RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586270.5

H3F3B-202, Transcript of H3 histone family member 3B, humanhuman

TSL 2

Gene H3F3B, Length 468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3B-202ENST00000586270 JPH4Q96JJ6 628 aa41.85■■■■■ 4.29
H3F3B-202ENST00000586270 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
H3F3B-202ENST00000586270 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.8■■■■■ 4.28
H3F3B-202ENST00000586270 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.68■■■■■ 4.26
H3F3B-202ENST00000586270 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
H3F3B-202ENST00000586270 IQGAP2Q13576 1575 aa41.57■■■■■ 4.25
H3F3B-202ENST00000586270 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.45■■■■■ 4.23
H3F3B-202ENST00000586270 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.39■■■■■ 4.22
H3F3B-202ENST00000586270 PRXQ9BXM0 1461 aa41.37■■■■■ 4.21
H3F3B-202ENST00000586270 EEA1Q15075 1411 aa41.34■■■■■ 4.21
H3F3B-202ENST00000586270 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.29■■■■■ 4.2
H3F3B-202ENST00000586270 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.29■■■■■ 4.2
H3F3B-202ENST00000586270 PTPRGP23470 1445 aa41.28■■■■■ 4.2
H3F3B-202ENST00000586270 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
H3F3B-202ENST00000586270 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
H3F3B-202ENST00000586270 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
H3F3B-202ENST00000586270 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.24■■■■■ 4.19
H3F3B-202ENST00000586270 DISP1Q96F81 1524 aa41.21■■■■■ 4.19
H3F3B-202ENST00000586270 KIAA0556O60303 1618 aa41.16■■■■■ 4.18
H3F3B-202ENST00000586270 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.16■■■■■ 4.18
H3F3B-202ENST00000586270 GOLGA3Q08378 1498 aa41.11■■■■■ 4.17
H3F3B-202ENST00000586270 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
H3F3B-202ENST00000586270 MAPKBP1O60336 1514 aa41.06■■■■■ 4.16
H3F3B-202ENST00000586270 UACAQ9BZF9 1416 aa41■■■■■ 4.15
H3F3B-202ENST00000586270 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41■■■■■ 4.15
H3F3B-202ENST00000586270 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.96■■■■■ 4.15
H3F3B-202ENST00000586270 ABCC2Q92887 1545 aa40.96■■■■■ 4.15
H3F3B-202ENST00000586270 KIF21BO75037 1637 aa40.93■■■■■ 4.14
H3F3B-202ENST00000586270 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.9■■■■■ 4.14
H3F3B-202ENST00000586270 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.85■■■■■ 4.13
H3F3B-202ENST00000586270 DIP2BQ9P265 1576 aa40.84■■■■■ 4.13
H3F3B-202ENST00000586270 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.76■■■■■ 4.12
H3F3B-202ENST00000586270 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.75■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 SAMD9Q5K651 1589 aa40.74■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 ASXL2Q76L83 1435 aa40.73■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 P3H3Q8IVL6 736 aa40.72■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 ABCA8O94911 1581 aa40.69■■■■■ 4.11
H3F3B-202ENST00000586270 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
H3F3B-202ENST00000586270 TSPOAP1O95153 1857 aa40.62■■■■■ 4.09
H3F3B-202ENST00000586270 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
H3F3B-202ENST00000586270 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.62■■■■■ 4.09
H3F3B-202ENST00000586270 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.56■■■■■ 4.08
H3F3B-202ENST00000586270 GLI2P10070 1586 aa40.54■■■■■ 4.08
H3F3B-202ENST00000586270 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.49■■■■■ 4.07
H3F3B-202ENST00000586270 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
H3F3B-202ENST00000586270 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.48■■■■■ 4.07
H3F3B-202ENST00000586270 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.48■■■■■ 4.07
H3F3B-202ENST00000586270 ARID3CA6NKF2 412 aa40.39■■■■■ 4.06
H3F3B-202ENST00000586270 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.36■■■■■ 4.05
H3F3B-202ENST00000586270 KDM6BO15054 1643 aa40.35■■■■■ 4.05
H3F3B-202ENST00000586270 ATP10BO94823 1461 aa40.33■■■■■ 4.05
H3F3B-202ENST00000586270 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
H3F3B-202ENST00000586270 KCNH8Q96L42 1107 aa40.3■■■■■ 4.04
H3F3B-202ENST00000586270 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
H3F3B-202ENST00000586270 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
H3F3B-202ENST00000586270 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.26■■■■■ 4.04
H3F3B-202ENST00000586270 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.24■■■■■ 4.03
H3F3B-202ENST00000586270 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
H3F3B-202ENST00000586270 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.19■■■■■ 4.03
H3F3B-202ENST00000586270 FMN1Q68DA7 1419 aa40.17■■■■■ 4.02
H3F3B-202ENST00000586270 CD109Q6YHK3 1445 aa40.16■■■■■ 4.02
H3F3B-202ENST00000586270 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.08■■■■■ 4.01
H3F3B-202ENST00000586270 HECW1Q76N89 1606 aa40.06■■■■■ 4
H3F3B-202ENST00000586270 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.04■■■■■ 4
H3F3B-202ENST00000586270 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
H3F3B-202ENST00000586270 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.03■■■■■ 4
H3F3B-202ENST00000586270 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
H3F3B-202ENST00000586270 CLIP1P30622 1438 aa39.9■■■■□ 3.98
H3F3B-202ENST00000586270 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.98
H3F3B-202ENST00000586270 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
H3F3B-202ENST00000586270 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
H3F3B-202ENST00000586270 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
H3F3B-202ENST00000586270 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.79■■■■□ 3.96
H3F3B-202ENST00000586270 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.77■■■■□ 3.96
H3F3B-202ENST00000586270 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.75■■■■□ 3.957e-11■■□□□ 12.5
H3F3B-202ENST00000586270 NEO1Q92859 1461 aa39.75■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.74■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.73■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.73■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.72■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
H3F3B-202ENST00000586270 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.69■■■■□ 3.94
H3F3B-202ENST00000586270 KIF14Q15058 1648 aa39.66■■■■□ 3.94
H3F3B-202ENST00000586270 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
H3F3B-202ENST00000586270 CEP162Q5TB80 1403 aa39.63■■■■□ 3.93
H3F3B-202ENST00000586270 FANCAO15360 1455 aa39.62■■■■□ 3.93
H3F3B-202ENST00000586270 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.6■■■■□ 3.93
H3F3B-202ENST00000586270 AKNAQ7Z591 1439 aa39.54■■■■□ 3.92
H3F3B-202ENST00000586270 PLCH2O75038 1416 aa39.51■■■■□ 3.92
H3F3B-202ENST00000586270 RAPGEF3O95398 923 aa39.49■■■■□ 3.91
H3F3B-202ENST00000586270 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
H3F3B-202ENST00000586270 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.47■■■■□ 3.91
H3F3B-202ENST00000586270 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.44■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.43■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 ADGRL1O94910 1474 aa39.43■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 RICTORQ6R327 1708 aa39.42■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.41■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.4■■■■□ 3.9
H3F3B-202ENST00000586270 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.32■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms