RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585606.5

GIPC1-204, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene GIPC1, Length 2,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-204ENST00000585606 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-204ENST00000585606 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-204ENST00000585606 P3H3Q8IVL6 736 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-204ENST00000585606 TIAM1Q13009 1591 aa29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-204ENST00000585606 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GIPC1-204ENST00000585606 WDR62O43379 1518 aa29.19■■■□□ 2.26
GIPC1-204ENST00000585606 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.17■■■□□ 2.26
GIPC1-204ENST00000585606 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
GIPC1-204ENST00000585606 PBRM1Q86U86 1689 aa29.14■■■□□ 2.26
GIPC1-204ENST00000585606 IFT140Q96RY7 1462 aa29.14■■■□□ 2.26
GIPC1-204ENST00000585606 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.11■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.1■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 GRIN2BQ13224 1484 aa29.09■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 SAMD9Q5K651 1589 aa29.08■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.08■■■□□ 2.25
GIPC1-204ENST00000585606 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.06■■■□□ 2.24
GIPC1-204ENST00000585606 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.05■■■□□ 2.24
GIPC1-204ENST00000585606 FMN1Q68DA7 1419 aa29.05■■■□□ 2.24
GIPC1-204ENST00000585606 ADAMTS12P58397 1594 aa29.04■■■□□ 2.24
GIPC1-204ENST00000585606 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-204ENST00000585606 ERCC6Q03468 1493 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-204ENST00000585606 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-204ENST00000585606 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GIPC1-204ENST00000585606 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
GIPC1-204ENST00000585606 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.92■■■□□ 2.22
GIPC1-204ENST00000585606 IQGAP2Q13576 1575 aa28.88■■■□□ 2.21
GIPC1-204ENST00000585606 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GIPC1-204ENST00000585606 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GIPC1-204ENST00000585606 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.81■■■□□ 2.2
GIPC1-204ENST00000585606 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.79■■■□□ 2.2
GIPC1-204ENST00000585606 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.78■■■□□ 2.2
GIPC1-204ENST00000585606 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.76■■■□□ 2.2
GIPC1-204ENST00000585606 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-204ENST00000585606 ITGAEP38570 1179 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-204ENST00000585606 GRIN2AQ12879 1464 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-204ENST00000585606 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GIPC1-204ENST00000585606 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.71■■■□□ 2.19
GIPC1-204ENST00000585606 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
GIPC1-204ENST00000585606 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.65■■■□□ 2.18
GIPC1-204ENST00000585606 SYNJ2O15056 1496 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-204ENST00000585606 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.64■■■□□ 2.18
GIPC1-204ENST00000585606 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.64■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 DISP1Q96F81 1524 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.63■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 HECW1Q76N89 1606 aa28.62■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 NCOA2Q15596 1464 aa28.6■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 KIAA0556O60303 1618 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-204ENST00000585606 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 ARHGEF11O15085 1522 aa28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 CEP170Q5SW79 1584 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-204ENST00000585606 NUP160Q12769 1436 aa28.51■■■□□ 2.15
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GIPC1-204ENST00000585606 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
GIPC1-204ENST00000585606 FBLN2P98095 1184 aa28.46■■■□□ 2.15
GIPC1-204ENST00000585606 PTPRKQ15262 1439 aa28.42■■■□□ 2.14
GIPC1-204ENST00000585606 MAPKBP1O60336 1514 aa28.41■■■□□ 2.14
GIPC1-204ENST00000585606 JPH4Q96JJ6 628 aa28.41■■■□□ 2.14
GIPC1-204ENST00000585606 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
GIPC1-204ENST00000585606 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.39■■■□□ 2.14
GIPC1-204ENST00000585606 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.39■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 HFM1A2PYH4 1435 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 MIA2Q96PC5 1412 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 ARID3CA6NKF2 412 aa28.33■■■□□ 2.13
GIPC1-204ENST00000585606 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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GIPC1-204ENST00000585606 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.25■■■□□ 2.11
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GIPC1-204ENST00000585606 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.16■■■□□ 2.1
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GIPC1-204ENST00000585606 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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GIPC1-204ENST00000585606 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.09■■■□□ 2.09
GIPC1-204ENST00000585606 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.09■■■□□ 2.09
GIPC1-204ENST00000585606 NEUROD1Q13562 356 aa28.07■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.07■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 ATP10BO94823 1461 aa28.05■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 DAPK1P53355 1430 aa28.04■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 ABCC5O15440 1437 aa28.03■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 PTPRGP23470 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 ROCK1Q13464 1354 aa28.02■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GIPC1-204ENST00000585606 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28■■■□□ 2.07
GIPC1-204ENST00000585606 SHROOM2Q13796 1616 aa28■■■□□ 2.07
GIPC1-204ENST00000585606 KIF14Q15058 1648 aa27.99■■■□□ 2.07
GIPC1-204ENST00000585606 MIER1Q8N108 512 aa27.99■■■□□ 2.07
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