RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586847.1

RBFA-203, Transcript of ribosome binding factor A, humanhuman

TSL 4

Gene RBFA, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFA-203ENST00000586847 IGF1RP08069 1367 aa39.22■■■■□ 3.87
RBFA-203ENST00000586847 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.18■■■■□ 3.86
RBFA-203ENST00000586847 CUL7Q14999 1698 aa39.16■■■■□ 3.86
RBFA-203ENST00000586847 KIF27Q86VH2 1401 aa39.13■■■■□ 3.85
RBFA-203ENST00000586847 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.11■■■■□ 3.85
RBFA-203ENST00000586847 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
RBFA-203ENST00000586847 MAPKBP1O60336 1514 aa39.03■■■■□ 3.84
RBFA-203ENST00000586847 DIP2BQ9P265 1576 aa39.03■■■■□ 3.84
RBFA-203ENST00000586847 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.02■■■■□ 3.84
RBFA-203ENST00000586847 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.96■■■■□ 3.83
RBFA-203ENST00000586847 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.92■■■■□ 3.82
RBFA-203ENST00000586847 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.86■■■■□ 3.81
RBFA-203ENST00000586847 TSPOAP1O95153 1857 aa38.83■■■■□ 3.81
RBFA-203ENST00000586847 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
RBFA-203ENST00000586847 IQGAP2Q13576 1575 aa38.78■■■■□ 3.8
RBFA-203ENST00000586847 PTPRGP23470 1445 aa38.77■■■■□ 3.8
RBFA-203ENST00000586847 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.68■■■■□ 3.78
RBFA-203ENST00000586847 DISP1Q96F81 1524 aa38.68■■■■□ 3.78
RBFA-203ENST00000586847 KDM6BO15054 1643 aa38.67■■■■□ 3.78
RBFA-203ENST00000586847 ABCC2Q92887 1545 aa38.64■■■■□ 3.78
RBFA-203ENST00000586847 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.63■■■■□ 3.78
RBFA-203ENST00000586847 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
RBFA-203ENST00000586847 ASXL2Q76L83 1435 aa38.55■■■■□ 3.76
RBFA-203ENST00000586847 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.54■■■■□ 3.76
RBFA-203ENST00000586847 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.53■■■■□ 3.76
RBFA-203ENST00000586847 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.51■■■■□ 3.76
RBFA-203ENST00000586847 UACAQ9BZF9 1416 aa38.49■■■■□ 3.75
RBFA-203ENST00000586847 KIAA0556O60303 1618 aa38.49■■■■□ 3.75
RBFA-203ENST00000586847 GLI2P10070 1586 aa38.45■■■■□ 3.75
RBFA-203ENST00000586847 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.43■■■■□ 3.74
RBFA-203ENST00000586847 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
RBFA-203ENST00000586847 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.41■■■■□ 3.74
RBFA-203ENST00000586847 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.39■■■■□ 3.74
RBFA-203ENST00000586847 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.38■■■■□ 3.73
RBFA-203ENST00000586847 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
RBFA-203ENST00000586847 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.33■■■■□ 3.73
RBFA-203ENST00000586847 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
RBFA-203ENST00000586847 PRXQ9BXM0 1461 aa38.15■■■■□ 3.7
RBFA-203ENST00000586847 ABCA8O94911 1581 aa38.14■■■■□ 3.7
RBFA-203ENST00000586847 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.12■■■■□ 3.69
RBFA-203ENST00000586847 ADGRL1O94910 1474 aa38.05■■■■□ 3.68
RBFA-203ENST00000586847 GOLGA3Q08378 1498 aa38.04■■■■□ 3.68
RBFA-203ENST00000586847 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.03■■■■□ 3.68
RBFA-203ENST00000586847 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.95■■■■□ 3.67
RBFA-203ENST00000586847 KCNH8Q96L42 1107 aa37.9■■■■□ 3.66
RBFA-203ENST00000586847 CD109Q6YHK3 1445 aa37.87■■■■□ 3.65
RBFA-203ENST00000586847 P3H3Q8IVL6 736 aa37.87■■■■□ 3.65
RBFA-203ENST00000586847 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.87■■■■□ 3.65
RBFA-203ENST00000586847 ARID3CA6NKF2 412 aa37.86■■■■□ 3.65
RBFA-203ENST00000586847 SAMD9Q5K651 1589 aa37.81■■■■□ 3.64
RBFA-203ENST00000586847 ATP10BO94823 1461 aa37.78■■■■□ 3.64
