RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585653.1

ROGDI-202, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 5

Gene ROGDI, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-202ENST00000585653 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.77■■■■■ 5.4
ROGDI-202ENST00000585653 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.76■■■■■ 5.4
ROGDI-202ENST00000585653 EEA1Q15075 1411 aa48.7■■■■■ 5.39
ROGDI-202ENST00000585653 JPH4Q96JJ6 628 aa48.69■■■■■ 5.38
ROGDI-202ENST00000585653 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.66■■■■■ 5.38
ROGDI-202ENST00000585653 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
ROGDI-202ENST00000585653 PRXQ9BXM0 1461 aa48.61■■■■■ 5.37
ROGDI-202ENST00000585653 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.57■■■■■ 5.37
ROGDI-202ENST00000585653 IQGAP2Q13576 1575 aa48.54■■■■■ 5.36
ROGDI-202ENST00000585653 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.49■■■■■ 5.35
ROGDI-202ENST00000585653 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
ROGDI-202ENST00000585653 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.29■■■■■ 5.32
ROGDI-202ENST00000585653 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.25■■■■■ 5.31
ROGDI-202ENST00000585653 KIF21BO75037 1637 aa48.21■■■■■ 5.31
ROGDI-202ENST00000585653 DISP1Q96F81 1524 aa48.12■■■■■ 5.29
ROGDI-202ENST00000585653 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.09■■■■■ 5.29
ROGDI-202ENST00000585653 KIAA0556O60303 1618 aa48.07■■■■■ 5.29
ROGDI-202ENST00000585653 PTPRGP23470 1445 aa48.05■■■■■ 5.28
ROGDI-202ENST00000585653 GOLGA3Q08378 1498 aa48.04■■■■■ 5.28
ROGDI-202ENST00000585653 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.92■■■■■ 5.26
ROGDI-202ENST00000585653 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.91■■■■■ 5.26
ROGDI-202ENST00000585653 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.24
ROGDI-202ENST00000585653 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
ROGDI-202ENST00000585653 SAMD9Q5K651 1589 aa47.76■■■■■ 5.24
ROGDI-202ENST00000585653 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
ROGDI-202ENST00000585653 UACAQ9BZF9 1416 aa47.73■■■■■ 5.23
ROGDI-202ENST00000585653 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.72■■■■■ 5.23
ROGDI-202ENST00000585653 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.71■■■■■ 5.23
ROGDI-202ENST00000585653 ABCC2Q92887 1545 aa47.68■■■■■ 5.22
ROGDI-202ENST00000585653 MAPKBP1O60336 1514 aa47.62■■■■■ 5.21
ROGDI-202ENST00000585653 P3H3Q8IVL6 736 aa47.6■■■■■ 5.21
ROGDI-202ENST00000585653 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
ROGDI-202ENST00000585653 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.58■■■■■ 5.21
ROGDI-202ENST00000585653 ABCA8O94911 1581 aa47.53■■■■■ 5.2
ROGDI-202ENST00000585653 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.52■■■■■ 5.2
ROGDI-202ENST00000585653 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.46■■■■■ 5.19
ROGDI-202ENST00000585653 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.46■■■■■ 5.19
ROGDI-202ENST00000585653 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
ROGDI-202ENST00000585653 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.4■■■■■ 5.18
ROGDI-202ENST00000585653 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.37■■■■■ 5.17
ROGDI-202ENST00000585653 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.34■■■■■ 5.17
ROGDI-202ENST00000585653 DIP2BQ9P265 1576 aa47.32■■■■■ 5.17
ROGDI-202ENST00000585653 ASXL2Q76L83 1435 aa47.3■■■■■ 5.16
ROGDI-202ENST00000585653 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.26■■■■■ 5.16
ROGDI-202ENST00000585653 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.24■■■■■ 5.15
ROGDI-202ENST00000585653 FMN1Q68DA7 1419 aa47.12■■■■■ 5.13
ROGDI-202ENST00000585653 ATP10BO94823 1461 aa47.09■■■■■ 5.13
ROGDI-202ENST00000585653 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.09■■■■■ 5.13
