RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587024.5

SBNO2-204, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SBNO2, Length 4,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-204ENST00000587024 IFT140Q96RY7 1462 aa24.85■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 NEFLP07196 543 aa24.85■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 CEP162Q5TB80 1403 aa24.84■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.84■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 HRCP23327 699 aa24.84■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.83■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 BCANQ96GW7 911 aa24.83■■□□□ 1.57
SBNO2-204ENST00000587024 TOPBP1Q92547 1522 aa24.82■■□□□ 1.56
SBNO2-204ENST00000587024 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SBNO2-204ENST00000587024 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.78■■□□□ 1.56
SBNO2-204ENST00000587024 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SBNO2-204ENST00000587024 GRIN2BQ13224 1484 aa24.76■■□□□ 1.55
SBNO2-204ENST00000587024 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.74■■□□□ 1.55
SBNO2-204ENST00000587024 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.72■■□□□ 1.55
SBNO2-204ENST00000587024 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.553e-6■■□□□ 11.9
SBNO2-204ENST00000587024 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.71■■□□□ 1.55
SBNO2-204ENST00000587024 IGF1RP08069 1367 aa24.7■■□□□ 1.54
SBNO2-204ENST00000587024 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SBNO2-204ENST00000587024 PTPRGP23470 1445 aa24.66■■□□□ 1.54
SBNO2-204ENST00000587024 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SBNO2-204ENST00000587024 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.65■■□□□ 1.54
SBNO2-204ENST00000587024 NEUROD1Q13562 356 aa24.64■■□□□ 1.53
SBNO2-204ENST00000587024 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SBNO2-204ENST00000587024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
SBNO2-204ENST00000587024 CUX1P39880 1505 aa24.57■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 FMN1Q68DA7 1419 aa24.56■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.56■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.52■■□□□ 1.52
SBNO2-204ENST00000587024 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.5■■□□□ 1.51
SBNO2-204ENST00000587024 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SBNO2-204ENST00000587024 SYNJ1O43426 1573 aa24.48■■□□□ 1.51
SBNO2-204ENST00000587024 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.46■■□□□ 1.51
SBNO2-204ENST00000587024 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.46■■□□□ 1.51
SBNO2-204ENST00000587024 MLECQ14165 292 aa24.42■■□□□ 1.5
SBNO2-204ENST00000587024 TOP2BQ02880 1626 aa24.42■■□□□ 1.5
SBNO2-204ENST00000587024 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.39■■□□□ 1.49
SBNO2-204ENST00000587024 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SBNO2-204ENST00000587024 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.34■■□□□ 1.49
SBNO2-204ENST00000587024 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SBNO2-204ENST00000587024 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SBNO2-204ENST00000587024 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.3■■□□□ 1.48
SBNO2-204ENST00000587024 SYNJ2O15056 1496 aa24.26■■□□□ 1.47
SBNO2-204ENST00000587024 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SBNO2-204ENST00000587024 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SBNO2-204ENST00000587024 GGT6Q6P531 493 aa24.22■■□□□ 1.47
SBNO2-204ENST00000587024 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.17■■□□□ 1.46
SBNO2-204ENST00000587024 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SBNO2-204ENST00000587024 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SBNO2-204ENST00000587024 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.13■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.452e-12■■■■■ 41.4
SBNO2-204ENST00000587024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.11■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 GRIN2AQ12879 1464 aa24.1■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.1■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 KANK1Q14678 1352 aa24.1■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 TONSLQ96HA7 1378 aa24.08■■□□□ 1.45
SBNO2-204ENST00000587024 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.07■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.06■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 C14orf37Q86TY3 774 aa24.03■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 PRXQ9BXM0 1461 aa24.03■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 PRDM2Q13029 1718 aa24.02■■□□□ 1.44
SBNO2-204ENST00000587024 RGL3Q3MIN7 710 aa24.01■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 KIF3BO15066 747 aa24.01■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 WDR62O43379 1518 aa24.01■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SBNO2-204ENST00000587024 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.92■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 UACAQ9BZF9 1416 aa23.91■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 CUL7Q14999 1698 aa23.91■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.9■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 IQGAP2Q13576 1575 aa23.89■■□□□ 1.42
SBNO2-204ENST00000587024 KIF21BO75037 1637 aa23.89■■□□□ 1.41
SBNO2-204ENST00000587024 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.88■■□□□ 1.41
SBNO2-204ENST00000587024 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.81■■□□□ 1.4
SBNO2-204ENST00000587024 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.8■■□□□ 1.4
SBNO2-204ENST00000587024 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SBNO2-204ENST00000587024 NUP155O75694 1391 aa23.76■■□□□ 1.39
SBNO2-204ENST00000587024 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SBNO2-204ENST00000587024 PKD2Q13563 968 aa23.72■■□□□ 1.39
SBNO2-204ENST00000587024 AFAP1Q8N556 730 aa23.72■■□□□ 1.39
SBNO2-204ENST00000587024 ARAP1Q96P48 1450 aa23.7■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.68■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.68■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.65■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 RAPGEF3O95398 923 aa23.65■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 POGKQ9P215 609 aa23.65■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 EID1Q9Y6B2 187 aa23.65■■□□□ 1.38
SBNO2-204ENST00000587024 PLEKHG5O94827 1062 aa23.64■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.62■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 CD109Q6YHK3 1445 aa23.62■■□□□ 1.37
SBNO2-204ENST00000587024 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.61■■□□□ 1.37
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