RBFA-203ENST00000586847 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.7■■■■□ 3.63
RBFA-203ENST00000586847 KIF21BO75037 1637 aa37.69■■■■□ 3.62
RBFA-203ENST00000586847 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.67■■■■□ 3.62
RBFA-203ENST00000586847 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.65■■■■□ 3.62
RBFA-203ENST00000586847 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.63■■■■□ 3.62
RBFA-203ENST00000586847 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.58■■■■□ 3.61
RBFA-203ENST00000586847 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
RBFA-203ENST00000586847 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
RBFA-203ENST00000586847 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.54■■■■□ 3.6
RBFA-203ENST00000586847 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
RBFA-203ENST00000586847 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.46■■■■□ 3.59
RBFA-203ENST00000586847 EEA1Q15075 1411 aa37.44■■■■□ 3.58
RBFA-203ENST00000586847 RAPGEF3O95398 923 aa37.41■■■■□ 3.58
RBFA-203ENST00000586847 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
RBFA-203ENST00000586847 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
RBFA-203ENST00000586847 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
RBFA-203ENST00000586847 NEO1Q92859 1461 aa37.36■■■■□ 3.57
RBFA-203ENST00000586847 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.34■■■■□ 3.57
RBFA-203ENST00000586847 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.29■■■■□ 3.56
RBFA-203ENST00000586847 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.27■■■■□ 3.56
RBFA-203ENST00000586847 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.26■■■■□ 3.55
RBFA-203ENST00000586847 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.26■■■■□ 3.554e-8■■■■■ 52.5
RBFA-203ENST00000586847 RICTORQ6R327 1708 aa37.25■■■■□ 3.55
RBFA-203ENST00000586847 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
RBFA-203ENST00000586847 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.23■■■■□ 3.55
RBFA-203ENST00000586847 PTPRMP28827 1452 aa37.2■■■■□ 3.55
RBFA-203ENST00000586847 MADDQ8WXG6 1647 aa37.19■■■■□ 3.54
RBFA-203ENST00000586847 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.19■■■■□ 3.54
RBFA-203ENST00000586847 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.17■■■■□ 3.54
RBFA-203ENST00000586847 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.16■■■■□ 3.54
RBFA-203ENST00000586847 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.15■■■■□ 3.54
RBFA-203ENST00000586847 AKNAQ7Z591 1439 aa37.13■■■■□ 3.53
RBFA-203ENST00000586847 FANCAO15360 1455 aa37.13■■■■□ 3.53
RBFA-203ENST00000586847 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
RBFA-203ENST00000586847 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.08■■■■□ 3.53
RBFA-203ENST00000586847 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
RBFA-203ENST00000586847 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
RBFA-203ENST00000586847 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.02■■■■□ 3.52
RBFA-203ENST00000586847 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.02■■■■□ 3.52
RBFA-203ENST00000586847 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.01■■■■□ 3.51
RBFA-203ENST00000586847 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.98■■■■□ 3.51
RBFA-203ENST00000586847 HECW1Q76N89 1606 aa36.96■■■■□ 3.51
RBFA-203ENST00000586847 KIF14Q15058 1648 aa36.95■■■■□ 3.51
RBFA-203ENST00000586847 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.95■■■■□ 3.5
RBFA-203ENST00000586847 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
RBFA-203ENST00000586847 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.92■■■■□ 3.5
RBFA-203ENST00000586847 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.92■■■■□ 3.5
RBFA-203ENST00000586847 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
RBFA-203ENST00000586847 PLCH2O75038 1416 aa36.9■■■■□ 3.5
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