ROGDI-202ENST00000585653 GLI2P10070 1586 aa47.09■■■■■ 5.13
ROGDI-202ENST00000585653 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
ROGDI-202ENST00000585653 ARID3CA6NKF2 412 aa47.04■■■■■ 5.12
ROGDI-202ENST00000585653 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
ROGDI-202ENST00000585653 TSPOAP1O95153 1857 aa47.03■■■■■ 5.12
ROGDI-202ENST00000585653 CLIP1P30622 1438 aa47■■■■■ 5.11
ROGDI-202ENST00000585653 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.1
ROGDI-202ENST00000585653 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
ROGDI-202ENST00000585653 HECW1Q76N89 1606 aa46.94■■■■■ 5.1
ROGDI-202ENST00000585653 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.89■■■■■ 5.1
ROGDI-202ENST00000585653 KCNH8Q96L42 1107 aa46.84■■■■■ 5.09
ROGDI-202ENST00000585653 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.82■■■■■ 5.09
ROGDI-202ENST00000585653 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.81■■■■■ 5.08
ROGDI-202ENST00000585653 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
ROGDI-202ENST00000585653 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
ROGDI-202ENST00000585653 CEP162Q5TB80 1403 aa46.78■■■■■ 5.08
ROGDI-202ENST00000585653 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
ROGDI-202ENST00000585653 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
ROGDI-202ENST00000585653 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.73■■■■■ 5.07
ROGDI-202ENST00000585653 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.71■■■■■ 5.07
ROGDI-202ENST00000585653 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.69■■■■■ 5.06
ROGDI-202ENST00000585653 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.67■■■■■ 5.06
ROGDI-202ENST00000585653 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.66■■■■■ 5.06
ROGDI-202ENST00000585653 CD109Q6YHK3 1445 aa46.65■■■■■ 5.06
ROGDI-202ENST00000585653 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.63■■■■■ 5.06
ROGDI-202ENST00000585653 KDM6BO15054 1643 aa46.61■■■■■ 5.05
ROGDI-202ENST00000585653 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
ROGDI-202ENST00000585653 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.58■■■■■ 5.05
ROGDI-202ENST00000585653 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.58■■■■■ 5.05
ROGDI-202ENST00000585653 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.42■■■■■ 5.02
ROGDI-202ENST00000585653 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.39■■■■■ 5.02
ROGDI-202ENST00000585653 KIF14Q15058 1648 aa46.36■■■■■ 5.01
ROGDI-202ENST00000585653 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.36■■■■■ 5.01
ROGDI-202ENST00000585653 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.26■■■■■ 5
ROGDI-202ENST00000585653 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.25■■■■■ 5
ROGDI-202ENST00000585653 NEO1Q92859 1461 aa46.25■■■■■ 5
ROGDI-202ENST00000585653 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.24■■■■■ 4.99
ROGDI-202ENST00000585653 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.24■■■■■ 4.99
ROGDI-202ENST00000585653 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
ROGDI-202ENST00000585653 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.18■■■■■ 4.98
ROGDI-202ENST00000585653 FANCAO15360 1455 aa46.13■■■■■ 4.98
ROGDI-202ENST00000585653 PLCH2O75038 1416 aa46.13■■■■■ 4.98
ROGDI-202ENST00000585653 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.06■■■■■ 4.96
ROGDI-202ENST00000585653 AKNAQ7Z591 1439 aa46.04■■■■■ 4.96
ROGDI-202ENST00000585653 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.02■■■■■ 4.96
ROGDI-202ENST00000585653 TIAM1Q13009 1591 aa46■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 PREX2Q70Z35 1606 aa45.99■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.98■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.97■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.97■■■■■ 4.95
ROGDI-202ENST00000585653 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms