RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584460.5

GPS1-224, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPS1, Length 1,855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-224ENST00000584460 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.7■■□□□ 1.7
GPS1-224ENST00000584460 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.68■■□□□ 1.7
GPS1-224ENST00000584460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.68■■□□□ 1.7
GPS1-224ENST00000584460 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GPS1-224ENST00000584460 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GPS1-224ENST00000584460 GRIN2AQ12879 1464 aa25.53■■□□□ 1.68
GPS1-224ENST00000584460 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.52■■□□□ 1.68
GPS1-224ENST00000584460 SYNJ2O15056 1496 aa25.51■■□□□ 1.67
GPS1-224ENST00000584460 SAMD9Q5K651 1589 aa25.47■■□□□ 1.67
GPS1-224ENST00000584460 IQGAP2Q13576 1575 aa25.46■■□□□ 1.67
GPS1-224ENST00000584460 P3H3Q8IVL6 736 aa25.43■■□□□ 1.66
GPS1-224ENST00000584460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GPS1-224ENST00000584460 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.42■■□□□ 1.66
GPS1-224ENST00000584460 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.41■■□□□ 1.66
GPS1-224ENST00000584460 CEP170Q5SW79 1584 aa25.4■■□□□ 1.66
GPS1-224ENST00000584460 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.36■■□□□ 1.65
GPS1-224ENST00000584460 NUP160Q12769 1436 aa25.35■■□□□ 1.65
GPS1-224ENST00000584460 FBLN2P98095 1184 aa25.35■■□□□ 1.65
GPS1-224ENST00000584460 APLP2Q06481 763 aa25.33■■□□□ 1.65
GPS1-224ENST00000584460 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
GPS1-224ENST00000584460 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GPS1-224ENST00000584460 CHD1O14646 1710 aa25.31■■□□□ 1.64
GPS1-224ENST00000584460 FMN1Q68DA7 1419 aa25.27■■□□□ 1.64
GPS1-224ENST00000584460 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.24■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 MAP3K1Q13233 1512 aa25.24■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 DISP1Q96F81 1524 aa25.24■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.23■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 TIAM1Q13009 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 KIAA0556O60303 1618 aa25.22■■□□□ 1.63
GPS1-224ENST00000584460 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GPS1-224ENST00000584460 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.19■■□□□ 1.62
GPS1-224ENST00000584460 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.17■■□□□ 1.62
GPS1-224ENST00000584460 JPH4Q96JJ6 628 aa25.15■■□□□ 1.62
GPS1-224ENST00000584460 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GPS1-224ENST00000584460 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
GPS1-224ENST00000584460 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.04■■□□□ 1.6
GPS1-224ENST00000584460 SHROOM2Q13796 1616 aa25.03■■□□□ 1.6
GPS1-224ENST00000584460 HECW1Q76N89 1606 aa25.03■■□□□ 1.6
GPS1-224ENST00000584460 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.99■■□□□ 1.59
GPS1-224ENST00000584460 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
GPS1-224ENST00000584460 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.97■■□□□ 1.59
GPS1-224ENST00000584460 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
GPS1-224ENST00000584460 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
GPS1-224ENST00000584460 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.91■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.9■■□□□ 1.58
GPS1-224ENST00000584460 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.88■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 ABCA8O94911 1581 aa24.87■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.86■■□□□ 1.57
GPS1-224ENST00000584460 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.82■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 ARID3CA6NKF2 412 aa24.81■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 PTPRGP23470 1445 aa24.81■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 ARHGEF11O15085 1522 aa24.78■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 NCOA2Q15596 1464 aa24.78■■□□□ 1.56
GPS1-224ENST00000584460 ATP10BO94823 1461 aa24.7■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 OSCARQ8IYS5 282 aa24.68■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.68■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 UACAQ9BZF9 1416 aa24.68■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GPS1-224ENST00000584460 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.62■■□□□ 1.53
GPS1-224ENST00000584460 ABCC2Q92887 1545 aa24.62■■□□□ 1.53
GPS1-224ENST00000584460 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GPS1-224ENST00000584460 KIF14Q15058 1648 aa24.58■■□□□ 1.53
GPS1-224ENST00000584460 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.58■■□□□ 1.53
GPS1-224ENST00000584460 ITGAEP38570 1179 aa24.57■■□□□ 1.52
GPS1-224ENST00000584460 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.56■■□□□ 1.52
GPS1-224ENST00000584460 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.54■■□□□ 1.52
GPS1-224ENST00000584460 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GPS1-224ENST00000584460 MIA2Q96PC5 1412 aa24.53■■□□□ 1.52
GPS1-224ENST00000584460 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.48■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.48■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.46■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 PTPRKQ15262 1439 aa24.46■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GPS1-224ENST00000584460 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.45■■□□□ 1.5
GPS1-224ENST00000584460 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.39■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.36■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.34■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.33■■□□□ 1.49
GPS1-224ENST00000584460 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
GPS1-224ENST00000584460 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.32■■□□□ 1.48
GPS1-224ENST00000584460 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.31■■□□□ 1.48
GPS1-224ENST00000584460 PREX2Q70Z35 1606 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms