4A-208	ENST00000588162	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TXNL4A-208	ENST00000588162	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		40.41	■■■■■ 4.06
TXNL4A-208	ENST00000588162	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
TXNL4A-208	ENST00000588162	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
TXNL4A-208	ENST00000588162	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TXNL4A-208	ENST00000588162	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TXNL4A-208	ENST00000588162	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		40.26	■■■■■ 4.03
TXNL4A-208	ENST00000588162	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
TXNL4A-208	ENST00000588162	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
TXNL4A-208	ENST00000588162	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TXNL4A-208	ENST00000588162	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TXNL4A-208	ENST00000588162	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TXNL4A-208	ENST00000588162	ATP10B	O94823	1461 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TXNL4A-208	ENST00000588162	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TXNL4A-208	ENST00000588162	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
TXNL4A-208	ENST00000588162	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
TXNL4A-208	ENST00000588162	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TXNL4A-208	ENST00000588162	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.09	■■■■■ 4.01
TXNL4A-208	ENST00000588162	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.07	■■■■■ 4.01
TXNL4A-208	ENST00000588162	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.07	■■■■■ 4.01
TXNL4A-208	ENST00000588162	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.03	■■■■■ 4
TXNL4A-208	ENST00000588162	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.02	■■■■■ 4
TXNL4A-208	ENST00000588162	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
TXNL4A-208	ENST00000588162	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.01	■■■■■ 4
TXNL4A-208	ENST00000588162	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		39.98	■■■■□ 3.99
TXNL4A-208	ENST00000588162	APLP2	Q06481	763 aa		39.9	■■■■□ 3.98
TXNL4A-208	ENST00000588162	MAP3K1	Q13233	1512 aa		39.81	■■■■□ 3.96
TXNL4A-208	ENST00000588162	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		39.8	■■■■□ 3.96
TXNL4A-208	ENST00000588162	TIAM1	Q13009	1591 aa		39.8	■■■■□ 3.96
TXNL4A-208	ENST00000588162	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	39.76	■■■■□ 3.96
TXNL4A-208	ENST00000588162	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		39.72	■■■■□ 3.95
TXNL4A-208	ENST00000588162	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		39.66	■■■■□ 3.94
TXNL4A-208	ENST00000588162	KIF14	Q15058	1648 aa		39.65	■■■■□ 3.94
TXNL4A-208	ENST00000588162	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		39.65	■■■■□ 3.94
TXNL4A-208	ENST00000588162	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		39.62	■■■■□ 3.93
TXNL4A-208	ENST00000588162	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		39.62	■■■■□ 3.93
TXNL4A-208	ENST00000588162	RAPGEF3	O95398	923 aa		39.57	■■■■□ 3.93
TXNL4A-208	ENST00000588162	PTPRM	P28827	1452 aa		39.56	■■■■□ 3.92
TXNL4A-208	ENST00000588162	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	39.55	■■■■□ 3.92	6e-12	■■■■■ 50.9
TXNL4A-208	ENST00000588162	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.54	■■■■□ 3.92
TXNL4A-208	ENST00000588162	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		39.54	■■■■□ 3.92
TXNL4A-208	ENST00000588162	NEO1	Q92859	1461 aa		39.52	■■■■□ 3.92

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